More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cla_0643 on replicon NC_012039
Organism: Campylobacter lari RM2100



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012039  Cla_0643  ABC transporter, permease protein  100 
 
 		 221 aa  429  1e-119  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.766537  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1239  ABC transporter, permease protein  68.69 
 
 		 303 aa  249  3e-65  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0864  ABC transporter, permease protein  68.22 
 
 		 303 aa  247  9e-65  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.586541  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0794  ABC transporter, permease protein  68.22 
 
 		 303 aa  246  1e-64  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.485222  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0968  D-methionine transport system permease protein MetI  65.24 
 
 		 213 aa  243  9.999999999999999e-64  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1074  D-methionine transport system permease protein MetI  64.15 
 
 		 224 aa  241  7.999999999999999e-63  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1249  putative ABC transporter, permease protein  64.15 
 
 		 224 aa  240  1e-62  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0359  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  59.15 
 
 		 226 aa  212  2.9999999999999995e-54  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0890  ABC transporter, permease protein  46.67 
 
 		 226 aa  204  7e-52  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1541  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  52.94 
 
 		 235 aa  204  1e-51  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.104084  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2018  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  42.67 
 
 		 224 aa  194  1e-48  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000000000432369 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1234  D-methionine transport system permease protein MetI  55.71 
 
 		 223 aa  192  3e-48  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1486  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  46.67 
 
 		 225 aa  189  2.9999999999999997e-47  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000286975  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1770  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  50 
 
 		 217 aa  188  5.999999999999999e-47  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.0000122974  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2653  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  52.53 
 
 		 224 aa  184  6e-46  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01201  hypothetical protein  53.88 
 
 		 225 aa  185  6e-46  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004239  methionine ABC transporter permease protein  51.42 
 
 		 225 aa  184  7e-46  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_08270  ABC-type metal ion transport system, permease component  43.08 
 
 		 225 aa  183  1.0000000000000001e-45  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.154439  normal  0.55012 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0887  D-methionine transport system permease protein MetI  51.42 
 
 		 225 aa  181  8.000000000000001e-45  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22290  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  50 
 
 		 223 aa  181  1e-44  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1772  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.46 
 
 		 222 aa  174  7e-43  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.918282  hitchhiker  0.000827956 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0428  ABC transporter, permease protein  51.21 
 
 		 225 aa  174  9e-43  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4307  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  46.52 
 
 		 224 aa  173  1.9999999999999998e-42  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0869  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  40.48 
 
 		 215 aa  172  3.9999999999999995e-42  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.771315  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_19580  ABC-type metal ion transport system, permease component  47.8 
 
 		 222 aa  170  2e-41  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000846519 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3537  ABC transporter substrate binding inner membrane protein  49.24 
 
 		 228 aa  170  2e-41  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.0228117 
 
 
-
 
NC_009431  Rsph17025_4332  hypothetical protein  46.24 
 
 		 224 aa  169  3e-41  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.362545  normal  0.101939 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2418  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  43.26 
 
 		 223 aa  169  3e-41  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0130  ABC D-methionine uptake transporter, inner membrane subunit  46.24 
 
 		 224 aa  169  4e-41  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.140263  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1767  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  46.24 
 
 		 224 aa  169  4e-41  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0577553  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1396  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  39.71 
 
 		 222 aa  168  7e-41  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2537  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  46.7 
 
 		 221 aa  166  2e-40  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  hitchhiker  0.00567563  normal  0.226034 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0175  ABC transporter permease  43.89 
 
 		 222 aa  166  2.9999999999999998e-40  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.713408  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0194  ABC transporter, permease protein  43.89 
 
 		 222 aa  166  2.9999999999999998e-40  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0173  ABC transporter permease  43.89 
 
 		 222 aa  166  2.9999999999999998e-40  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.560116  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1556  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  40.95 
 
 		 236 aa  166  2.9999999999999998e-40  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0858  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  39.13 
 
 		 222 aa  163  2.0000000000000002e-39  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2987  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  41.98 
 
 		 217 aa  162  3e-39  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.626863  hitchhiker  0.00236834 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0165  ABC transporter, permease  42.99 
 
 		 222 aa  162  4.0000000000000004e-39  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0535  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  46.19 
 
 		 222 aa  162  4.0000000000000004e-39  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1394  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  44.55 
 
 		 221 aa  161  7e-39  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0196  D-methionine ABC transporter, permease protein  45.88 
 
 		 218 aa  161  8.000000000000001e-39  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2000  methionine transport system permease protein  45.88 
 
 		 218 aa  161  8.000000000000001e-39  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.445077  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0962  ABC transporter, permease protein  44.08 
 
 		 221 aa  160  1e-38  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.496997  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0903  ABC transporter, permease protein  44.08 
 
 		 221 aa  160  1e-38  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.840539  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1438  ABC transporter, permease protein  42.58 
 
 		 218 aa  159  2e-38  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.455899  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1513  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  43.4 
 
 		 221 aa  160  2e-38  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1868  ABC transporter, permease protein  42.58 
 
 		 218 aa  159  2e-38  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.326462  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0547  methionine ABC transporter permease  42.58 
 
 		 218 aa  159  2e-38  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.460496  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0859  methionine ABC transporter permease  42.58 
 
 		 218 aa  159  2e-38  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0449  methionine ABC transporter permease  42.58 
 
 		 218 aa  159  2e-38  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.800882  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2344  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  43.4 
 
 		 221 aa  160  2e-38  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.251109  normal  1 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_2175  methionine ABC transporter permease  42.58 
 
 		 218 aa  159  2e-38  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2366  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  43.63 
 
 		 217 aa  158  5e-38  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0812331  hitchhiker  0.00268015 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4540  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  45 
 
 		 218 aa  158  6e-38  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.141892  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0760  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  41.04 
 
 		 217 aa  158  7e-38  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0854  ABC methionine transporter, inner membrane subunit  45 
 
 		 218 aa  157  9e-38  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0225125  hitchhiker  0.00619599 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0862  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  43.06 
 
 		 217 aa  157  9e-38  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0565276  normal  0.49182 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0252  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  44.9 
 
 		 225 aa  157  9e-38  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.302856  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0996  ABC methionine transporter, inner membrane subunit  46.51 
 
 		 217 aa  157  1e-37  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3501  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.97 
 
 		 227 aa  157  1e-37  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3514  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.97 
 
 		 227 aa  157  1e-37  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0791  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  43.06 
 
 		 217 aa  157  1e-37  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.302745  normal  0.367632 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3574  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.97 
 
 		 227 aa  157  1e-37  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.129763 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3885  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.62 
 
 		 227 aa  157  1e-37  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.199051 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0159  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  42.53 
 
 		 222 aa  156  2e-37  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2124  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  46.51 
 
 		 226 aa  156  2e-37  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1144  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  44.55 
 
 		 228 aa  156  3e-37  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5128  ABC transporter, permease protein  42.53 
 
 		 222 aa  155  3e-37  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3790  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  44.06 
 
 		 230 aa  155  4e-37  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.481635  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3173  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  41.98 
 
 		 221 aa  155  4e-37  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.571471  hitchhiker  0.00153184 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2431  ABC metal ion transporter, inner membrane subunit  47.72 
 
 		 237 aa  155  4e-37  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0101713  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0921  transmembrane ABC transporter protein  42.11 
 
 		 217 aa  155  5.0000000000000005e-37  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.773713  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0197  ABC transporter, permease protein  42.53 
 
 		 222 aa  155  6e-37  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0195  ABC transporter, permease protein  42.53 
 
 		 222 aa  155  6e-37  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00533098  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2552  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  46.33 
 
 		 217 aa  154  7e-37  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4490  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  44.83 
 
 		 221 aa  154  7e-37  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.167219  normal  0.0252468 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0217  ABC transporter, permease protein  42.53 
 
 		 222 aa  154  7e-37  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_16990  ABC-type metal ion transport system, permease component  45.05 
 
 		 217 aa  154  1e-36  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.126358  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3394  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  41.86 
 
 		 218 aa  154  1e-36  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.393989  normal  1 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1055  ABC-type metal ion transport system, permease component  40.49 
 
 		 228 aa  154  1e-36  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.0162881  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1019  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  47.67 
 
 		 217 aa  153  2e-36  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4173  ABC metal ion transporter, inner membrane subunit  47.09 
 
 		 217 aa  153  2e-36  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.325664  normal  0.434406 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0581  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  47.67 
 
 		 217 aa  153  2e-36  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.713567  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2244  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  47.67 
 
 		 217 aa  153  2e-36  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.260973  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1060  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  47.67 
 
 		 217 aa  153  2e-36  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0806  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  42.31 
 
 		 246 aa  152  2.9999999999999998e-36  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.602881 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_34260  putative permease of ABC transporter  40.87 
 
 		 217 aa  152  4e-36  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.0163975 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2911  ABC transporter permease  40.87 
 
 		 217 aa  152  4e-36  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.144856  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2456  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  46.92 
 
 		 220 aa  152  5e-36  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0413  D-methionine ABC transporter, permease protein  47.09 
 
 		 217 aa  152  5e-36  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7231  ABC transporter membrane spanning protein  44.76 
 
 		 213 aa  152  5e-36  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.238623  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1651  D-methionine ABC transporter, permease protein  47.09 
 
 		 217 aa  152  5e-36  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1771  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  42.72 
 
 		 221 aa  152  5e-36  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2930  D-methionine ABC transporter, permease protein  47.09 
 
 		 217 aa  152  5e-36  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2869  D-methionine ABC transporter, permease protein  47.09 
 
 		 217 aa  152  5e-36  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0735  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  45.2 
 
 		 217 aa  152  5e-36  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.291848  normal  1 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0216  D-methionine ABC transporter, permease protein  47.09 
 
 		 217 aa  152  5e-36  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2557  D-methionine ABC transporter, permease protein  47.09 
 
 		 217 aa  152  5e-36  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0933  D-methionine ABC transporter, permease protein  47.09 
 
 		 217 aa  152  5e-36  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>