More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sterm_0535 on replicon NC_013517
Organism: Sebaldella termitidis ATCC 33386



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013517  Sterm_0535  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  100 
 
 
222 aa  427  1e-119  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_19580  ABC-type metal ion transport system, permease component  52.7 
 
 
222 aa  193  2e-48  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000846519 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1541  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  50 
 
 
235 aa  182  3e-45  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.104084  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0968  D-methionine transport system permease protein MetI  52.61 
 
 
213 aa  176  3e-43  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1074  D-methionine transport system permease protein MetI  51.2 
 
 
224 aa  168  5e-41  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1249  putative ABC transporter, permease protein  50.49 
 
 
224 aa  165  4e-40  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0890  ABC transporter, permease protein  42.73 
 
 
226 aa  162  3e-39  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_08270  ABC-type metal ion transport system, permease component  47.7 
 
 
225 aa  162  4.0000000000000004e-39  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.154439  normal  0.55012 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1486  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  40.72 
 
 
225 aa  160  1e-38  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000286975  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1239  ABC transporter, permease protein  50.68 
 
 
303 aa  160  2e-38  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0869  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  40.38 
 
 
215 aa  159  3e-38  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.771315  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2018  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  44.04 
 
 
224 aa  159  4e-38  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000000000432369 
 
 
-
 
NC_003912  CJE0864  ABC transporter, permease protein  50.23 
 
 
303 aa  158  6e-38  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.586541  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0794  ABC transporter, permease protein  50.23 
 
 
303 aa  158  8e-38  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.485222  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0643  ABC transporter, permease protein  46.19 
 
 
221 aa  157  1e-37  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.766537  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2653  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  43.44 
 
 
224 aa  157  1e-37  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0359  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  46.41 
 
 
226 aa  157  2e-37  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0862  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  41.86 
 
 
217 aa  156  3e-37  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0565276  normal  0.49182 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0791  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  41.4 
 
 
217 aa  154  7e-37  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.302745  normal  0.367632 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3885  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  40 
 
 
227 aa  154  9e-37  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.199051 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0921  transmembrane ABC transporter protein  41.4 
 
 
217 aa  153  2e-36  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.773713  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2987  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  44.66 
 
 
217 aa  153  2e-36  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.626863  hitchhiker  0.00236834 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3514  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  40.38 
 
 
227 aa  152  2.9999999999999998e-36  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3501  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  40.38 
 
 
227 aa  152  2.9999999999999998e-36  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3574  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  40.38 
 
 
227 aa  152  2.9999999999999998e-36  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.129763 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1556  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.12 
 
 
236 aa  152  4e-36  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0547  methionine ABC transporter permease  44.55 
 
 
218 aa  151  7e-36  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.460496  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1438  ABC transporter, permease protein  44.55 
 
 
218 aa  151  7e-36  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.455899  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1868  ABC transporter, permease protein  44.55 
 
 
218 aa  151  7e-36  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.326462  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0859  methionine ABC transporter permease  44.55 
 
 
218 aa  151  7e-36  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0449  methionine ABC transporter permease  44.55 
 
 
218 aa  151  7e-36  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.800882  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_2175  methionine ABC transporter permease  44.55 
 
 
218 aa  151  7e-36  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1771  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  42.47 
 
 
221 aa  151  8e-36  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1234  D-methionine transport system permease protein MetI  52.45 
 
 
223 aa  150  1e-35  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0760  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  45.63 
 
 
217 aa  150  2e-35  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2537  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  43.19 
 
 
221 aa  150  2e-35  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  hitchhiker  0.00567563  normal  0.226034 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4307  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  46.99 
 
 
224 aa  149  3e-35  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1770  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  46.08 
 
 
217 aa  149  4e-35  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.0000122974  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1513  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  42.99 
 
 
221 aa  148  6e-35  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2368  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  43.44 
 
 
221 aa  148  6e-35  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0543007  normal  0.691436 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2344  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  42.99 
 
 
221 aa  148  6e-35  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.251109  normal 
 
 
-
 
NC_009431  Rsph17025_4332  hypothetical protein  44.81 
 
 
224 aa  147  9e-35  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.362545  normal  0.101939 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7231  ABC transporter membrane spanning protein  47.37 
 
 
213 aa  147  9e-35  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.238623  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3173  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  42.99 
 
 
221 aa  147  1.0000000000000001e-34  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.571471  hitchhiker  0.00153184 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2418  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  43.66 
 
 
223 aa  147  2.0000000000000003e-34  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3790  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  45.28 
 
 
230 aa  146  3e-34  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.481635  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0175  ABC transporter permease  44.98 
 
 
222 aa  146  3e-34  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.713408  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0173  ABC transporter permease  44.98 
 
 
222 aa  146  3e-34  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.560116  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0962  ABC transporter, permease protein  47.55 
 
 
221 aa  145  4.0000000000000006e-34  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.496997  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1588  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  39.15 
 
 
235 aa  145  4.0000000000000006e-34  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.239912  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0903  ABC transporter, permease protein  47.55 
 
 
221 aa  145  4.0000000000000006e-34  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.840539  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0130  ABC D-methionine uptake transporter, inner membrane subunit  43.39 
 
 
224 aa  145  4.0000000000000006e-34  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.140263  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0194  ABC transporter, permease protein  44.98 
 
 
222 aa  145  4.0000000000000006e-34  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4490  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  44.5 
 
 
221 aa  145  4.0000000000000006e-34  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.167219  normal  0.0252468 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1767  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  43.39 
 
 
224 aa  145  4.0000000000000006e-34  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0577553  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3394  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  43.93 
 
 
218 aa  144  1e-33  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.393989  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3224  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  45.93 
 
 
221 aa  144  1e-33  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0165  ABC transporter, permease  44.5 
 
 
222 aa  143  2e-33  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0854  ABC methionine transporter, inner membrane subunit  45.32 
 
 
218 aa  143  2e-33  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0225125  hitchhiker  0.00619599 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1394  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  47.06 
 
 
221 aa  143  2e-33  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22290  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  44.93 
 
 
223 aa  143  3e-33  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0996  ABC methionine transporter, inner membrane subunit  44.66 
 
 
217 aa  142  4e-33  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4540  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  44.83 
 
 
218 aa  142  4e-33  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.141892  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1611  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  44.98 
 
 
222 aa  141  7e-33  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0940  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  47.62 
 
 
217 aa  140  9.999999999999999e-33  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.464419  normal 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2000  methionine transport system permease protein  43.48 
 
 
218 aa  140  9.999999999999999e-33  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.445077  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0196  D-methionine ABC transporter, permease protein  43.48 
 
 
218 aa  140  9.999999999999999e-33  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0936  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  47.62 
 
 
217 aa  140  9.999999999999999e-33  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004239  methionine ABC transporter permease protein  40.36 
 
 
225 aa  139  1.9999999999999998e-32  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2244  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  47.62 
 
 
217 aa  140  1.9999999999999998e-32  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.260973  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5215  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  43.46 
 
 
218 aa  140  1.9999999999999998e-32  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.206806 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2431  ABC metal ion transporter, inner membrane subunit  41.8 
 
 
237 aa  139  1.9999999999999998e-32  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0101713  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4686  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  43.46 
 
 
218 aa  140  1.9999999999999998e-32  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.116542  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2366  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  43.84 
 
 
217 aa  139  3e-32  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0812331  hitchhiker  0.00268015 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4173  ABC metal ion transporter, inner membrane subunit  47.02 
 
 
217 aa  139  3e-32  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.325664  normal  0.434406 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0564  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  46 
 
 
221 aa  139  3e-32  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1019  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  47.02 
 
 
217 aa  139  3.9999999999999997e-32  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2869  D-methionine ABC transporter, permease protein  48.21 
 
 
217 aa  139  3.9999999999999997e-32  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1651  D-methionine ABC transporter, permease protein  48.21 
 
 
217 aa  139  3.9999999999999997e-32  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0581  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  47.02 
 
 
217 aa  139  3.9999999999999997e-32  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.713567  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1060  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  47.02 
 
 
217 aa  139  3.9999999999999997e-32  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2930  D-methionine ABC transporter, permease protein  48.21 
 
 
217 aa  139  3.9999999999999997e-32  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0413  D-methionine ABC transporter, permease protein  47.62 
 
 
217 aa  139  4.999999999999999e-32  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0216  D-methionine ABC transporter, permease protein  47.62 
 
 
217 aa  139  4.999999999999999e-32  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2557  D-methionine ABC transporter, permease protein  47.62 
 
 
217 aa  139  4.999999999999999e-32  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0933  D-methionine ABC transporter, permease protein  47.62 
 
 
217 aa  139  4.999999999999999e-32  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5161  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  43.54 
 
 
221 aa  138  6e-32  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.250977  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1144  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  41.28 
 
 
228 aa  138  6e-32  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2552  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  46.86 
 
 
217 aa  138  7e-32  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2979  ABC transporter, membrane permease  48.21 
 
 
217 aa  138  7.999999999999999e-32  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0735  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  46.29 
 
 
217 aa  137  1e-31  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.291848  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0887  D-methionine transport system permease protein MetI  43.06 
 
 
225 aa  137  1e-31  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0312  ABC metal ion transporter, inner membrane subunit  44.88 
 
 
218 aa  137  2e-31  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.555716  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0789  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  47.55 
 
 
225 aa  136  2e-31  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6096  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  45.45 
 
 
217 aa  137  2e-31  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.676084 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0234  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  43.52 
 
 
214 aa  135  3.0000000000000003e-31  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.577588 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0197  ABC transporter, permease protein  44.98 
 
 
222 aa  136  3.0000000000000003e-31  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0217  ABC transporter, permease protein  44.98 
 
 
222 aa  136  3.0000000000000003e-31  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3537  ABC transporter substrate binding inner membrane protein  45.5 
 
 
228 aa  136  3.0000000000000003e-31  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.0228117 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1396  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.86 
 
 
222 aa  135  4e-31  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>