More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shel_19580 on replicon NC_013165
Organism: Slackia heliotrinireducens DSM 20476



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013165  Shel_19580  ABC-type metal ion transport system, permease component  100 
 
 		 222 aa  428  1e-119  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000846519 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2987  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  53.4 
 
 		 217 aa  202  2e-51  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.626863  hitchhiker  0.00236834 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0890  ABC transporter, permease protein  49.06 
 
 		 226 aa  199  3e-50  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0760  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  52.43 
 
 		 217 aa  196  2.0000000000000003e-49  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0996  ABC methionine transporter, inner membrane subunit  52.43 
 
 		 217 aa  192  4e-48  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0535  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  52.7 
 
 		 222 aa  192  4e-48  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0862  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  48.6 
 
 		 217 aa  192  5e-48  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0565276  normal  0.49182 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0791  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  48.6 
 
 		 217 aa  191  7e-48  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.302745  normal  0.367632 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2018  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  49.3 
 
 		 224 aa  190  1e-47  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000000000432369 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0921  transmembrane ABC transporter protein  48.6 
 
 		 217 aa  189  2.9999999999999997e-47  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.773713  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4173  ABC metal ion transporter, inner membrane subunit  50.96 
 
 		 217 aa  188  7e-47  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.325664  normal  0.434406 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2537  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  50.46 
 
 		 221 aa  188  7e-47  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  hitchhiker  0.00567563  normal  0.226034 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2244  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  51.44 
 
 		 217 aa  187  1e-46  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.260973  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1019  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  50.96 
 
 		 217 aa  186  3e-46  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0581  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  50.96 
 
 		 217 aa  186  3e-46  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.713567  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1060  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  50.96 
 
 		 217 aa  186  3e-46  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0940  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  50.96 
 
 		 217 aa  185  4e-46  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.464419  normal  1 
 
 
-
 
NC_009431  Rsph17025_4332  hypothetical protein  49.27 
 
 		 224 aa  185  4e-46  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.362545  normal  0.101939 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0936  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  50.96 
 
 		 217 aa  185  4e-46  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2869  D-methionine ABC transporter, permease protein  51.44 
 
 		 217 aa  185  6e-46  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1651  D-methionine ABC transporter, permease protein  51.44 
 
 		 217 aa  185  6e-46  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2930  D-methionine ABC transporter, permease protein  51.44 
 
 		 217 aa  185  6e-46  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2368  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  50.96 
 
 		 221 aa  184  7e-46  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0543007  normal  0.691436 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0216  D-methionine ABC transporter, permease protein  50.96 
 
 		 217 aa  184  8e-46  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0413  D-methionine ABC transporter, permease protein  50.96 
 
 		 217 aa  184  8e-46  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2557  D-methionine ABC transporter, permease protein  50.96 
 
 		 217 aa  184  8e-46  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0933  D-methionine ABC transporter, permease protein  50.96 
 
 		 217 aa  184  8e-46  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0869  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  45.19 
 
 		 215 aa  184  1.0000000000000001e-45  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.771315  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0130  ABC D-methionine uptake transporter, inner membrane subunit  49.04 
 
 		 224 aa  184  1.0000000000000001e-45  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.140263  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1767  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  49.04 
 
 		 224 aa  184  1.0000000000000001e-45  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0577553  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3173  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  48.15 
 
 		 221 aa  182  3e-45  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.571471  hitchhiker  0.00153184 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2979  ABC transporter, membrane permease  50.96 
 
 		 217 aa  182  3e-45  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1513  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  49.07 
 
 		 221 aa  182  4.0000000000000006e-45  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2344  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  49.07 
 
 		 221 aa  182  4.0000000000000006e-45  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.251109  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1144  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  50.96 
 
 		 228 aa  181  6e-45  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0564  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  53 
 
 		 221 aa  181  8.000000000000001e-45  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3224  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  53 
 
 		 221 aa  181  9.000000000000001e-45  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1249  putative ABC transporter, permease protein  49.3 
 
 		 224 aa  180  1e-44  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4490  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  49.04 
 
 		 221 aa  179  2.9999999999999997e-44  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.167219  normal  0.0252468 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1611  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  51.5 
 
 		 222 aa  179  2.9999999999999997e-44  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2552  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  50.96 
 
 		 217 aa  179  4e-44  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22290  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  52.4 
 
 		 223 aa  179  4e-44  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1770  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  47.6 
 
 		 217 aa  178  4.999999999999999e-44  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.0000122974  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_08270  ABC-type metal ion transport system, permease component  48 
 
 		 225 aa  177  8e-44  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.154439  normal  0.55012 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1074  D-methionine transport system permease protein MetI  50.23 
 
 		 224 aa  176  3e-43  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1771  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  49.5 
 
 		 221 aa  175  4e-43  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4307  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  49.5 
 
 		 224 aa  175  4e-43  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1486  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  39.37 
 
 		 225 aa  174  7e-43  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000286975  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0735  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  49.52 
 
 		 217 aa  174  7e-43  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.291848  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2653  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  46.51 
 
 		 224 aa  174  9.999999999999999e-43  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2000  methionine transport system permease protein  46.38 
 
 		 218 aa  173  1.9999999999999998e-42  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.445077  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0196  D-methionine ABC transporter, permease protein  46.38 
 
 		 218 aa  173  1.9999999999999998e-42  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3790  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  46.83 
 
 		 230 aa  172  5e-42  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.481635  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0359  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  46.38 
 
 		 226 aa  171  9e-42  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5161  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  48.83 
 
 		 221 aa  171  9e-42  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.250977  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3537  ABC transporter substrate binding inner membrane protein  48.5 
 
 		 228 aa  170  1e-41  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.0228117 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2366  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  49 
 
 		 217 aa  168  6e-41  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0812331  hitchhiker  0.00268015 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01201  hypothetical protein  49 
 
 		 225 aa  168  7e-41  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1541  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  48.5 
 
 		 235 aa  167  1e-40  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.104084  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7231  ABC transporter membrane spanning protein  49.75 
 
 		 213 aa  167  1e-40  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.238623  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0789  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  52.45 
 
 		 225 aa  166  2e-40  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0643  ABC transporter, permease protein  47.8 
 
 		 221 aa  166  2e-40  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.766537  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0887  D-methionine transport system permease protein MetI  45.12 
 
 		 225 aa  166  2.9999999999999998e-40  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0854  ABC methionine transporter, inner membrane subunit  49.26 
 
 		 218 aa  166  4e-40  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0225125  hitchhiker  0.00619599 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0968  D-methionine transport system permease protein MetI  48.08 
 
 		 213 aa  165  4e-40  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0235  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  48.31 
 
 		 214 aa  165  5e-40  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.15851  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0428  ABC transporter, permease protein  47.12 
 
 		 225 aa  164  9e-40  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3885  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  39.91 
 
 		 227 aa  164  1.0000000000000001e-39  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.199051 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004239  methionine ABC transporter permease protein  45.67 
 
 		 225 aa  163  2.0000000000000002e-39  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0806  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  43.72 
 
 		 246 aa  163  2.0000000000000002e-39  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.602881 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1438  ABC transporter, permease protein  48.34 
 
 		 218 aa  163  2.0000000000000002e-39  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.455899  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1868  ABC transporter, permease protein  48.34 
 
 		 218 aa  163  2.0000000000000002e-39  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.326462  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0547  methionine ABC transporter permease  48.34 
 
 		 218 aa  163  2.0000000000000002e-39  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.460496  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0859  methionine ABC transporter permease  48.34 
 
 		 218 aa  163  2.0000000000000002e-39  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0449  methionine ABC transporter permease  48.34 
 
 		 218 aa  163  2.0000000000000002e-39  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.800882  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_2175  methionine ABC transporter permease  48.34 
 
 		 218 aa  163  2.0000000000000002e-39  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0962  ABC transporter, permease protein  46.63 
 
 		 221 aa  162  3e-39  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.496997  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0903  ABC transporter, permease protein  46.63 
 
 		 221 aa  162  3e-39  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.840539  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4540  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  48.77 
 
 		 218 aa  162  3e-39  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.141892  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0219  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  48.95 
 
 		 214 aa  162  4.0000000000000004e-39  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00606752 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1394  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  46.63 
 
 		 221 aa  162  4.0000000000000004e-39  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2418  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  47.2 
 
 		 223 aa  162  4.0000000000000004e-39  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0234  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  48.95 
 
 		 214 aa  162  4.0000000000000004e-39  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.577588 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0243  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  48.95 
 
 		 214 aa  162  5.0000000000000005e-39  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.113433  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3501  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  41.67 
 
 		 227 aa  161  7e-39  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2431  ABC metal ion transporter, inner membrane subunit  46.38 
 
 		 237 aa  161  7e-39  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0101713  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4993  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  48.95 
 
 		 214 aa  161  7e-39  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.571534  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3574  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  41.67 
 
 		 227 aa  161  7e-39  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.129763 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3514  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  42.31 
 
 		 227 aa  161  9e-39  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_34260  putative permease of ABC transporter  47.55 
 
 		 217 aa  160  1e-38  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.0163975 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2911  ABC transporter permease  47.55 
 
 		 217 aa  160  1e-38  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.144856  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7235  ABC transporter membrane spanning protein  48.53 
 
 		 217 aa  159  2e-38  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0784  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  50.25 
 
 		 221 aa  160  2e-38  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2124  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  44.71 
 
 		 226 aa  158  7e-38  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0194  ABC transporter, permease protein  44.55 
 
 		 222 aa  157  9e-38  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3282  D- and L-methionine ABC transporter, permease protein  49.75 
 
 		 221 aa  157  1e-37  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.272839  normal  0.334498 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0175  ABC transporter permease  44.55 
 
 		 222 aa  157  1e-37  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.713408  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0173  ABC transporter permease  44.55 
 
 		 222 aa  157  1e-37  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.560116  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1234  D-methionine transport system permease protein MetI  49.02 
 
 		 223 aa  157  2e-37  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1780  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  47.06 
 
 		 220 aa  156  3e-37  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.290196  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>