More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SERP0098 on replicon NC_002976
Organism: Staphylococcus epidermidis RP62A



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002976  SERP0098  ABC transporter, permease protein  100 
 
 		 219 aa  415  9.999999999999999e-116  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.712322  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0484  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  86.76 
 
 		 219 aa  318  3.9999999999999996e-86  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.0000207474  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0497  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  86.76 
 
 		 219 aa  318  3.9999999999999996e-86  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  unclonable  0.000000249965  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2653  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  58.33 
 
 		 224 aa  222  4e-57  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0890  ABC transporter, permease protein  51.67 
 
 		 226 aa  209  3e-53  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009431  Rsph17025_4332  hypothetical protein  54.07 
 
 		 224 aa  208  4e-53  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.362545  normal  0.101939 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0130  ABC D-methionine uptake transporter, inner membrane subunit  54.07 
 
 		 224 aa  207  1e-52  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.140263  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1767  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  54.07 
 
 		 224 aa  207  1e-52  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0577553  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1486  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  50.72 
 
 		 225 aa  206  3e-52  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000286975  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1770  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  54.55 
 
 		 217 aa  205  4e-52  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.0000122974  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004239  methionine ABC transporter permease protein  51.43 
 
 		 225 aa  204  8e-52  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0428  ABC transporter, permease protein  50.95 
 
 		 225 aa  202  2e-51  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4307  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  54.68 
 
 		 224 aa  201  6e-51  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01201  hypothetical protein  53.23 
 
 		 225 aa  201  8e-51  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1144  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  55.5 
 
 		 228 aa  200  1.9999999999999998e-50  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0887  D-methionine transport system permease protein MetI  49.77 
 
 		 225 aa  198  3.9999999999999996e-50  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0175  ABC transporter permease  55.07 
 
 		 222 aa  197  9e-50  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.713408  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0173  ABC transporter permease  55.07 
 
 		 222 aa  197  9e-50  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.560116  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0194  ABC transporter, permease protein  55.07 
 
 		 222 aa  197  1.0000000000000001e-49  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0196  D-methionine ABC transporter, permease protein  53.2 
 
 		 218 aa  196  2.0000000000000003e-49  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2000  methionine transport system permease protein  53.2 
 
 		 218 aa  196  2.0000000000000003e-49  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.445077  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0165  ABC transporter, permease  54.59 
 
 		 222 aa  195  4.0000000000000005e-49  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22290  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  55.67 
 
 		 223 aa  192  3e-48  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2418  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  52.4 
 
 		 223 aa  191  6e-48  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3537  ABC transporter substrate binding inner membrane protein  53.47 
 
 		 228 aa  191  7e-48  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.0228117 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0869  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  47.2 
 
 		 215 aa  187  9e-47  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.771315  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2987  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  50.49 
 
 		 217 aa  186  3e-46  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.626863  hitchhiker  0.00236834 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0760  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  50.49 
 
 		 217 aa  185  4e-46  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2018  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  46.36 
 
 		 224 aa  185  5e-46  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000000000432369 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1541  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  50 
 
 		 235 aa  184  7e-46  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.104084  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0195  ABC transporter, permease protein  54.11 
 
 		 222 aa  184  8e-46  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00533098  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0159  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  54.11 
 
 		 222 aa  184  8e-46  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0217  ABC transporter, permease protein  54.59 
 
 		 222 aa  184  9e-46  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0197  ABC transporter, permease protein  54.11 
 
 		 222 aa  184  9e-46  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2537  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  53.73 
 
 		 221 aa  184  1.0000000000000001e-45  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  hitchhiker  0.00567563  normal  0.226034 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2101  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  53.92 
 
 		 213 aa  183  2.0000000000000003e-45  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0114041  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5128  ABC transporter, permease protein  52.75 
 
 		 222 aa  182  3e-45  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0854  ABC methionine transporter, inner membrane subunit  50 
 
 		 218 aa  182  4.0000000000000006e-45  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0225125  hitchhiker  0.00619599 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0862  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  49.51 
 
 		 217 aa  182  4.0000000000000006e-45  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0565276  normal  0.49182 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0791  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  49.51 
 
 		 217 aa  181  6e-45  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.302745  normal  0.367632 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0564  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  51.72 
 
 		 221 aa  180  2e-44  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4540  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  50.46 
 
 		 218 aa  179  2e-44  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.141892  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2368  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  52.45 
 
 		 221 aa  179  2.9999999999999997e-44  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0543007  normal  0.691436 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3532  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  48.06 
 
 		 216 aa  179  4e-44  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.530157  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3224  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  52.71 
 
 		 221 aa  179  4e-44  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1611  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  51.23 
 
 		 222 aa  178  4.999999999999999e-44  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0359  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  49.77 
 
 		 226 aa  177  8e-44  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1771  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  49.07 
 
 		 221 aa  177  9e-44  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3173  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  51.47 
 
 		 221 aa  177  1e-43  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.571471  hitchhiker  0.00153184 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1513  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  49.51 
 
 		 221 aa  176  2e-43  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0859  methionine ABC transporter permease  47.91 
 
 		 218 aa  176  2e-43  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0449  methionine ABC transporter permease  47.91 
 
 		 218 aa  176  2e-43  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.800882  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1438  ABC transporter, permease protein  47.91 
 
 		 218 aa  176  2e-43  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.455899  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1868  ABC transporter, permease protein  47.91 
 
 		 218 aa  176  2e-43  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.326462  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0547  methionine ABC transporter permease  47.91 
 
 		 218 aa  176  2e-43  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.460496  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_08270  ABC-type metal ion transport system, permease component  48.1 
 
 		 225 aa  176  2e-43  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.154439  normal  0.55012 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4490  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  50.72 
 
 		 221 aa  177  2e-43  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.167219  normal  0.0252468 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2344  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  49.51 
 
 		 221 aa  176  2e-43  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.251109  normal  1 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_2175  methionine ABC transporter permease  47.91 
 
 		 218 aa  176  2e-43  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2366  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  48.57 
 
 		 217 aa  176  3e-43  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0812331  hitchhiker  0.00268015 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_16990  ABC-type metal ion transport system, permease component  53.81 
 
 		 217 aa  176  3e-43  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.126358  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0921  transmembrane ABC transporter protein  49.51 
 
 		 217 aa  175  4e-43  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.773713  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3790  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  47.85 
 
 		 230 aa  175  6e-43  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.481635  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1249  putative ABC transporter, permease protein  52.61 
 
 		 224 aa  174  8e-43  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1074  D-methionine transport system permease protein MetI  53.37 
 
 		 224 aa  174  9.999999999999999e-43  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0784  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  51.42 
 
 		 221 aa  174  9.999999999999999e-43  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3394  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  50.95 
 
 		 218 aa  173  1.9999999999999998e-42  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.393989  normal  1 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7231  ABC transporter membrane spanning protein  53.11 
 
 		 213 aa  173  1.9999999999999998e-42  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.238623  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1055  ABC-type metal ion transport system, permease component  46.41 
 
 		 228 aa  172  2.9999999999999996e-42  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.0162881  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0252  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  50.49 
 
 		 225 aa  172  2.9999999999999996e-42  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.302856  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0293  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  52.09 
 
 		 221 aa  172  3.9999999999999995e-42  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0292  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  52.38 
 
 		 221 aa  172  3.9999999999999995e-42  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0968  D-methionine transport system permease protein MetI  51.92 
 
 		 213 aa  172  3.9999999999999995e-42  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4961  ABC transporter, permease protein  52.09 
 
 		 221 aa  171  5e-42  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0344  ABC transporter, permease protein  52.09 
 
 		 221 aa  171  6.999999999999999e-42  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0298  ABC transporter permease  52.09 
 
 		 221 aa  171  6.999999999999999e-42  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0285  ABC transporter, permease  52.09 
 
 		 221 aa  171  6.999999999999999e-42  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5215  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  50 
 
 		 218 aa  171  6.999999999999999e-42  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.206806 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0386  ABC transporter, permease protein  52.09 
 
 		 221 aa  171  6.999999999999999e-42  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0313  ABC transporter permease  52.09 
 
 		 221 aa  171  6.999999999999999e-42  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4686  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  50 
 
 		 218 aa  171  6.999999999999999e-42  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.116542  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0422  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  53.17 
 
 		 222 aa  171  1e-41  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1556  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  46.23 
 
 		 236 aa  171  1e-41  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0342  ABC transporter, permease protein  51.63 
 
 		 221 aa  169  2e-41  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4932  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  51.74 
 
 		 218 aa  169  3e-41  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0782482  normal  0.823992 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0903  ABC transporter, permease protein  49.05 
 
 		 221 aa  169  3e-41  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.840539  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0962  ABC transporter, permease protein  49.05 
 
 		 221 aa  169  3e-41  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.496997  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1780  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  50.24 
 
 		 220 aa  169  3e-41  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.290196  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0312  ABC metal ion transporter, inner membrane subunit  51.74 
 
 		 218 aa  169  3e-41  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.555716  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3030  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  51.74 
 
 		 218 aa  169  3e-41  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.233066  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1394  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  48.57 
 
 		 221 aa  169  3e-41  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5336  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  51.74 
 
 		 218 aa  169  3e-41  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.808195  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3885  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  45.67 
 
 		 227 aa  169  3e-41  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.199051 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0282  ABC transporter, permease  51.63 
 
 		 221 aa  169  4e-41  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2911  ABC transporter permease  46.45 
 
 		 217 aa  168  5e-41  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.144856  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0697  metal ion ABC transporter permease  48.1 
 
 		 228 aa  168  5e-41  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.388293  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_34260  putative permease of ABC transporter  46.45 
 
 		 217 aa  168  5e-41  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.0163975 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0235  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  45.02 
 
 		 214 aa  168  7e-41  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.15851  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3404  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  50.72 
 
 		 217 aa  167  1e-40  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000293888  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0284  DL-methionine transporter permease subunit  50.24 
 
 		 217 aa  167  1e-40  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  hitchhiker  0.00293716  normal  0.232369 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>