More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cphy_1231 on replicon NC_010001
Organism: Clostridium phytofermentans ISDg



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010001  Cphy_1231  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  100 
 
 		 226 aa  445  1.0000000000000001e-124  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1504  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  61.5 
 
 		 226 aa  263  1e-69  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0890  ABC transporter, permease protein  47.57 
 
 		 226 aa  194  7e-49  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1486  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  44.5 
 
 		 225 aa  189  2.9999999999999997e-47  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000286975  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1055  ABC-type metal ion transport system, permease component  44.8 
 
 		 228 aa  188  5e-47  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.0162881  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2018  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  48.02 
 
 		 224 aa  186  2e-46  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000000000432369 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1396  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  44.04 
 
 		 222 aa  183  2.0000000000000003e-45  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1772  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  44.91 
 
 		 222 aa  181  1e-44  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.918282  hitchhiker  0.000827956 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_08270  ABC-type metal ion transport system, permease component  46.23 
 
 		 225 aa  180  2e-44  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.154439  normal  0.55012 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0275  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  51.14 
 
 		 221 aa  179  4e-44  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0858  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  43.58 
 
 		 222 aa  176  2e-43  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0428  ABC transporter, permease protein  47.52 
 
 		 225 aa  175  5e-43  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01201  hypothetical protein  48.02 
 
 		 225 aa  175  6e-43  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0887  D-methionine transport system permease protein MetI  45.54 
 
 		 225 aa  173  9.999999999999999e-43  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2653  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  46.38 
 
 		 224 aa  174  9.999999999999999e-43  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004239  methionine ABC transporter permease protein  47.52 
 
 		 225 aa  174  9.999999999999999e-43  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1556  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  41.71 
 
 		 236 aa  172  5e-42  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0869  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  43.35 
 
 		 215 aa  171  6.999999999999999e-42  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.771315  normal  1 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1721  ABC-type metal ion transport system, permease component  40 
 
 		 232 aa  171  9e-42  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2987  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  47.91 
 
 		 217 aa  171  1e-41  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.626863  hitchhiker  0.00236834 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2000  methionine transport system permease protein  46.6 
 
 		 218 aa  169  3e-41  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.445077  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0196  D-methionine ABC transporter, permease protein  46.6 
 
 		 218 aa  169  3e-41  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1770  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  47.03 
 
 		 217 aa  169  5e-41  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.0000122974  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0366  ABC-type metal ion transport system, permease component  42.17 
 
 		 231 aa  167  1e-40  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3537  ABC transporter substrate binding inner membrane protein  48.26 
 
 		 228 aa  167  1e-40  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.0228117 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0760  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  47.91 
 
 		 217 aa  167  1e-40  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0252  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  47.71 
 
 		 225 aa  167  1e-40  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.302856  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2537  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  48.08 
 
 		 221 aa  167  1e-40  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  hitchhiker  0.00567563  normal  0.226034 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3790  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  43.5 
 
 		 230 aa  164  8e-40  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.481635  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4173  ABC metal ion transporter, inner membrane subunit  48.37 
 
 		 217 aa  164  1.0000000000000001e-39  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.325664  normal  0.434406 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0581  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  48.15 
 
 		 217 aa  163  2.0000000000000002e-39  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.713567  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1019  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  48.15 
 
 		 217 aa  163  2.0000000000000002e-39  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1060  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  48.15 
 
 		 217 aa  163  2.0000000000000002e-39  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1541  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  41.44 
 
 		 235 aa  162  4.0000000000000004e-39  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.104084  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3173  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  47.12 
 
 		 221 aa  162  5.0000000000000005e-39  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.571471  hitchhiker  0.00153184 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0191  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  48.78 
 
 		 229 aa  162  6e-39  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.799852  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7231  ABC transporter membrane spanning protein  51.52 
 
 		 213 aa  161  9e-39  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.238623  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1771  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  44.39 
 
 		 221 aa  161  9e-39  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0940  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  48.15 
 
 		 217 aa  161  9e-39  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.464419  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0936  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  48.15 
 
 		 217 aa  161  9e-39  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2244  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  47.69 
 
 		 217 aa  160  1e-38  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.260973  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2979  ABC transporter, membrane permease  49.07 
 
 		 217 aa  160  1e-38  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2368  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  48.08 
 
 		 221 aa  161  1e-38  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0543007  normal  0.691436 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1074  D-methionine transport system permease protein MetI  45.12 
 
 		 224 aa  161  1e-38  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0273  DL-methionine transporter permease subunit  49.03 
 
 		 217 aa  160  2e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.188598  normal  0.044434 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0413  D-methionine ABC transporter, permease protein  49.3 
 
 		 217 aa  160  2e-38  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0284  DL-methionine transporter permease subunit  49.03 
 
 		 217 aa  160  2e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  hitchhiker  0.00293716  normal  0.232369 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0268  DL-methionine transporter permease subunit  49.03 
 
 		 217 aa  160  2e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0674799  normal  0.269155 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0287  DL-methionine transporter permease subunit  49.03 
 
 		 217 aa  160  2e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.0000127237  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1651  D-methionine ABC transporter, permease protein  49.07 
 
 		 217 aa  160  2e-38  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0216  D-methionine ABC transporter, permease protein  49.3 
 
 		 217 aa  160  2e-38  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0996  ABC methionine transporter, inner membrane subunit  48.84 
 
 		 217 aa  159  2e-38  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2557  D-methionine ABC transporter, permease protein  49.3 
 
 		 217 aa  160  2e-38  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0933  D-methionine ABC transporter, permease protein  49.3 
 
 		 217 aa  160  2e-38  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0268  DL-methionine transporter permease subunit  49.03 
 
 		 217 aa  160  2e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0411312  normal  0.568834 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2869  D-methionine ABC transporter, permease protein  49.07 
 
 		 217 aa  160  2e-38  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2930  D-methionine ABC transporter, permease protein  49.07 
 
 		 217 aa  160  2e-38  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0736  DL-methionine transporter permease subunit  49.03 
 
 		 217 aa  159  3e-38  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.00465748  normal  0.854328 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0175  ABC transporter permease  45.59 
 
 		 222 aa  159  4e-38  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.713408  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0173  ABC transporter permease  45.59 
 
 		 222 aa  159  4e-38  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.560116  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22290  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  44.93 
 
 		 223 aa  159  5e-38  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0194  ABC transporter, permease protein  45.59 
 
 		 222 aa  159  5e-38  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3857  DL-methionine transporter subunit  42.92 
 
 		 217 aa  159  5e-38  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.955348 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1249  putative ABC transporter, permease protein  44.65 
 
 		 224 aa  158  7e-38  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1975  ABC transporter permease protein  45.37 
 
 		 235 aa  158  7e-38  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  hitchhiker  0.00271099  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0165  ABC transporter, permease  45.59 
 
 		 222 aa  158  8e-38  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1907  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  45.37 
 
 		 235 aa  158  8e-38  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  hitchhiker  0.0083693  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0877  DL-methionine transporter permease subunit  49.04 
 
 		 217 aa  158  8e-38  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  hitchhiker  0.000269148  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1513  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  46.15 
 
 		 221 aa  157  9e-38  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2344  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  46.15 
 
 		 221 aa  157  9e-38  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.251109  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0862  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  44.44 
 
 		 217 aa  157  1e-37  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0565276  normal  0.49182 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0195  ABC transporter, permease protein  46.08 
 
 		 222 aa  157  1e-37  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00533098  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1095  DL-methionine transporter permease subunit  49.51 
 
 		 217 aa  157  1e-37  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0123731  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4504  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  50.26 
 
 		 222 aa  157  1e-37  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0791  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  44.44 
 
 		 217 aa  157  1e-37  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.302745  normal  0.367632 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3406  DL-methionine transporter permease subunit  49.51 
 
 		 217 aa  157  1e-37  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.139854  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1780  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  46.48 
 
 		 220 aa  157  1e-37  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.290196  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0197  ABC transporter, permease protein  46.08 
 
 		 222 aa  157  1e-37  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1042  DL-methionine transporter permease subunit  49.51 
 
 		 217 aa  157  1e-37  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000000294871  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0159  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  46.08 
 
 		 222 aa  156  2e-37  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3394  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  46.19 
 
 		 218 aa  156  2e-37  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.393989  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0217  ABC transporter, permease protein  45.59 
 
 		 222 aa  156  2e-37  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1448  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  54.44 
 
 		 219 aa  156  2e-37  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.388698  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0427  ABC-type metal ion transport system, permease component  43.48 
 
 		 231 aa  156  2e-37  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0921  transmembrane ABC transporter protein  43.52 
 
 		 217 aa  156  3e-37  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.773713  normal  1 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0449  methionine ABC transporter permease  46.15 
 
 		 218 aa  156  3e-37  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.800882  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1438  ABC transporter, permease protein  46.15 
 
 		 218 aa  156  3e-37  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.455899  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1868  ABC transporter, permease protein  46.15 
 
 		 218 aa  156  3e-37  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.326462  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0859  methionine ABC transporter permease  46.15 
 
 		 218 aa  156  3e-37  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_2175  methionine ABC transporter permease  46.15 
 
 		 218 aa  156  3e-37  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0547  methionine ABC transporter permease  46.15 
 
 		 218 aa  156  3e-37  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.460496  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03094  ABC transporter permease  44.88 
 
 		 231 aa  155  5.0000000000000005e-37  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3754  DL-methionine transporter permease subunit  48.54 
 
 		 217 aa  155  6e-37  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  decreased coverage  0.0000000523808  normal  0.0802818 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5215  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  47.62 
 
 		 218 aa  155  6e-37  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.206806 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4686  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  47.62 
 
 		 218 aa  155  6e-37  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.116542  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5128  ABC transporter, permease protein  45.59 
 
 		 222 aa  154  8e-37  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4540  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  46.73 
 
 		 218 aa  154  1e-36  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.141892  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0846  DL-methionine transporter permease subunit  48.06 
 
 		 217 aa  153  2e-36  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  unclonable  0.0000145183  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2366  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  47.22 
 
 		 217 aa  153  2e-36  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0812331  hitchhiker  0.00268015 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6096  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  49.51 
 
 		 217 aa  153  2e-36  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.676084 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>