More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hoch_5647 on replicon NC_013440
Organism: Haliangium ochraceum DSM 14365



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013440  Hoch_5647  ATP-cone domain protein  100 
 
 		 205 aa  395  1e-109  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.34671  normal  0.96212 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2732  transcriptional regulator NrdR  58.23 
 
 		 162 aa  183  2.0000000000000003e-45  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2835  transcriptional regulator NrdR  56.38 
 
 		 155 aa  169  2e-41  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0802183  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2743  transcriptional regulator NrdR  55.56 
 
 		 156 aa  169  3e-41  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2927  transcriptional regulator NrdR  56.38 
 
 		 155 aa  169  3e-41  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2184  transcriptional regulator NrdR  51.7 
 
 		 150 aa  168  6e-41  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000132804  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1510  transcriptional regulator NrdR  50.34 
 
 		 153 aa  162  2.0000000000000002e-39  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000000423148  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1687  transcriptional regulator NrdR  53.74 
 
 		 150 aa  162  3e-39  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1225  transcriptional regulator NrdR  48.98 
 
 		 150 aa  160  1e-38  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.123121 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3025  transcriptional regulator NrdR  48.98 
 
 		 150 aa  160  1e-38  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.304834  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1597  transcriptional regulator NrdR  50.34 
 
 		 150 aa  160  1e-38  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.000000000794729  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09190  ATP-cone domain protein  49.66 
 
 		 151 aa  160  1e-38  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000000241232  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1697  transcriptional regulator NrdR  51.7 
 
 		 150 aa  159  4e-38  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1444  transcriptional regulator NrdR  47.62 
 
 		 157 aa  158  4e-38  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1003  transcriptional regulator NrdR  49.03 
 
 		 156 aa  156  2e-37  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  unclonable  0.0000000000818068  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2725  transcriptional regulator NrdR  47.62 
 
 		 153 aa  155  3e-37  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000000561851  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_06700  transcriptional regulator NrdR  51.01 
 
 		 154 aa  155  3e-37  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1748  transcriptional regulator NrdR  51.02 
 
 		 150 aa  155  4e-37  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0805744  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4041  transcriptional regulator NrdR  49.38 
 
 		 163 aa  155  4e-37  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0692  transcriptional regulator NrdR  52.38 
 
 		 158 aa  152  2.9999999999999998e-36  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.663246  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3459  transcriptional regulator NrdR  48.32 
 
 		 156 aa  152  2.9999999999999998e-36  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.007384 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2059  transcriptional regulator NrdR  48.32 
 
 		 154 aa  152  4e-36  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.0000239578  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0450  transcriptional regulator NrdR  48.98 
 
 		 151 aa  151  5.9999999999999996e-36  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00111  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1623  transcriptional regulator NrdR  50.34 
 
 		 150 aa  150  1e-35  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.0000000406382  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1998  transcriptional regulator NrdR  43.67 
 
 		 158 aa  150  1e-35  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.000000000130508  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1044  transcriptional regulator NrdR  48.99 
 
 		 175 aa  150  1e-35  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_11380  transcriptional regulator NrdR  48.99 
 
 		 154 aa  150  1e-35  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.165423  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1439  ATP-cone domain-containing protein  47.3 
 
 		 151 aa  150  1e-35  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1549  ATP-cone domain protein  51.61 
 
 		 163 aa  150  2e-35  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.000415369  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2242  transcriptional regulator NrdR  50.67 
 
 		 159 aa  149  2e-35  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.279557  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1608  ATP-cone domain protein  51.7 
 
 		 148 aa  149  2e-35  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.000000998314  hitchhiker  0.000000000000175991 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1887  ATP-cone domain protein  49.11 
 
 		 176 aa  150  2e-35  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0177  ATP-cone domain-containing protein  51.7 
 
 		 152 aa  149  3e-35  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0793  transcriptional regulator NrdR  51.02 
 
 		 153 aa  149  3e-35  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1244  transcriptional regulator NrdR  46.67 
 
 		 154 aa  148  5e-35  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.000000621144  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1330  transcriptional regulator NrdR  47.65 
 
 		 151 aa  148  6e-35  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.768673  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0513  transcriptional regulator NrdR  49.66 
 
 		 154 aa  147  7e-35  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.579451  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0548  transcriptional regulator NrdR  49.66 
 
 		 154 aa  147  7e-35  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2386  transcriptional regulator NrdR  44.9 
 
 		 153 aa  148  7e-35  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000689968 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0989  transcriptional regulator NrdR  48.98 
 
 		 152 aa  147  8e-35  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.38462  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1070  transcriptional regulator NrdR  49.66 
 
 		 150 aa  147  1.0000000000000001e-34  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000000102337  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0689  hypothetical protein  48.99 
 
 		 154 aa  147  1.0000000000000001e-34  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4463  transcriptional regulator NrdR  48.99 
 
 		 154 aa  147  1.0000000000000001e-34  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0768  ATP-cone domain protein  50.68 
 
 		 148 aa  147  1.0000000000000001e-34  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.376123  normal  0.291011 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_4090  ATP-cone domain protein  50 
 
 		 154 aa  147  1.0000000000000001e-34  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0559  transcriptional regulator NrdR  49.66 
 
 		 154 aa  147  1.0000000000000001e-34  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0566  transcriptional regulator NrdR  49.66 
 
 		 154 aa  147  1.0000000000000001e-34  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2665  transcriptional regulator NrdR  49.66 
 
 		 153 aa  146  2.0000000000000003e-34  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00143728  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5020  transcriptional regulator NrdR  48.32 
 
 		 154 aa  146  2.0000000000000003e-34  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.582624 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0279  transcriptional regulator NrdR  45.56 
 
 		 174 aa  146  2.0000000000000003e-34  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  decreased coverage  0.00520187  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3251  transcriptional regulator NrdR  47.62 
 
 		 152 aa  146  2.0000000000000003e-34  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0949  hypothetical protein  48.3 
 
 		 150 aa  146  2.0000000000000003e-34  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.00000000456921  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0921  transcriptional regulator NrdR  43.62 
 
 		 149 aa  145  3e-34  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3858  transcriptional regulator NrdR  48.32 
 
 		 155 aa  145  4.0000000000000006e-34  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1743  transcriptional regulator NrdR  47.86 
 
 		 156 aa  145  4.0000000000000006e-34  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1777  transcriptional regulator NrdR  47.86 
 
 		 156 aa  145  4.0000000000000006e-34  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0296  transcriptional regulator NrdR  52.67 
 
 		 163 aa  145  5e-34  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0472  transcriptional regulator NrdR  52.67 
 
 		 163 aa  145  5e-34  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.687081  hitchhiker  0.000432977 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_2142  transcriptional regulator NrdR  40.82 
 
 		 152 aa  144  6e-34  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.497739  hitchhiker  0.00230243 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2026  transcriptional regulator NrdR  49.34 
 
 		 174 aa  144  7.0000000000000006e-34  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0794  transcriptional regulator NrdR  48.99 
 
 		 148 aa  144  8.000000000000001e-34  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.610189  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1401  transcriptional regulator NrdR  47.02 
 
 		 154 aa  144  9e-34  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.124878  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0344  transcriptional regulator NrdR  48.3 
 
 		 175 aa  144  1e-33  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0225239  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_285  transcriptional regulator  48.98 
 
 		 175 aa  144  1e-33  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.000377399  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2471  transcriptional regulator NrdR  40.82 
 
 		 152 aa  144  1e-33  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.01116 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0157  transcriptional regulator NrdR  44 
 
 		 150 aa  144  1e-33  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0842  ATP-cone domain-containing protein  46.67 
 
 		 172 aa  144  1e-33  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1156  transcriptional regulator NrdR  46.94 
 
 		 153 aa  142  2e-33  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0323  transcriptional regulator NrdR  48.3 
 
 		 175 aa  143  2e-33  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  unclonable  0.00000000111081  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2586  transcriptional regulator NrdR  48.41 
 
 		 161 aa  143  2e-33  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1730  transcriptional regulator NrdR  45.58 
 
 		 149 aa  142  2e-33  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0593738  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4690  transcriptional regulator NrdR  46.94 
 
 		 153 aa  142  3e-33  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000176675  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4711  transcriptional regulator NrdR  46.94 
 
 		 153 aa  142  3e-33  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000000383164  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4476  transcriptional regulator NrdR  46.94 
 
 		 153 aa  142  3e-33  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  unclonable  0.00000000000265338  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4311  transcriptional regulator NrdR  46.94 
 
 		 153 aa  142  3e-33  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  1.8117699999999998e-20  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4322  transcriptional regulator NrdR  46.94 
 
 		 153 aa  142  3e-33  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00000000178124  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4705  transcriptional regulator NrdR  46.94 
 
 		 153 aa  142  3e-33  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.00000000119407  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2080  transcriptional regulator NrdR  48.98 
 
 		 151 aa  142  3e-33  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0000471331  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4824  transcriptional regulator NrdR  46.94 
 
 		 153 aa  142  3e-33  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000114279  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0548  transcriptional regulator NrdR  46.94 
 
 		 153 aa  142  3e-33  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000000060118  unclonable  2.0296800000000001e-26 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1584  transcriptional regulator NrdR  48.98 
 
 		 150 aa  142  3e-33  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4695  transcriptional regulator NrdR  46.94 
 
 		 153 aa  142  3e-33  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.91866e-60 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1418  transcriptional regulator NrdR  46.26 
 
 		 154 aa  142  3e-33  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.000085641  hitchhiker  0.00000000000128798 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1862  transcriptional regulator NrdR  44.9 
 
 		 149 aa  142  3e-33  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00283574  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1916  transcriptional regulator NrdR  47.3 
 
 		 148 aa  142  4e-33  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.00109588  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1249  transcriptional regulator NrdR  47.14 
 
 		 156 aa  141  5e-33  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.0638697  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02986  transcriptional regulator NrdR  46.26 
 
 		 149 aa  142  5e-33  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  unclonable  0.000000784776  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2012  transcriptional regulator NrdR  45.58 
 
 		 149 aa  142  5e-33  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.37372  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0729  transcriptional regulator NrdR  42.86 
 
 		 165 aa  141  6e-33  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004266  ribonucleotide reductase transcriptional regulator NrdR  43.24 
 
 		 149 aa  141  7e-33  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.000298691  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4411  transcriptional regulator NrdR  46.94 
 
 		 153 aa  141  7e-33  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.0000000407341  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1186  transcriptional regulator NrdR  43.87 
 
 		 157 aa  141  8e-33  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.526679  normal  0.888378 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3266  transcriptional regulator NrdR  46.94 
 
 		 153 aa  141  8e-33  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00000209294  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0374  transcriptional regulator NrdR  51.37 
 
 		 151 aa  141  8e-33  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.233344  normal  0.151767 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3470  transcriptional regulator NrdR  44.3 
 
 		 149 aa  140  9.999999999999999e-33  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1095  transcriptional regulator NrdR  44.3 
 
 		 149 aa  140  9.999999999999999e-33  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.287796  normal  0.608767 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0356  transcriptional regulator NrdR  46.5 
 
 		 159 aa  140  9.999999999999999e-33  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  decreased coverage  0.0000016324  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1095  transcriptional regulator NrdR  44.3 
 
 		 149 aa  140  9.999999999999999e-33  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0146085  normal  0.938869 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0048  ATP-cone domain protein  47.65 
 
 		 158 aa  140  9.999999999999999e-33  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4029  ATP-cone domain protein  44.97 
 
 		 184 aa  140  9.999999999999999e-33  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00292973 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>