63 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hoch_1339 on replicon NC_013440
Organism: Haliangium ochraceum DSM 14365



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013440  Hoch_1339  transcriptional regulator, LuxR family  100 
 
 		 188 aa  364  1e-100  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.919185 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3851  transcriptional regulator, LuxR family  45.83 
 
 		 206 aa  133  9.999999999999999e-31  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.321989  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3794  LuxR family transcriptional regulator  48.73 
 
 		 179 aa  134  9.999999999999999e-31  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3937  transcriptional regulator, LuxR family  45.83 
 
 		 206 aa  132  3.9999999999999996e-30  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.59446  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3914  response regulator receiver protein  48.89 
 
 		 208 aa  110  9e-24  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0257494  normal  0.794446 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4438  LuxR family transcriptional regulator  32.93 
 
 		 181 aa  104  6e-22  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4298  response regulator receiver protein  32.93 
 
 		 181 aa  104  6e-22  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0102  response regulator receiver protein  32.93 
 
 		 175 aa  105  6e-22  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4243  transcriptional regulator, LuxR family  32.93 
 
 		 181 aa  103  1e-21  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1945  hypothetical protein  37.33 
 
 		 163 aa  102  3e-21  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3443  LuxR family transcriptional regulator  63.01 
 
 		 154 aa  100  1e-20  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2495  response regulator receiver protein  39.64 
 
 		 163 aa  99.8  2e-20  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3948  LuxR family transcriptional regulator  32.35 
 
 		 181 aa  98.6  5e-20  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_4063  LuxR family transcriptional regulator  32.35 
 
 		 181 aa  97.8  8e-20  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3855  LuxR family transcriptional regulator  32.35 
 
 		 181 aa  97.8  9e-20  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3890  transcriptional regulator, LuxR family protein  29.55 
 
 		 174 aa  97.4  1e-19  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00101  transcriptional regulator, LuxR family protein  36.94 
 
 		 169 aa  95.5  4e-19  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3763  LuxR family transcriptional regulator  30.82 
 
 		 176 aa  94.4  8e-19  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.415447 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1034  transcriptional regulator  43.48 
 
 		 180 aa  74.7  0.0000000000006  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.130268  normal  0.442901 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1748  transcriptional regulator, LuxR family  44.74 
 
 		 146 aa  70.5  0.00000000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.747406  normal  0.455372 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3288  transcriptional regulator, LuxR family  37.84 
 
 		 375 aa  47.4  0.0001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.272841 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3415  transcriptional regulator, LuxR family  39.19 
 
 		 394 aa  46.2  0.0003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.127954  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3333  putative GAF sensor protein  33.87 
 
 		 337 aa  46.2  0.0003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.00000024047  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3227  LuxR family transcriptional regulator  38.67 
 
 		 545 aa  46.2  0.0003  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3095  regulatory protein LuxR  39.19 
 
 		 386 aa  45.8  0.0004  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2358  regulatory protein, LuxR  40.32 
 
 		 483 aa  45.1  0.0007  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0016  LuxR family transcriptional regulator  31.25 
 
 		 267 aa  44.3  0.001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0269  transcriptional regulator, LuxR family  41.51 
 
 		 499 aa  43.5  0.002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2290  transcriptional regulator, LuxR family  32.39 
 
 		 493 aa  43.5  0.002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.10968  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3988  two component transcriptional regulator, LuxR family  42.86 
 
 		 228 aa  43.1  0.002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0354189  normal  0.736565 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3628  two component LuxR family transcriptional regulator  29.81 
 
 		 225 aa  43.5  0.002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.717242  normal  0.142765 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3529  transcriptional regulator, LuxR family  34.48 
 
 		 324 aa  43.5  0.002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0854004  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2887  LuxR family two component transcriptional regulator  29.81 
 
 		 225 aa  43.9  0.002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.526109  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2135  LuxR family transcriptional regulator  38.98 
 
 		 397 aa  43.1  0.003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0166  transcriptional regulator, LuxR family protein  28.41 
 
 		 207 aa  42.7  0.003  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.00243136  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2258  transcriptional regulator, LuxR family  37.66 
 
 		 476 aa  42.7  0.003  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0405  two component LuxR family transcriptional regulator  34.38 
 
 		 218 aa  42.7  0.003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.135899 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0320  response regulator receiver protein  31.43 
 
 		 275 aa  43.1  0.003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.319961 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0340  two component transcriptional regulator, LuxR family  32.31 
 
 		 217 aa  42.4  0.004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00614189  hitchhiker  0.00317709 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0406  transcriptional regulator, LuxR family  34.38 
 
 		 486 aa  42.4  0.004  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.0269651 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0160  response regulator receiver protein  32.95 
 
 		 279 aa  42.4  0.004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2042  two component LuxR family transcriptional regulator  28.36 
 
 		 208 aa  42.4  0.004  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3355  two component LuxR family transcriptional regulator  35.48 
 
 		 232 aa  42.4  0.004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1619  LuxR family transcriptional regulator  36.21 
 
 		 405 aa  42  0.005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00646137  normal  0.376229 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0186  response regulator receiver protein  30.77 
 
 		 213 aa  42  0.005  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  decreased coverage  0.00000327076  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2193  transcriptional regulator, LuxR family  30.36 
 
 		 258 aa  42  0.005  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3502  two component LuxR family transcriptional regulator  33.9 
 
 		 228 aa  42  0.005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0657  two component LuxR family transcriptional regulator  30 
 
 		 209 aa  42  0.006  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000000493749  normal  0.229808 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3847  LuxR family transcriptional regulator  27.73 
 
 		 265 aa  42  0.006  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.126392  normal  0.51742 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0656  two component LuxR family transcriptional regulator  30 
 
 		 209 aa  42  0.006  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.000000830399  normal  0.140804 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0473  transcriptional regulator, LuxR family  36.36 
 
 		 488 aa  41.6  0.006  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.815594  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3365  two component LuxR family transcriptional regulator  30 
 
 		 209 aa  42  0.006  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.0000651556  normal  0.0242167 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0184  transcriptional regulator, LuxR family  32.81 
 
 		 507 aa  41.6  0.007  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.131926  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_19250  transcriptional regulator, LuxR family  39.29 
 
 		 894 aa  41.6  0.007  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.368916  normal  0.454776 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3188  LuxR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 368 aa  41.6  0.007  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0110301  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2336  LuxR family transcriptional regulator  38.3 
 
 		 322 aa  41.2  0.008  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.671494 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4059  two component LuxR family transcriptional regulator  29.05 
 
 		 212 aa  41.2  0.009  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.111025  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3609  transcriptional regulator, LuxR family  37.04 
 
 		 818 aa  41.2  0.009  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4918  metal-dependent phosphohydrolase  37.25 
 
 		 516 aa  41.2  0.01  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.401687  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3836  two component LuxR family transcriptional regulator  30.38 
 
 		 209 aa  41.2  0.01  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00000136397  normal  0.0231387 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0792  two component LuxR family transcriptional regulator  30.38 
 
 		 209 aa  41.2  0.01  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000000151034  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3654  two component transcriptional regulator, LuxR family  30.38 
 
 		 209 aa  41.2  0.01  Shewanella baltica OS223  Bacteria  unclonable  0.000000000464283  hitchhiker  0.00000781977 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3713  two component LuxR family transcriptional regulator  30.38 
 
 		 209 aa  41.2  0.01  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000000000161759  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>