52 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MADE_00101 on replicon NC_011138
Organism: Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011138  MADE_00101  transcriptional regulator, LuxR family protein  100 
 
 		 169 aa  343  7e-94  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3890  transcriptional regulator, LuxR family protein  45.51 
 
 		 174 aa  163  1.0000000000000001e-39  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1945  hypothetical protein  51.23 
 
 		 163 aa  161  4.0000000000000004e-39  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_4063  LuxR family transcriptional regulator  41.92 
 
 		 181 aa  159  2e-38  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3948  LuxR family transcriptional regulator  41.92 
 
 		 181 aa  159  2e-38  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3855  LuxR family transcriptional regulator  41.92 
 
 		 181 aa  159  2e-38  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4298  response regulator receiver protein  41.92 
 
 		 181 aa  153  9e-37  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4438  LuxR family transcriptional regulator  41.92 
 
 		 181 aa  153  9e-37  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0102  response regulator receiver protein  41.92 
 
 		 175 aa  153  1e-36  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4243  transcriptional regulator, LuxR family  41.92 
 
 		 181 aa  152  2e-36  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3763  LuxR family transcriptional regulator  42.17 
 
 		 176 aa  151  2.9999999999999998e-36  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.415447 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2495  response regulator receiver protein  36.65 
 
 		 163 aa  113  1.0000000000000001e-24  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3937  transcriptional regulator, LuxR family  39.63 
 
 		 206 aa  98.2  4e-20  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.59446  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3794  LuxR family transcriptional regulator  39.63 
 
 		 179 aa  98.2  5e-20  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3851  transcriptional regulator, LuxR family  39.02 
 
 		 206 aa  97.1  1e-19  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.321989  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3443  LuxR family transcriptional regulator  49.41 
 
 		 154 aa  93.2  2e-18  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1339  transcriptional regulator, LuxR family  43 
 
 		 188 aa  88.2  5e-17  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.919185 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1034  transcriptional regulator  42.71 
 
 		 180 aa  84.3  6e-16  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.130268  normal  0.442901 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3914  response regulator receiver protein  45.56 
 
 		 208 aa  84.7  6e-16  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0257494  normal  0.794446 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1748  transcriptional regulator, LuxR family  36 
 
 		 146 aa  66.6  0.0000000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.747406  normal  0.455372 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2587  LuxR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 280 aa  47  0.0001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0358062  normal  0.430196 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3628  two component LuxR family transcriptional regulator  37.7 
 
 		 225 aa  46.2  0.0002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.717242  normal  0.142765 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2887  LuxR family two component transcriptional regulator  37.7 
 
 		 225 aa  46.2  0.0002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.526109  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3129  LuxR family transcriptional regulator  32.38 
 
 		 303 aa  45.1  0.0005  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1351  response regulator receiver protein  36.11 
 
 		 189 aa  43.5  0.001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.631825  normal  0.574707 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0065  two component transcriptional regulator, LuxR family  42.86 
 
 		 204 aa  43.5  0.001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4161  regulatory protein LuxR  36.11 
 
 		 893 aa  43.9  0.001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.339617  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3251  LuxR family transcriptional regulator  32.53 
 
 		 280 aa  43.9  0.001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.139103 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1370  LuxR family transcriptional regulator  36.11 
 
 		 881 aa  43.1  0.002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1404  LuxR family transcriptional regulator  36.11 
 
 		 876 aa  43.1  0.002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0590  two component LuxR family transcriptional regulator  37.14 
 
 		 215 aa  43.1  0.002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0603  two component LuxR family transcriptional regulator  37.14 
 
 		 215 aa  43.1  0.002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0581  two component LuxR family transcriptional regulator  37.14 
 
 		 215 aa  43.1  0.002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1388  LuxR family transcriptional regulator  36.11 
 
 		 881 aa  43.1  0.002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0315811  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1580  two component transcriptional regulator, LuxR family  36.84 
 
 		 216 aa  42.4  0.003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_11330  response regulator containing a CheY-like receiver domain and an HTH DNA-binding domain  41.82 
 
 		 224 aa  42.4  0.003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.0103975 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1605  two component transcriptional regulator, LuxR family  36.84 
 
 		 216 aa  42.4  0.003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3355  two component LuxR family transcriptional regulator  34.48 
 
 		 232 aa  42  0.004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2577  transcriptional regulator, LuxR family  39.66 
 
 		 372 aa  42  0.004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0769027  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0062  response regulator receiver domain-containing protein  41.82 
 
 		 369 aa  42  0.004  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.000342742  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_19250  transcriptional regulator, LuxR family  39.29 
 
 		 894 aa  42  0.004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.368916  normal  0.454776 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2290  two component transcriptional regulator, LuxR family  41.07 
 
 		 208 aa  41.6  0.005  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  decreased coverage  0.00802134  hitchhiker  0.000628596 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0776  regulatory protein, LuxR  45.45 
 
 		 921 aa  41.6  0.006  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0795  regulatory protein LuxR  40.38 
 
 		 202 aa  41.2  0.006  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.0000492678  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0780  LuxR family transcriptional regulator  45.45 
 
 		 921 aa  41.6  0.006  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0795  regulatory protein, LuxR  45.45 
 
 		 921 aa  41.6  0.006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.397823  normal  0.131546 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2488  LuxR family transcriptional regulator  38.33 
 
 		 359 aa  41.2  0.008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.008035 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2379  transcriptional regulator, LuxR family  33.96 
 
 		 377 aa  40.8  0.009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.207918  decreased coverage  0.00252302 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6525  two component transcriptional regulator, LuxR family  38.89 
 
 		 216 aa  40.8  0.01  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3227  LuxR family transcriptional regulator  37.74 
 
 		 545 aa  40.8  0.01  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5247  LuxR family transcriptional regulator  27.52 
 
 		 514 aa  40.8  0.01  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.603722  normal  0.35683 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3414  LuxR family transcriptional regulator  27.52 
 
 		 514 aa  40.8  0.01  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>