37 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene A2cp1_3937 on replicon NC_011891
Organism: Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011891  A2cp1_3937  transcriptional regulator, LuxR family  100 
 
 		 206 aa  390  1e-108  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.59446  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3851  transcriptional regulator, LuxR family  98.54 
 
 		 206 aa  386  1e-106  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.321989  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3794  LuxR family transcriptional regulator  95.53 
 
 		 179 aa  302  2.0000000000000002e-81  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3914  response regulator receiver protein  64.08 
 
 		 208 aa  190  2e-47  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0257494  normal  0.794446 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1339  transcriptional regulator, LuxR family  45.03 
 
 		 188 aa  122  4e-27  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.919185 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4438  LuxR family transcriptional regulator  34.38 
 
 		 181 aa  107  1e-22  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0102  response regulator receiver protein  34.38 
 
 		 175 aa  107  1e-22  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4298  response regulator receiver protein  34.84 
 
 		 181 aa  107  1e-22  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3948  LuxR family transcriptional regulator  33.75 
 
 		 181 aa  105  3e-22  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_4063  LuxR family transcriptional regulator  33.75 
 
 		 181 aa  105  5e-22  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3855  LuxR family transcriptional regulator  33.75 
 
 		 181 aa  104  7e-22  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4243  transcriptional regulator, LuxR family  33.75 
 
 		 181 aa  103  2e-21  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3890  transcriptional regulator, LuxR family protein  32.3 
 
 		 174 aa  100  2e-20  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00101  transcriptional regulator, LuxR family protein  39.63 
 
 		 169 aa  99  4e-20  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3763  LuxR family transcriptional regulator  33.14 
 
 		 176 aa  97.1  2e-19  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.415447 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1945  hypothetical protein  37.06 
 
 		 163 aa  94  1e-18  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3443  LuxR family transcriptional regulator  34.57 
 
 		 154 aa  93.6  2e-18  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2495  response regulator receiver protein  38.69 
 
 		 163 aa  92.4  4e-18  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1034  transcriptional regulator  48.81 
 
 		 180 aa  79.7  0.00000000000003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.130268  normal  0.442901 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1748  transcriptional regulator, LuxR family  34.69 
 
 		 146 aa  60.5  0.00000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.747406  normal  0.455372 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3333  putative GAF sensor protein  32.14 
 
 		 337 aa  50.8  0.00001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.00000024047  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0981  two component transcriptional regulator, LuxR family  37.1 
 
 		 221 aa  45.4  0.0005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.416641 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3227  LuxR family transcriptional regulator  43.4 
 
 		 545 aa  45.1  0.0007  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3565  regulatory protein LuxR  36 
 
 		 376 aa  44.7  0.0009  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2290  transcriptional regulator, LuxR family  35 
 
 		 493 aa  44.3  0.001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.10968  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3529  transcriptional regulator, LuxR family  43.1 
 
 		 324 aa  43.9  0.002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0854004  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1037  transcriptional regulator, LuxR family  40.35 
 
 		 363 aa  43.1  0.003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.760351 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4474  regulatory protein, LuxR  37.35 
 
 		 977 aa  42.7  0.004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0017385 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0972  two component LuxR family transcriptional regulator  31.08 
 
 		 227 aa  42.4  0.005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.299836  normal  0.0302219 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3893  transcriptional regulator, LuxR family  45.61 
 
 		 904 aa  42.4  0.005  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10909  LuxR family transcriptional regulator  44.44 
 
 		 882 aa  42.4  0.005  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1493  transcriptional regulator, LuxR family  32.95 
 
 		 198 aa  42  0.007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3178  transcriptional regulator, LuxR family  33.82 
 
 		 1074 aa  42  0.007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  decreased coverage  0.00421599  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1181  response regulator, positive activator of uhpT transcription  36.36 
 
 		 318 aa  41.6  0.007  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  hitchhiker  0.0000000041551  decreased coverage  0.008996 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4636  LuxR family transcriptional regulator  39.56 
 
 		 378 aa  42  0.007  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.780635  normal  0.0614511 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0277  two component transcriptional regulator, LuxR family  45 
 
 		 228 aa  41.6  0.007  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0542563  normal  0.0298075 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2324  DNA-binding response regulator  32.76 
 
 		 217 aa  41.2  0.01  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>