79 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CPS_3443 on replicon NC_003910
Organism: Colwellia psychrerythraea 34H



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_003910  CPS_3443  LuxR family transcriptional regulator  100 
 
 		 154 aa  310  3.9999999999999997e-84  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1339  transcriptional regulator, LuxR family  63.01 
 
 		 188 aa  100  8e-21  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.919185 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1945  hypothetical protein  55.81 
 
 		 163 aa  98.6  2e-20  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3948  LuxR family transcriptional regulator  40.13 
 
 		 181 aa  96.7  1e-19  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3855  LuxR family transcriptional regulator  40.13 
 
 		 181 aa  96.3  1e-19  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3890  transcriptional regulator, LuxR family protein  38.99 
 
 		 174 aa  95.5  2e-19  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0102  response regulator receiver protein  40.76 
 
 		 175 aa  95.1  3e-19  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3794  LuxR family transcriptional regulator  35 
 
 		 179 aa  95.1  3e-19  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4438  LuxR family transcriptional regulator  40.76 
 
 		 181 aa  95.1  3e-19  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4298  response regulator receiver protein  40.76 
 
 		 181 aa  95.1  3e-19  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3851  transcriptional regulator, LuxR family  35.19 
 
 		 206 aa  95.1  3e-19  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.321989  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_4063  LuxR family transcriptional regulator  40.13 
 
 		 181 aa  94.7  4e-19  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4243  transcriptional regulator, LuxR family  40.76 
 
 		 181 aa  94  7e-19  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3937  transcriptional regulator, LuxR family  34.57 
 
 		 206 aa  93.6  9e-19  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.59446  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00101  transcriptional regulator, LuxR family protein  49.41 
 
 		 169 aa  93.2  1e-18  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2495  response regulator receiver protein  57.53 
 
 		 163 aa  88.6  3e-17  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3763  LuxR family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 176 aa  87.8  5e-17  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.415447 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3914  response regulator receiver protein  53.42 
 
 		 208 aa  86.3  2e-16  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0257494  normal  0.794446 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1034  transcriptional regulator  33.33 
 
 		 180 aa  79.7  0.00000000000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.130268  normal  0.442901 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1748  transcriptional regulator, LuxR family  50 
 
 		 146 aa  76.6  0.0000000000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.747406  normal  0.455372 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3628  two component LuxR family transcriptional regulator  39.34 
 
 		 225 aa  48.1  0.00005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.717242  normal  0.142765 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2887  LuxR family two component transcriptional regulator  39.34 
 
 		 225 aa  48.1  0.00005  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.526109  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_19250  transcriptional regulator, LuxR family  47.37 
 
 		 894 aa  46.6  0.0001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.368916  normal  0.454776 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0340  two component transcriptional regulator, LuxR family  45.45 
 
 		 217 aa  45.4  0.0003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00614189  hitchhiker  0.00317709 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1404  LuxR family transcriptional regulator  46.3 
 
 		 876 aa  44.7  0.0005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1370  LuxR family transcriptional regulator  46.3 
 
 		 881 aa  44.7  0.0005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1388  LuxR family transcriptional regulator  46.3 
 
 		 881 aa  44.7  0.0005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0315811  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_11330  response regulator containing a CheY-like receiver domain and an HTH DNA-binding domain  42.86 
 
 		 224 aa  44.3  0.0006  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.0103975 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4328  transcriptional regulator, LuxR family  30.53 
 
 		 260 aa  43.9  0.0007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  decreased coverage  0.00000000127099  normal  0.0225245 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3999  transcriptional regulator, LuxR family  30.53 
 
 		 260 aa  43.9  0.0009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  decreased coverage  0.0000000117104  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0016  LuxR family transcriptional regulator  34.33 
 
 		 267 aa  43.1  0.001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2627  two component transcriptional regulator, LuxR family  31.82 
 
 		 211 aa  43.1  0.001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1659  two component transcriptional regulator, LuxR family  42.86 
 
 		 207 aa  43.5  0.001  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.319135  normal  0.0403017 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5540  DNA-binding response regulator  41.38 
 
 		 215 aa  43.1  0.001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5591  DNA-binding response regulator  41.38 
 
 		 215 aa  43.1  0.001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5417  DNA-binding response regulator  41.38 
 
 		 215 aa  43.1  0.001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5535  DNA-binding response regulator  41.38 
 
 		 215 aa  43.5  0.001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2042  two component LuxR family transcriptional regulator  37.7 
 
 		 208 aa  43.1  0.001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0354  two component transcriptional regulator, LuxR family  39.19 
 
 		 222 aa  42.4  0.002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0065  two component transcriptional regulator, LuxR family  44.23 
 
 		 204 aa  42.7  0.002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2488  LuxR family transcriptional regulator  31.11 
 
 		 359 aa  42.4  0.002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.008035 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1015  transcriptional regulator, LuxR family  32.86 
 
 		 509 aa  42.7  0.002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.221092  normal  0.129145 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4161  regulatory protein LuxR  44.44 
 
 		 893 aa  42.7  0.002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.339617  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1267  two component LuxR family transcriptional regulator  32.95 
 
 		 216 aa  42.7  0.002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_13650  response regulator containing a CheY-like receiver domain protein and an HTH DNA-binding domain protein  47.06 
 
 		 464 aa  42.4  0.002  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1351  response regulator receiver protein  44.93 
 
 		 189 aa  42.4  0.002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.631825  normal  0.574707 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0925  response regulator receiver protein  40 
 
 		 119 aa  42.4  0.002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.592282  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2587  LuxR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 280 aa  42  0.003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0358062  normal  0.430196 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3251  LuxR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 280 aa  42.4  0.003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.139103 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3227  LuxR family transcriptional regulator  41.82 
 
 		 545 aa  42  0.003  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0186  response regulator receiver protein  32.58 
 
 		 213 aa  42  0.003  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  decreased coverage  0.00000327076  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2881  two component transcriptional regulator, LuxR family  31.4 
 
 		 212 aa  41.6  0.004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1493  transcriptional regulator, LuxR family  34.15 
 
 		 370 aa  41.6  0.004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2290  two component transcriptional regulator, LuxR family  43.64 
 
 		 208 aa  41.6  0.004  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  decreased coverage  0.00802134  hitchhiker  0.000628596 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5205  two component LuxR family transcriptional regulator  37.04 
 
 		 215 aa  41.6  0.004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2135  LuxR family transcriptional regulator  36.84 
 
 		 397 aa  41.6  0.004  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4199  regulatory protein, LuxR  37.04 
 
 		 855 aa  41.6  0.004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.142655 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12510  LuxR family transcriptional regulator  42.31 
 
 		 1137 aa  41.6  0.004  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000380393  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1034  two component transcriptional regulator, LuxR family  33.75 
 
 		 213 aa  41.2  0.005  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0782  response regulator receiver protein  31.67 
 
 		 370 aa  41.2  0.005  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.650923  normal  0.69982 
 
 
-
 
NC_002936  DET0432  LuxR family DNA-binding response regulator  36.84 
 
 		 232 aa  41.2  0.006  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.00543066  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1300  transcriptional regulator, LuxR family  43.64 
 
 		 910 aa  40.8  0.006  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.632041  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1005  two component transcriptional regulator, LuxR family  35.29 
 
 		 211 aa  41.2  0.006  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1855  LuxR family transcriptional regulator  38.6 
 
 		 76 aa  40.8  0.006  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.101838  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2402  LuxR family DNA-binding response regulator  37.14 
 
 		 209 aa  40.8  0.007  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000137953  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2414  two component transcriptional regulator, LuxR family  32.26 
 
 		 215 aa  40.8  0.007  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1688  LuxR family DNA-binding response regulator  37.14 
 
 		 209 aa  40.8  0.007  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.000000202542  normal  0.0533619 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2499  two component LuxR family transcriptional regulator  37.14 
 
 		 209 aa  40.8  0.007  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.449467  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5661  DNA-binding response regulator  39.66 
 
 		 215 aa  40.4  0.009  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5497  LuxR family transcriptional regulator  25.66 
 
 		 395 aa  40.4  0.009  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_374  DNA-binding response regulator, LuxR family  36.84 
 
 		 232 aa  40.4  0.009  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.0000120759  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5108  response regulator  39.66 
 
 		 215 aa  40.4  0.009  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.00235048  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5506  DNA-binding response regulator  39.66 
 
 		 215 aa  40.4  0.009  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5091  response regulator  39.66 
 
 		 215 aa  40.4  0.009  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5263  DNA-binding response regulator  39.66 
 
 		 215 aa  40.4  0.009  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.24037  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1580  two component transcriptional regulator, LuxR family  34.43 
 
 		 216 aa  40.4  0.01  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0409  two component LuxR family transcriptional regulator  36.84 
 
 		 232 aa  40  0.01  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.135269  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2848  two component transcriptional regulator, LuxR family  31.08 
 
 		 212 aa  40.4  0.01  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.857037  normal  0.944506 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1605  two component transcriptional regulator, LuxR family  34.43 
 
 		 216 aa  40.4  0.01  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>