158 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hlac_0030 on replicon NC_012029
Organism: Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012029  Hlac_0030  hypothetical protein  100 
 
 		 460 aa  913    Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.0419378 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3369  protein of unknown function DUF444  64.21 
 
 		 442 aa  540  9.999999999999999e-153  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.0981107  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0410  hypothetical protein  67.05 
 
 		 436 aa  534  1e-150  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2233  hypothetical protein  63.78 
 
 		 441 aa  526  1e-148  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.960863  normal  0.309285 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1748  protein of unknown function DUF444  61.97 
 
 		 441 aa  495  1e-139  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3528  hypothetical protein  36.6 
 
 		 369 aa  121  1.9999999999999998e-26  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0572559  normal  0.737881 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1380  hypothetical protein  36.08 
 
 		 369 aa  119  9.999999999999999e-26  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2209  hypothetical protein  37.57 
 
 		 367 aa  119  1.9999999999999998e-25  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4174  hypothetical protein  36.6 
 
 		 367 aa  112  1.0000000000000001e-23  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4654  protein of unknown function DUF444  35.23 
 
 		 368 aa  107  4e-22  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1229  hypothetical protein  34.38 
 
 		 368 aa  105  2e-21  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2636  hypothetical protein  32.81 
 
 		 368 aa  103  6e-21  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2730  hypothetical protein  32.81 
 
 		 368 aa  103  6e-21  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.237195  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2990  protein of unknown function DUF444  32.46 
 
 		 368 aa  102  1e-20  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1204  hypothetical protein  32.06 
 
 		 422 aa  102  2e-20  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2538  hypothetical protein  33.85 
 
 		 368 aa  102  2e-20  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.74871 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0490  hypothetical protein  32.42 
 
 		 398 aa  97.4  4e-19  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.924012  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2726  hypothetical protein  28.83 
 
 		 421 aa  94  5e-18  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2857  hypothetical protein  32.47 
 
 		 421 aa  93.6  6e-18  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1820  protein of unknown function DUF444  30.32 
 
 		 360 aa  92  2e-17  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.18081  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2049  hypothetical protein  28.92 
 
 		 420 aa  92  2e-17  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.390338  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1637  hypothetical protein  30.33 
 
 		 421 aa  92  2e-17  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0700293  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1741  hypothetical protein  28.92 
 
 		 420 aa  92.4  2e-17  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.118571  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3554  hypothetical protein  28.44 
 
 		 420 aa  91.3  3e-17  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1540  hypothetical protein  30.88 
 
 		 392 aa  90.9  5e-17  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.212388  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1333  hypothetical protein  30.88 
 
 		 392 aa  90.5  6e-17  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.181704  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0033  hypothetical protein  36.42 
 
 		 435 aa  90.1  7e-17  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.19629  normal  0.0885106 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3905  hypothetical protein  33.53 
 
 		 423 aa  89.4  1e-16  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.326986 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2216  hypothetical protein  30.04 
 
 		 422 aa  89  2e-16  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1922  hypothetical protein  30.1 
 
 		 423 aa  88.6  2e-16  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.111913  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0975  hypothetical protein  30.11 
 
 		 439 aa  88.2  3e-16  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1817  hypothetical protein  29.86 
 
 		 424 aa  87.4  4e-16  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00238162  normal  0.502951 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01540  hypothetical protein  28.78 
 
 		 431 aa  87.4  5e-16  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3005  hypothetical protein  36.5 
 
 		 376 aa  85.9  0.000000000000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1685  hypothetical protein  28.64 
 
 		 424 aa  85.9  0.000000000000001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.000901028  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2505  hypothetical protein  29.38 
 
 		 422 aa  85.5  0.000000000000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000420079  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3057  hypothetical protein  26.87 
 
 		 431 aa  85.5  0.000000000000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.833088  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1780  hypothetical protein  29.38 
 
 		 424 aa  85.5  0.000000000000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000829962  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1773  hypothetical protein  29.38 
 
 		 424 aa  85.5  0.000000000000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000000117853  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2447  hypothetical protein  27.96 
 
 		 428 aa  85.1  0.000000000000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.319583  normal  0.0698328 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2732  hypothetical protein  27.16 
 
 		 422 aa  85.9  0.000000000000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.66622  hitchhiker  0.00119744 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2328  hypothetical protein  35.17 
 
 		 422 aa  84.3  0.000000000000004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.40975  normal  0.858132 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2568  hypothetical protein  31.63 
 
 		 422 aa  84  0.000000000000005  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0567655  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1570  hypothetical protein  29.38 
 
 		 424 aa  84  0.000000000000005  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0194924  normal  0.404003 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1645  hypothetical protein  29.38 
 
 		 424 aa  84  0.000000000000005  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00220119  hitchhiker  0.00165359 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1961  hypothetical protein  30.39 
 
 		 422 aa  84  0.000000000000005  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.926778  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2883  hypothetical protein  29.38 
 
 		 422 aa  83.6  0.000000000000007  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2705  hypothetical protein  27.84 
 
 		 424 aa  83.6  0.000000000000007  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.139831  normal  0.527639 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1464  hypothetical protein  29.27 
 
 		 423 aa  83.2  0.000000000000008  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2157  hypothetical protein  27.49 
 
 		 428 aa  83.6  0.000000000000008  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.293839  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5140  hypothetical protein  29.94 
 
 		 423 aa  83.2  0.000000000000009  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003982  hypothetical protein  32.68 
 
 		 423 aa  83.2  0.000000000000009  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0546  hypothetical protein  32.45 
 
 		 423 aa  82.8  0.00000000000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3778  hypothetical protein  28.77 
 
 		 436 aa  82.4  0.00000000000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00112787 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2005  hypothetical protein  31.07 
 
 		 382 aa  82.4  0.00000000000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4018  hypothetical protein  34.81 
 
 		 423 aa  82.4  0.00000000000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1745  hypothetical protein  27.88 
 
 		 421 aa  82  0.00000000000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.427783  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1637  hypothetical protein  28.91 
 
 		 424 aa  82  0.00000000000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00171589  normal  0.194153 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1832  hypothetical protein  31.82 
 
 		 422 aa  81.6  0.00000000000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1028  hypothetical protein  28.82 
 
 		 438 aa  82  0.00000000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  decreased coverage  0.0000562968  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4632  hypothetical protein  34.07 
 
 		 423 aa  81.6  0.00000000000003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.209596 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1992  hypothetical protein  25.7 
 
 		 424 aa  81.6  0.00000000000003  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0160685  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0427  hypothetical protein  34.81 
 
 		 424 aa  81.6  0.00000000000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.225763  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2102  hypothetical protein  25.7 
 
 		 424 aa  81.6  0.00000000000003  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.277028  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_46880  hypothetical protein  32.59 
 
 		 424 aa  80.9  0.00000000000004  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0200  hypothetical protein  29.38 
 
 		 428 aa  80.9  0.00000000000004  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.315097 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1233  hypothetical protein  31.82 
 
 		 419 aa  80.9  0.00000000000005  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0534  hypothetical protein  33.33 
 
 		 300 aa  80.9  0.00000000000005  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.425338 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2207  hypothetical protein  26.83 
 
 		 422 aa  80.9  0.00000000000005  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0557869  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2256  hypothetical protein  28.17 
 
 		 424 aa  80.5  0.00000000000005  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4806  hypothetical protein  34.07 
 
 		 423 aa  80.5  0.00000000000005  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.146818  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0256  hypothetical protein  28.11 
 
 		 436 aa  80.5  0.00000000000006  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.149537  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3486  hypothetical protein  29.38 
 
 		 425 aa  80.1  0.00000000000008  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.769021  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0730  hypothetical protein  33.33 
 
 		 423 aa  80.1  0.00000000000008  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_07660  hypothetical protein  33.33 
 
 		 423 aa  80.1  0.00000000000009  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.159548 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0396  hypothetical protein  34.07 
 
 		 440 aa  79.7  0.0000000000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1960  hypothetical protein  28.17 
 
 		 424 aa  79.7  0.0000000000001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2386  hypothetical protein  27.5 
 
 		 424 aa  79.3  0.0000000000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1157  hypothetical protein  29.38 
 
 		 381 aa  79.7  0.0000000000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.250863  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0430  hypothetical protein  34.07 
 
 		 423 aa  79.7  0.0000000000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.220471  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1709  hypothetical protein  30.06 
 
 		 430 aa  79  0.0000000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0614013  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0882  hypothetical protein  32.29 
 
 		 426 aa  79  0.0000000000002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.796226  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3962  hypothetical protein  31.3 
 
 		 433 aa  79  0.0000000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0275062 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1228  hypothetical protein  30.34 
 
 		 423 aa  77.8  0.0000000000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.194655 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1377  hypothetical protein  27.31 
 
 		 428 aa  78.2  0.0000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.990404 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1394  hypothetical protein  27.31 
 
 		 428 aa  78.2  0.0000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000594429 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1410  hypothetical protein  27.31 
 
 		 428 aa  78.2  0.0000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.123931  normal  0.301036 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1891  hypothetical protein  27.31 
 
 		 428 aa  78.2  0.0000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.575016  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1978  hypothetical protein  30.86 
 
 		 425 aa  77.8  0.0000000000004  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.176712  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2032  hypothetical protein  27.27 
 
 		 427 aa  77.4  0.0000000000005  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2335  hypothetical protein  32.82 
 
 		 434 aa  77.4  0.0000000000005  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.617679 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2220  hypothetical protein  27.01 
 
 		 431 aa  77.4  0.0000000000005  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6313  hypothetical protein  31.82 
 
 		 425 aa  77.4  0.0000000000005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1870  hypothetical protein  27.62 
 
 		 427 aa  77.4  0.0000000000005  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.188375  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1407  hypothetical protein  27.62 
 
 		 427 aa  77.4  0.0000000000005  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.955409  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1858  protein of unknown function DUF444  27.27 
 
 		 427 aa  77  0.0000000000006  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0100922  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2021  hypothetical protein  32.82 
 
 		 432 aa  77  0.0000000000006  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2508  hypothetical protein  27.62 
 
 		 427 aa  77  0.0000000000006  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.482436  normal  0.930565 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1074  hypothetical protein  38.36 
 
 		 371 aa  77  0.0000000000006  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2060  hypothetical protein  32.82 
 
 		 434 aa  77.4  0.0000000000006  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.614387  normal  0.107647 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>