159 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smed_1028 on replicon NC_009636
Organism: Sinorhizobium medicae WSM419



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008254  Meso_0256  hypothetical protein  79.95 
 
 		 436 aa  686    Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.149537  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1028  hypothetical protein  100 
 
 		 438 aa  896    Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  decreased coverage  0.0000562968  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0975  hypothetical protein  70.37 
 
 		 439 aa  623  1e-177  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1222  hypothetical protein  51.51 
 
 		 430 aa  417  9.999999999999999e-116  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.134791 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0175  hypothetical protein  50.23 
 
 		 427 aa  414  1e-114  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.247119  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1692  hypothetical protein  51.04 
 
 		 426 aa  410  1e-113  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7068  hypothetical protein  51.04 
 
 		 436 aa  389  1e-107  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003982  hypothetical protein  45.1 
 
 		 423 aa  380  1e-104  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3962  hypothetical protein  51.16 
 
 		 433 aa  379  1e-104  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0275062 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1741  hypothetical protein  46.17 
 
 		 420 aa  375  1e-103  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.118571  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3778  hypothetical protein  44.59 
 
 		 436 aa  375  1e-103  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00112787 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2732  hypothetical protein  46 
 
 		 422 aa  376  1e-103  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.66622  hitchhiker  0.00119744 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0033  hypothetical protein  47.58 
 
 		 435 aa  373  1e-102  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.19629  normal  0.0885106 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2568  hypothetical protein  45.5 
 
 		 422 aa  373  1e-102  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0567655  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2857  hypothetical protein  45.5 
 
 		 421 aa  374  1e-102  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2726  hypothetical protein  45.5 
 
 		 421 aa  372  1e-102  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2026  hypothetical protein  44.7 
 
 		 421 aa  373  1e-102  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.924644  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1134  hypothetical protein  44.83 
 
 		 422 aa  372  1e-102  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1614  hypothetical protein  44.83 
 
 		 422 aa  372  1e-102  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0111312  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1690  hypothetical protein  44.7 
 
 		 421 aa  372  1e-102  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0559377  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0346  hypothetical protein  44.7 
 
 		 421 aa  372  1e-102  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.315691  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1862  hypothetical protein  44.7 
 
 		 421 aa  372  1e-102  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1874  hypothetical protein  44.7 
 
 		 421 aa  372  1e-102  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0815  hypothetical protein  44.7 
 
 		 421 aa  372  1e-102  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0982154  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01540  hypothetical protein  44.29 
 
 		 431 aa  372  1e-102  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1590  hypothetical protein  44.83 
 
 		 422 aa  372  1e-102  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.559411  normal  0.820493 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3486  hypothetical protein  42.03 
 
 		 425 aa  370  1e-101  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.769021  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5140  hypothetical protein  45.87 
 
 		 423 aa  369  1e-101  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4752  hypothetical protein  44.37 
 
 		 422 aa  369  1e-101  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0838769  normal  0.248269 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1529  hypothetical protein  44.83 
 
 		 422 aa  369  1e-101  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.508734  normal  0.741685 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2468  hypothetical protein  44.93 
 
 		 421 aa  371  1e-101  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.367874  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1228  hypothetical protein  44.6 
 
 		 423 aa  369  1e-101  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.194655 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6313  hypothetical protein  46.44 
 
 		 425 aa  371  1e-101  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1624  hypothetical protein  44.83 
 
 		 422 aa  370  1e-101  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.912678 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2021  hypothetical protein  49.07 
 
 		 432 aa  367  1e-100  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2006  hypothetical protein  45.03 
 
 		 423 aa  366  1e-100  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3905  hypothetical protein  45.27 
 
 		 423 aa  365  1e-100  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.326986 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1960  hypothetical protein  45.21 
 
 		 424 aa  367  1e-100  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1511  hypothetical protein  44.6 
 
 		 422 aa  368  1e-100  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.104475  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4018  hypothetical protein  45.16 
 
 		 423 aa  368  1e-100  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1992  hypothetical protein  43.94 
 
 		 424 aa  367  1e-100  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0160685  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_46880  hypothetical protein  46.08 
 
 		 424 aa  365  1e-100  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2102  hypothetical protein  43.94 
 
 		 424 aa  367  1e-100  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.277028  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6237  hypothetical protein  50 
 
 		 436 aa  366  1e-100  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0200  hypothetical protein  44.75 
 
 		 428 aa  365  1e-99  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.315097 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3554  hypothetical protein  44.57 
 
 		 420 aa  365  1e-99  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2256  hypothetical protein  44.75 
 
 		 424 aa  364  1e-99  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2819  hypothetical protein  47.79 
 
 		 423 aa  364  1e-99  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.203048  normal  0.510199 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3057  hypothetical protein  42.76 
 
 		 431 aa  365  1e-99  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.833088  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2256  hypothetical protein  44.8 
 
 		 423 aa  364  2e-99  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.286161  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02752  hypothetical protein  42.5 
 
 		 428 aa  363  2e-99  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.374771  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0546  hypothetical protein  45.24 
 
 		 423 aa  363  4e-99  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0427  hypothetical protein  44.87 
 
 		 424 aa  363  4e-99  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.225763  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2560  hypothetical protein  47.55 
 
 		 424 aa  363  5.0000000000000005e-99  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.253757  normal  0.99392 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1870  hypothetical protein  43.61 
 
 		 427 aa  362  6e-99  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.188375  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01753  hypothetical protein  43.38 
 
 		 427 aa  362  8e-99  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1858  protein of unknown function DUF444  43.38 
 
 		 427 aa  362  8e-99  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0100922  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4632  hypothetical protein  45.14 
 
 		 423 aa  362  8e-99  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.209596 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01741  hypothetical protein  43.38 
 
 		 427 aa  362  8e-99  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2508  hypothetical protein  43.38 
 
 		 427 aa  362  8e-99  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.482436  normal  0.930565 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2008  hypothetical protein  43.38 
 
 		 427 aa  362  8e-99  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1848  hypothetical protein  43.38 
 
 		 427 aa  362  8e-99  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.0243705 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4806  hypothetical protein  44.93 
 
 		 423 aa  362  9e-99  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.146818  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0430  hypothetical protein  45.16 
 
 		 423 aa  361  1e-98  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.220471  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1407  hypothetical protein  43.15 
 
 		 427 aa  361  1e-98  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.955409  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0396  hypothetical protein  45.24 
 
 		 440 aa  361  2e-98  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_07660  hypothetical protein  45.16 
 
 		 423 aa  360  2e-98  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.159548 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2032  hypothetical protein  43.38 
 
 		 427 aa  361  2e-98  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1464  hypothetical protein  44.19 
 
 		 423 aa  360  3e-98  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0730  hypothetical protein  45.06 
 
 		 423 aa  360  3e-98  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1745  hypothetical protein  40.88 
 
 		 421 aa  359  6e-98  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.427783  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2049  hypothetical protein  46.06 
 
 		 420 aa  357  1.9999999999999998e-97  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.390338  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1233  hypothetical protein  45.48 
 
 		 419 aa  357  2.9999999999999997e-97  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1709  hypothetical protein  43.22 
 
 		 430 aa  356  5e-97  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0614013  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1394  hypothetical protein  43.18 
 
 		 428 aa  354  2e-96  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000594429 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1393  hypothetical protein  40.27 
 
 		 427 aa  353  2e-96  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2072  hypothetical protein  43.18 
 
 		 428 aa  354  2e-96  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000406999 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1377  hypothetical protein  43.18 
 
 		 428 aa  354  2e-96  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.990404 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1410  hypothetical protein  43.18 
 
 		 428 aa  354  2e-96  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.123931  normal  0.301036 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1891  hypothetical protein  43.18 
 
 		 428 aa  354  2e-96  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.575016  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2335  hypothetical protein  48.61 
 
 		 434 aa  353  2.9999999999999997e-96  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.617679 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1978  hypothetical protein  43.61 
 
 		 425 aa  353  2.9999999999999997e-96  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.176712  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2207  hypothetical protein  42.3 
 
 		 422 aa  353  2.9999999999999997e-96  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0557869  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2328  hypothetical protein  42.79 
 
 		 422 aa  353  2.9999999999999997e-96  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.40975  normal  0.858132 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2060  hypothetical protein  48.61 
 
 		 434 aa  353  2.9999999999999997e-96  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.614387  normal  0.107647 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1961  hypothetical protein  41.94 
 
 		 422 aa  352  1e-95  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.926778  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2220  hypothetical protein  42.92 
 
 		 431 aa  350  2e-95  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2705  hypothetical protein  42.53 
 
 		 424 aa  350  3e-95  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.139831  normal  0.527639 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1670  hypothetical protein  43.15 
 
 		 427 aa  350  3e-95  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2216  hypothetical protein  44.6 
 
 		 422 aa  349  6e-95  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2386  hypothetical protein  42.86 
 
 		 424 aa  347  2e-94  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2883  hypothetical protein  43.55 
 
 		 422 aa  345  7e-94  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1637  hypothetical protein  42.26 
 
 		 421 aa  343  4e-93  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0700293  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2158  hypothetical protein  43.91 
 
 		 423 aa  341  2e-92  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0931116  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2157  hypothetical protein  41.94 
 
 		 428 aa  340  2.9999999999999998e-92  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.293839  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1832  hypothetical protein  41.47 
 
 		 422 aa  340  4e-92  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1685  hypothetical protein  43.09 
 
 		 424 aa  339  5e-92  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.000901028  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2505  hypothetical protein  42.86 
 
 		 422 aa  336  3.9999999999999995e-91  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000420079  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1780  hypothetical protein  42.86 
 
 		 424 aa  336  3.9999999999999995e-91  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000829962  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1817  hypothetical protein  42.63 
 
 		 424 aa  336  3.9999999999999995e-91  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00238162  normal  0.502951 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>