158 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plim_2990 on replicon NC_014148
Organism: Planctomyces limnophilus DSM 3776



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014148  Plim_2990  protein of unknown function DUF444  100 
 
 		 368 aa  759    Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4654  protein of unknown function DUF444  57.72 
 
 		 368 aa  432  1e-120  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1229  hypothetical protein  56.37 
 
 		 368 aa  423  1e-117  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4174  hypothetical protein  52.05 
 
 		 367 aa  413  1e-114  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2538  hypothetical protein  57.45 
 
 		 368 aa  410  1e-113  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.74871 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1380  hypothetical protein  53.59 
 
 		 369 aa  409  1e-113  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2636  hypothetical protein  57.18 
 
 		 368 aa  404  1e-111  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2730  hypothetical protein  57.18 
 
 		 368 aa  404  1e-111  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.237195  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3528  hypothetical protein  53.15 
 
 		 369 aa  394  1e-108  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0572559  normal  0.737881 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2209  hypothetical protein  53.59 
 
 		 367 aa  387  1e-106  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1820  protein of unknown function DUF444  37.19 
 
 		 360 aa  254  2.0000000000000002e-66  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.18081  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1157  hypothetical protein  34.69 
 
 		 381 aa  220  3e-56  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.250863  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0511  hypothetical protein  35.73 
 
 		 387 aa  206  4e-52  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2005  hypothetical protein  33.6 
 
 		 382 aa  204  2e-51  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0509  hypothetical protein  36.51 
 
 		 385 aa  203  4e-51  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00000608063  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0592  hypothetical protein  34.7 
 
 		 384 aa  200  3e-50  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1373  hypothetical protein  35.15 
 
 		 385 aa  196  6e-49  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0461  hypothetical protein  31.98 
 
 		 383 aa  192  6e-48  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.360542  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4751  hypothetical protein  34.25 
 
 		 391 aa  191  2e-47  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000719469 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0466  hypothetical protein  34.25 
 
 		 391 aa  191  2e-47  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0606  hypothetical protein  34.25 
 
 		 391 aa  190  2.9999999999999997e-47  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0519  hypothetical protein  34.25 
 
 		 391 aa  190  2.9999999999999997e-47  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0462  hypothetical protein  34.25 
 
 		 391 aa  190  2.9999999999999997e-47  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.781939  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0458  hypothetical protein  34.25 
 
 		 391 aa  190  2.9999999999999997e-47  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0551  hypothetical protein  34.25 
 
 		 391 aa  190  2.9999999999999997e-47  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0473  hypothetical protein  37.05 
 
 		 359 aa  191  2.9999999999999997e-47  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0587  hypothetical protein  33.97 
 
 		 391 aa  190  4e-47  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0626  hypothetical protein  35.86 
 
 		 366 aa  187  3e-46  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2508  hypothetical protein  33.79 
 
 		 394 aa  186  7e-46  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.000150245  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0552  hypothetical protein  35.57 
 
 		 366 aa  186  7e-46  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000241038 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3005  hypothetical protein  32.97 
 
 		 376 aa  185  1.0000000000000001e-45  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1074  hypothetical protein  31.58 
 
 		 371 aa  173  2.9999999999999996e-42  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1204  hypothetical protein  33.25 
 
 		 422 aa  173  3.9999999999999995e-42  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1333  hypothetical protein  28.88 
 
 		 392 aa  155  8e-37  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.181704  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1540  hypothetical protein  28.61 
 
 		 392 aa  153  5e-36  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.212388  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0490  hypothetical protein  32.8 
 
 		 398 aa  150  5e-35  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.924012  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0175  hypothetical protein  27.72 
 
 		 427 aa  132  1.0000000000000001e-29  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.247119  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4806  hypothetical protein  27.3 
 
 		 423 aa  130  5.0000000000000004e-29  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.146818  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1741  hypothetical protein  27.05 
 
 		 420 aa  130  5.0000000000000004e-29  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.118571  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0427  hypothetical protein  27.78 
 
 		 424 aa  129  8.000000000000001e-29  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.225763  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2158  hypothetical protein  27.9 
 
 		 423 aa  128  1.0000000000000001e-28  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0931116  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4018  hypothetical protein  27.86 
 
 		 423 aa  128  2.0000000000000002e-28  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1233  hypothetical protein  26.12 
 
 		 419 aa  127  4.0000000000000003e-28  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3057  hypothetical protein  27.72 
 
 		 431 aa  127  4.0000000000000003e-28  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.833088  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0546  hypothetical protein  26.94 
 
 		 423 aa  126  7e-28  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2049  hypothetical protein  26.63 
 
 		 420 aa  126  7e-28  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.390338  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4632  hypothetical protein  27.22 
 
 		 423 aa  125  8.000000000000001e-28  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.209596 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1228  hypothetical protein  26.47 
 
 		 423 aa  125  9e-28  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.194655 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3554  hypothetical protein  25.62 
 
 		 420 aa  125  1e-27  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2216  hypothetical protein  28.77 
 
 		 422 aa  125  1e-27  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0430  hypothetical protein  27.86 
 
 		 423 aa  125  1e-27  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.220471  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0396  hypothetical protein  27.86 
 
 		 440 aa  125  2e-27  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5140  hypothetical protein  27.3 
 
 		 423 aa  124  2e-27  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2256  hypothetical protein  26.23 
 
 		 423 aa  124  3e-27  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.286161  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2386  hypothetical protein  27.03 
 
 		 424 aa  124  3e-27  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3905  hypothetical protein  25.43 
 
 		 423 aa  124  4e-27  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.326986 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0730  hypothetical protein  27.22 
 
 		 423 aa  122  7e-27  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2006  hypothetical protein  25.98 
 
 		 423 aa  122  8e-27  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_07660  hypothetical protein  27.02 
 
 		 423 aa  122  9e-27  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.159548 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_46880  hypothetical protein  27.78 
 
 		 424 aa  122  9.999999999999999e-27  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0200  hypothetical protein  28.34 
 
 		 428 aa  122  9.999999999999999e-27  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.315097 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01540  hypothetical protein  25.43 
 
 		 431 aa  121  1.9999999999999998e-26  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2468  hypothetical protein  25.37 
 
 		 421 aa  120  3e-26  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.367874  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1978  hypothetical protein  24.1 
 
 		 425 aa  120  3e-26  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.176712  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3778  hypothetical protein  37.84 
 
 		 436 aa  120  3.9999999999999996e-26  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00112787 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2447  hypothetical protein  33.86 
 
 		 428 aa  120  3.9999999999999996e-26  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.319583  normal  0.0698328 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1960  hypothetical protein  24.75 
 
 		 424 aa  120  4.9999999999999996e-26  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0975  hypothetical protein  25.91 
 
 		 439 aa  120  4.9999999999999996e-26  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003982  hypothetical protein  25.43 
 
 		 423 aa  120  4.9999999999999996e-26  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1464  hypothetical protein  24.1 
 
 		 423 aa  120  4.9999999999999996e-26  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2568  hypothetical protein  24.88 
 
 		 422 aa  119  6e-26  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0567655  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1134  hypothetical protein  26.6 
 
 		 422 aa  119  6e-26  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1614  hypothetical protein  26.6 
 
 		 422 aa  119  6e-26  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0111312  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2256  hypothetical protein  24.5 
 
 		 424 aa  120  6e-26  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1992  hypothetical protein  25.99 
 
 		 424 aa  120  6e-26  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0160685  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2102  hypothetical protein  25.99 
 
 		 424 aa  120  6e-26  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.277028  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1590  hypothetical protein  26.6 
 
 		 422 aa  119  6e-26  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.559411  normal  0.820493 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1858  protein of unknown function DUF444  24.34 
 
 		 427 aa  119  7e-26  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0100922  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2732  hypothetical protein  25.74 
 
 		 422 aa  119  7e-26  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.66622  hitchhiker  0.00119744 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01753  hypothetical protein  24.34 
 
 		 427 aa  119  9e-26  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1410  hypothetical protein  24.04 
 
 		 428 aa  119  9e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.123931  normal  0.301036 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1394  hypothetical protein  24.04 
 
 		 428 aa  119  9e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000594429 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1377  hypothetical protein  24.04 
 
 		 428 aa  119  9e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.990404 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2072  hypothetical protein  24.04 
 
 		 428 aa  119  9e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000406999 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2508  hypothetical protein  24.34 
 
 		 427 aa  119  9e-26  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.482436  normal  0.930565 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01741  hypothetical protein  24.34 
 
 		 427 aa  119  9e-26  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2008  hypothetical protein  24.34 
 
 		 427 aa  119  9e-26  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1848  hypothetical protein  24.34 
 
 		 427 aa  119  9e-26  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.0243705 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1891  hypothetical protein  24.04 
 
 		 428 aa  119  9e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.575016  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2857  hypothetical protein  31.75 
 
 		 421 aa  118  9.999999999999999e-26  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2726  hypothetical protein  31.75 
 
 		 421 aa  118  9.999999999999999e-26  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2026  hypothetical protein  25.86 
 
 		 421 aa  119  9.999999999999999e-26  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.924644  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4752  hypothetical protein  26.73 
 
 		 422 aa  119  9.999999999999999e-26  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0838769  normal  0.248269 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1393  hypothetical protein  25.55 
 
 		 427 aa  119  9.999999999999999e-26  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1862  hypothetical protein  25.86 
 
 		 421 aa  119  9.999999999999999e-26  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1874  hypothetical protein  25.86 
 
 		 421 aa  119  9.999999999999999e-26  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1870  hypothetical protein  24.34 
 
 		 427 aa  119  9.999999999999999e-26  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.188375  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2328  hypothetical protein  25.85 
 
 		 422 aa  119  9.999999999999999e-26  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.40975  normal  0.858132 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1407  hypothetical protein  24.1 
 
 		 427 aa  118  9.999999999999999e-26  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.955409  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1511  hypothetical protein  27.78 
 
 		 422 aa  117  1.9999999999999998e-25  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.104475  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>