158 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cthe_1204 on replicon NC_009012
Organism: Clostridium thermocellum ATCC 27405



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009012  Cthe_1204  hypothetical protein  100 
 
 		 422 aa  856    Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0490  hypothetical protein  72.07 
 
 		 398 aa  539  9.999999999999999e-153  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.924012  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2508  hypothetical protein  50.24 
 
 		 394 aa  415  9.999999999999999e-116  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.000150245  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1540  hypothetical protein  52.97 
 
 		 392 aa  412  1e-114  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.212388  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1333  hypothetical protein  53.22 
 
 		 392 aa  412  1e-114  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.181704  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1157  hypothetical protein  41.34 
 
 		 381 aa  276  5e-73  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.250863  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2005  hypothetical protein  40.78 
 
 		 382 aa  269  5.9999999999999995e-71  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0509  hypothetical protein  39.29 
 
 		 385 aa  265  1e-69  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00000608063  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0587  hypothetical protein  39.14 
 
 		 391 aa  258  2e-67  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4751  hypothetical protein  39.14 
 
 		 391 aa  257  3e-67  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000719469 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0466  hypothetical protein  39.14 
 
 		 391 aa  256  5e-67  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0606  hypothetical protein  38.89 
 
 		 391 aa  254  2.0000000000000002e-66  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0519  hypothetical protein  38.89 
 
 		 391 aa  254  2.0000000000000002e-66  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0462  hypothetical protein  38.89 
 
 		 391 aa  254  2.0000000000000002e-66  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.781939  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0458  hypothetical protein  38.89 
 
 		 391 aa  254  2.0000000000000002e-66  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0551  hypothetical protein  38.89 
 
 		 391 aa  254  2.0000000000000002e-66  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0511  hypothetical protein  39.16 
 
 		 387 aa  253  6e-66  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1373  hypothetical protein  36.73 
 
 		 385 aa  249  5e-65  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0592  hypothetical protein  38.44 
 
 		 384 aa  249  7e-65  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3005  hypothetical protein  38.96 
 
 		 376 aa  246  6e-64  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0473  hypothetical protein  39.78 
 
 		 359 aa  242  7.999999999999999e-63  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0626  hypothetical protein  40.29 
 
 		 366 aa  240  2.9999999999999997e-62  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0552  hypothetical protein  40.29 
 
 		 366 aa  240  4e-62  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000241038 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1074  hypothetical protein  36.12 
 
 		 371 aa  232  7.000000000000001e-60  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0461  hypothetical protein  34.62 
 
 		 383 aa  225  1e-57  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.360542  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1741  hypothetical protein  31.73 
 
 		 420 aa  209  6e-53  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.118571  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1464  hypothetical protein  32.93 
 
 		 423 aa  206  6e-52  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3057  hypothetical protein  31.75 
 
 		 431 aa  204  2e-51  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.833088  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01540  hypothetical protein  33.97 
 
 		 431 aa  204  2e-51  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003982  hypothetical protein  33.89 
 
 		 423 aa  202  8e-51  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2256  hypothetical protein  31.85 
 
 		 424 aa  201  1.9999999999999998e-50  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1960  hypothetical protein  32.32 
 
 		 424 aa  201  1.9999999999999998e-50  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2049  hypothetical protein  31.73 
 
 		 420 aa  200  3e-50  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.390338  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01753  hypothetical protein  32.3 
 
 		 427 aa  198  1.0000000000000001e-49  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1858  protein of unknown function DUF444  32.3 
 
 		 427 aa  198  1.0000000000000001e-49  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0100922  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3554  hypothetical protein  31.25 
 
 		 420 aa  198  1.0000000000000001e-49  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01741  hypothetical protein  32.3 
 
 		 427 aa  198  1.0000000000000001e-49  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2008  hypothetical protein  32.3 
 
 		 427 aa  198  1.0000000000000001e-49  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1848  hypothetical protein  32.3 
 
 		 427 aa  198  1.0000000000000001e-49  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.0243705 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2508  hypothetical protein  32.3 
 
 		 427 aa  198  1.0000000000000001e-49  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.482436  normal  0.930565 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2207  hypothetical protein  33.01 
 
 		 422 aa  197  2.0000000000000003e-49  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0557869  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3905  hypothetical protein  31.33 
 
 		 423 aa  198  2.0000000000000003e-49  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.326986 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1870  hypothetical protein  32.3 
 
 		 427 aa  198  2.0000000000000003e-49  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.188375  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2732  hypothetical protein  31.68 
 
 		 422 aa  198  2.0000000000000003e-49  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.66622  hitchhiker  0.00119744 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2032  hypothetical protein  32.06 
 
 		 427 aa  197  3e-49  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1407  hypothetical protein  32.06 
 
 		 427 aa  197  4.0000000000000005e-49  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.955409  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1992  hypothetical protein  32.37 
 
 		 424 aa  196  5.000000000000001e-49  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0160685  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2102  hypothetical protein  32.37 
 
 		 424 aa  196  5.000000000000001e-49  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.277028  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1393  hypothetical protein  33.49 
 
 		 427 aa  196  6e-49  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2220  hypothetical protein  31.38 
 
 		 431 aa  195  1e-48  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1690  hypothetical protein  31.89 
 
 		 421 aa  194  2e-48  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0559377  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0346  hypothetical protein  31.89 
 
 		 421 aa  194  2e-48  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.315691  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0815  hypothetical protein  31.89 
 
 		 421 aa  194  2e-48  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0982154  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1745  hypothetical protein  33.57 
 
 		 421 aa  193  4e-48  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.427783  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1228  hypothetical protein  32.54 
 
 		 423 aa  192  7e-48  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.194655 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2026  hypothetical protein  32.22 
 
 		 421 aa  192  8e-48  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.924644  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1862  hypothetical protein  31.89 
 
 		 421 aa  192  8e-48  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1874  hypothetical protein  31.89 
 
 		 421 aa  192  8e-48  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2072  hypothetical protein  31.34 
 
 		 428 aa  191  2e-47  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000406999 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1410  hypothetical protein  31.34 
 
 		 428 aa  191  2e-47  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.123931  normal  0.301036 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1377  hypothetical protein  31.34 
 
 		 428 aa  191  2e-47  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.990404 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1891  hypothetical protein  31.34 
 
 		 428 aa  191  2e-47  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.575016  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1394  hypothetical protein  31.34 
 
 		 428 aa  191  2e-47  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000594429 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1511  hypothetical protein  32.13 
 
 		 422 aa  191  2.9999999999999997e-47  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.104475  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1670  hypothetical protein  31.49 
 
 		 427 aa  191  2.9999999999999997e-47  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2006  hypothetical protein  31.33 
 
 		 423 aa  190  4e-47  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1529  hypothetical protein  32.13 
 
 		 422 aa  190  4e-47  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.508734  normal  0.741685 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2256  hypothetical protein  32.05 
 
 		 423 aa  190  5e-47  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.286161  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4752  hypothetical protein  31.89 
 
 		 422 aa  190  5e-47  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0838769  normal  0.248269 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1134  hypothetical protein  31.89 
 
 		 422 aa  190  5e-47  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1614  hypothetical protein  31.89 
 
 		 422 aa  190  5e-47  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0111312  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1624  hypothetical protein  32.13 
 
 		 422 aa  190  5e-47  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.912678 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1590  hypothetical protein  31.89 
 
 		 422 aa  190  5e-47  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.559411  normal  0.820493 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2857  hypothetical protein  33.09 
 
 		 421 aa  189  1e-46  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2568  hypothetical protein  32.61 
 
 		 422 aa  188  1e-46  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0567655  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2468  hypothetical protein  31.74 
 
 		 421 aa  188  2e-46  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.367874  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2726  hypothetical protein  33.33 
 
 		 421 aa  187  3e-46  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02752  hypothetical protein  31.4 
 
 		 428 aa  187  4e-46  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.374771  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1978  hypothetical protein  31.86 
 
 		 425 aa  186  6e-46  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.176712  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4174  hypothetical protein  34.26 
 
 		 367 aa  186  9e-46  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_07660  hypothetical protein  30.95 
 
 		 423 aa  186  1.0000000000000001e-45  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.159548 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0730  hypothetical protein  30.95 
 
 		 423 aa  186  1.0000000000000001e-45  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5140  hypothetical protein  31.33 
 
 		 423 aa  183  4.0000000000000006e-45  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4018  hypothetical protein  31.01 
 
 		 423 aa  182  7e-45  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2386  hypothetical protein  31.88 
 
 		 424 aa  182  9.000000000000001e-45  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3486  hypothetical protein  32.45 
 
 		 425 aa  182  1e-44  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.769021  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1961  hypothetical protein  32.77 
 
 		 422 aa  180  2.9999999999999997e-44  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.926778  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2328  hypothetical protein  30.19 
 
 		 422 aa  180  2.9999999999999997e-44  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.40975  normal  0.858132 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0546  hypothetical protein  31.65 
 
 		 423 aa  179  7e-44  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2216  hypothetical protein  32.29 
 
 		 422 aa  179  8e-44  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1233  hypothetical protein  30.92 
 
 		 419 aa  178  1e-43  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2158  hypothetical protein  31.81 
 
 		 423 aa  178  1e-43  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0931116  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1637  hypothetical protein  33.09 
 
 		 421 aa  179  1e-43  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0700293  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0396  hypothetical protein  31.34 
 
 		 440 aa  178  2e-43  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0430  hypothetical protein  31.26 
 
 		 423 aa  178  2e-43  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.220471  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4806  hypothetical protein  31.26 
 
 		 423 aa  178  2e-43  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.146818  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_46880  hypothetical protein  30.31 
 
 		 424 aa  177  4e-43  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1832  hypothetical protein  32.93 
 
 		 422 aa  176  5e-43  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1380  hypothetical protein  33.5 
 
 		 369 aa  177  5e-43  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0427  hypothetical protein  30.94 
 
 		 424 aa  177  5e-43  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.225763  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>