158 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CPS_3486 on replicon NC_003910
Organism: Colwellia psychrerythraea 34H



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_003910  CPS_3486  hypothetical protein  100 
 
 		 425 aa  887    Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.769021  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02752  hypothetical protein  66.04 
 
 		 428 aa  600  1e-170  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.374771  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1745  hypothetical protein  67.3 
 
 		 421 aa  592  1e-168  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.427783  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1992  hypothetical protein  66.51 
 
 		 424 aa  586  1e-166  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0160685  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2102  hypothetical protein  66.51 
 
 		 424 aa  586  1e-166  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.277028  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2883  hypothetical protein  69.21 
 
 		 422 aa  582  1.0000000000000001e-165  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1832  hypothetical protein  68.5 
 
 		 422 aa  582  1.0000000000000001e-165  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1685  hypothetical protein  70.17 
 
 		 424 aa  581  1.0000000000000001e-165  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.000901028  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2732  hypothetical protein  65.8 
 
 		 422 aa  583  1.0000000000000001e-165  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.66622  hitchhiker  0.00119744 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1961  hypothetical protein  69.21 
 
 		 422 aa  583  1.0000000000000001e-165  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.926778  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1407  hypothetical protein  64.47 
 
 		 427 aa  578  1e-164  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.955409  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1960  hypothetical protein  65.56 
 
 		 424 aa  580  1e-164  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01753  hypothetical protein  64.24 
 
 		 427 aa  577  1.0000000000000001e-163  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1858  protein of unknown function DUF444  64.24 
 
 		 427 aa  577  1.0000000000000001e-163  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0100922  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003982  hypothetical protein  63.74 
 
 		 423 aa  574  1.0000000000000001e-163  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2256  hypothetical protein  64.61 
 
 		 424 aa  576  1.0000000000000001e-163  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2032  hypothetical protein  64 
 
 		 427 aa  576  1.0000000000000001e-163  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01741  hypothetical protein  64.24 
 
 		 427 aa  577  1.0000000000000001e-163  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1393  hypothetical protein  64.59 
 
 		 427 aa  574  1.0000000000000001e-163  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2508  hypothetical protein  64.24 
 
 		 427 aa  577  1.0000000000000001e-163  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.482436  normal  0.930565 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1870  hypothetical protein  64 
 
 		 427 aa  577  1.0000000000000001e-163  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.188375  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2008  hypothetical protein  64.24 
 
 		 427 aa  577  1.0000000000000001e-163  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1848  hypothetical protein  64.24 
 
 		 427 aa  577  1.0000000000000001e-163  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.0243705 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1410  hypothetical protein  65.25 
 
 		 428 aa  574  1.0000000000000001e-162  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.123931  normal  0.301036 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2072  hypothetical protein  65.25 
 
 		 428 aa  574  1.0000000000000001e-162  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000406999 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1670  hypothetical protein  64.24 
 
 		 427 aa  574  1.0000000000000001e-162  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1377  hypothetical protein  65.25 
 
 		 428 aa  574  1.0000000000000001e-162  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.990404 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1891  hypothetical protein  65.25 
 
 		 428 aa  574  1.0000000000000001e-162  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.575016  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1394  hypothetical protein  65.25 
 
 		 428 aa  574  1.0000000000000001e-162  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000594429 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2447  hypothetical protein  69.45 
 
 		 428 aa  572  1.0000000000000001e-162  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.319583  normal  0.0698328 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2157  hypothetical protein  69.69 
 
 		 428 aa  572  1.0000000000000001e-162  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.293839  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01540  hypothetical protein  63.33 
 
 		 431 aa  570  1e-161  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2505  hypothetical protein  68.97 
 
 		 422 aa  567  1e-160  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000420079  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1780  hypothetical protein  68.97 
 
 		 424 aa  567  1e-160  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000829962  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1773  hypothetical protein  68.97 
 
 		 424 aa  567  1e-160  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000000117853  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1817  hypothetical protein  68.5 
 
 		 424 aa  565  1e-160  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00238162  normal  0.502951 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2220  hypothetical protein  63.98 
 
 		 431 aa  565  1e-160  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2207  hypothetical protein  64.92 
 
 		 422 aa  563  1.0000000000000001e-159  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0557869  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1570  hypothetical protein  69.69 
 
 		 424 aa  563  1.0000000000000001e-159  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0194924  normal  0.404003 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1645  hypothetical protein  69.69 
 
 		 424 aa  563  1.0000000000000001e-159  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00220119  hitchhiker  0.00165359 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1637  hypothetical protein  69.45 
 
 		 424 aa  561  1.0000000000000001e-159  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00171589  normal  0.194153 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1922  hypothetical protein  67.62 
 
 		 423 aa  564  1.0000000000000001e-159  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.111913  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1637  hypothetical protein  66.83 
 
 		 421 aa  558  1e-158  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0700293  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1464  hypothetical protein  63.81 
 
 		 423 aa  560  1e-158  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1978  hypothetical protein  64 
 
 		 425 aa  558  1e-158  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.176712  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2568  hypothetical protein  57.72 
 
 		 422 aa  508  1e-143  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0567655  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2857  hypothetical protein  56.24 
 
 		 421 aa  495  1e-139  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4018  hypothetical protein  56.84 
 
 		 423 aa  495  1e-139  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2726  hypothetical protein  56 
 
 		 421 aa  490  1e-137  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_46880  hypothetical protein  56.67 
 
 		 424 aa  487  1e-136  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0427  hypothetical protein  55.48 
 
 		 424 aa  485  1e-136  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.225763  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_07660  hypothetical protein  54.76 
 
 		 423 aa  481  1e-135  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.159548 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5140  hypothetical protein  55.95 
 
 		 423 aa  480  1e-134  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3057  hypothetical protein  54.21 
 
 		 431 aa  479  1e-134  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.833088  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0730  hypothetical protein  54.52 
 
 		 423 aa  481  1e-134  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0396  hypothetical protein  55.24 
 
 		 440 aa  478  1e-133  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4632  hypothetical protein  54.48 
 
 		 423 aa  478  1e-133  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.209596 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0200  hypothetical protein  53.61 
 
 		 428 aa  477  1e-133  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.315097 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0430  hypothetical protein  55.24 
 
 		 423 aa  477  1e-133  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.220471  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4806  hypothetical protein  55.24 
 
 		 423 aa  477  1e-133  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.146818  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0546  hypothetical protein  54.01 
 
 		 423 aa  474  1e-132  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2026  hypothetical protein  52.48 
 
 		 421 aa  468  9.999999999999999e-131  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.924644  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4752  hypothetical protein  52.37 
 
 		 422 aa  467  9.999999999999999e-131  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0838769  normal  0.248269 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1134  hypothetical protein  52.61 
 
 		 422 aa  468  9.999999999999999e-131  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1614  hypothetical protein  52.61 
 
 		 422 aa  468  9.999999999999999e-131  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0111312  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1690  hypothetical protein  52.25 
 
 		 421 aa  465  9.999999999999999e-131  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0559377  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3778  hypothetical protein  51.85 
 
 		 436 aa  466  9.999999999999999e-131  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00112787 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0346  hypothetical protein  52.25 
 
 		 421 aa  465  9.999999999999999e-131  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.315691  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1862  hypothetical protein  52.25 
 
 		 421 aa  466  9.999999999999999e-131  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1874  hypothetical protein  52.25 
 
 		 421 aa  466  9.999999999999999e-131  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0815  hypothetical protein  52.25 
 
 		 421 aa  465  9.999999999999999e-131  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0982154  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1624  hypothetical protein  53.08 
 
 		 422 aa  466  9.999999999999999e-131  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.912678 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1590  hypothetical protein  52.61 
 
 		 422 aa  468  9.999999999999999e-131  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.559411  normal  0.820493 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1529  hypothetical protein  52.37 
 
 		 422 aa  462  1e-129  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.508734  normal  0.741685 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2468  hypothetical protein  52.01 
 
 		 421 aa  463  1e-129  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.367874  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0732  hypothetical protein  58.16 
 
 		 424 aa  461  1e-129  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1511  hypothetical protein  52.13 
 
 		 422 aa  462  1e-129  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.104475  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1233  hypothetical protein  51.78 
 
 		 419 aa  455  1e-127  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2386  hypothetical protein  52.26 
 
 		 424 aa  457  1e-127  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1228  hypothetical protein  50.94 
 
 		 423 aa  455  1e-127  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.194655 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1741  hypothetical protein  49.05 
 
 		 420 aa  448  1e-125  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.118571  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2006  hypothetical protein  50.71 
 
 		 423 aa  449  1e-125  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2256  hypothetical protein  50.71 
 
 		 423 aa  449  1e-125  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.286161  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2216  hypothetical protein  51.2 
 
 		 422 aa  446  1.0000000000000001e-124  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2328  hypothetical protein  50.71 
 
 		 422 aa  443  1e-123  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.40975  normal  0.858132 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2705  hypothetical protein  52.12 
 
 		 424 aa  439  9.999999999999999e-123  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.139831  normal  0.527639 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1709  hypothetical protein  49.53 
 
 		 430 aa  440  9.999999999999999e-123  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0614013  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2158  hypothetical protein  50 
 
 		 423 aa  437  1e-121  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0931116  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0882  hypothetical protein  52.58 
 
 		 426 aa  430  1e-119  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.796226  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2049  hypothetical protein  48.1 
 
 		 420 aa  424  1e-117  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.390338  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3905  hypothetical protein  47.51 
 
 		 423 aa  420  1e-116  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.326986 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3554  hypothetical protein  47.03 
 
 		 420 aa  416  9.999999999999999e-116  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0975  hypothetical protein  41.51 
 
 		 439 aa  369  1e-101  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0256  hypothetical protein  42.43 
 
 		 436 aa  370  1e-101  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.149537  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1222  hypothetical protein  44.88 
 
 		 430 aa  369  1e-101  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.134791 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1692  hypothetical protein  44.79 
 
 		 426 aa  367  1e-100  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1028  hypothetical protein  42.03 
 
 		 438 aa  364  1e-99  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  decreased coverage  0.0000562968  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0175  hypothetical protein  45.15 
 
 		 427 aa  363  3e-99  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.247119  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6313  hypothetical protein  39.62 
 
 		 425 aa  344  2e-93  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2560  hypothetical protein  40.66 
 
 		 424 aa  333  4e-90  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.253757  normal  0.99392 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>