159 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PC1_1960 on replicon NC_012917
Organism: Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
CP001509  ECD_01753  hypothetical protein  85.51 
 
 		 427 aa  744    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1858  protein of unknown function DUF444  85.51 
 
 		 427 aa  744    Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0100922  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2508  hypothetical protein  85.51 
 
 		 427 aa  744    Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.482436  normal  0.930565 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2256  hypothetical protein  98.11 
 
 		 424 aa  871    Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1410  hypothetical protein  86.59 
 
 		 428 aa  733    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.123931  normal  0.301036 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2072  hypothetical protein  86.59 
 
 		 428 aa  733    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000406999 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1670  hypothetical protein  86.02 
 
 		 427 aa  746    Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2032  hypothetical protein  85.27 
 
 		 427 aa  743    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1377  hypothetical protein  86.59 
 
 		 428 aa  733    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.990404 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1394  hypothetical protein  86.59 
 
 		 428 aa  733    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000594429 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01741  hypothetical protein  85.51 
 
 		 427 aa  744    Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1992  hypothetical protein  86.02 
 
 		 424 aa  743    Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0160685  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01540  hypothetical protein  71.87 
 
 		 431 aa  640    Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1870  hypothetical protein  85.27 
 
 		 427 aa  743    Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.188375  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2008  hypothetical protein  85.51 
 
 		 427 aa  744    Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2732  hypothetical protein  88.15 
 
 		 422 aa  761    Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.66622  hitchhiker  0.00119744 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1891  hypothetical protein  86.59 
 
 		 428 aa  733    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.575016  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1978  hypothetical protein  86.56 
 
 		 425 aa  746    Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.176712  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003982  hypothetical protein  72.58 
 
 		 423 aa  644    Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2102  hypothetical protein  86.02 
 
 		 424 aa  743    Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.277028  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1848  hypothetical protein  85.51 
 
 		 427 aa  744    Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.0243705 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1407  hypothetical protein  85.27 
 
 		 427 aa  743    Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.955409  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1960  hypothetical protein  100 
 
 		 424 aa  887    Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2220  hypothetical protein  87.71 
 
 		 431 aa  763    Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1464  hypothetical protein  71.97 
 
 		 423 aa  626  1e-178  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2207  hypothetical protein  71.19 
 
 		 422 aa  600  1e-170  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0557869  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02752  hypothetical protein  68.74 
 
 		 428 aa  599  1e-170  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.374771  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1832  hypothetical protein  70.14 
 
 		 422 aa  588  1e-167  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1393  hypothetical protein  65.79 
 
 		 427 aa  585  1e-166  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1745  hypothetical protein  66.59 
 
 		 421 aa  585  1e-166  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.427783  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2883  hypothetical protein  68.87 
 
 		 422 aa  582  1.0000000000000001e-165  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1637  hypothetical protein  69.91 
 
 		 421 aa  581  1.0000000000000001e-165  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0700293  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3486  hypothetical protein  65.56 
 
 		 425 aa  580  1e-164  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.769021  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1961  hypothetical protein  68.25 
 
 		 422 aa  579  1e-164  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.926778  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2157  hypothetical protein  69.67 
 
 		 428 aa  575  1.0000000000000001e-163  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.293839  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1922  hypothetical protein  71.16 
 
 		 423 aa  573  1.0000000000000001e-162  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.111913  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2447  hypothetical protein  69.91 
 
 		 428 aa  573  1.0000000000000001e-162  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.319583  normal  0.0698328 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1780  hypothetical protein  69.18 
 
 		 424 aa  565  1e-160  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000829962  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1685  hypothetical protein  68.71 
 
 		 424 aa  566  1e-160  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.000901028  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1773  hypothetical protein  69.18 
 
 		 424 aa  565  1e-160  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000000117853  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2505  hypothetical protein  69.18 
 
 		 422 aa  565  1e-160  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000420079  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1817  hypothetical protein  68.94 
 
 		 424 aa  563  1.0000000000000001e-159  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00238162  normal  0.502951 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1570  hypothetical protein  68.71 
 
 		 424 aa  559  1e-158  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0194924  normal  0.404003 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1645  hypothetical protein  68.71 
 
 		 424 aa  559  1e-158  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00220119  hitchhiker  0.00165359 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1637  hypothetical protein  68.47 
 
 		 424 aa  557  1e-157  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00171589  normal  0.194153 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_46880  hypothetical protein  60.33 
 
 		 424 aa  513  1e-144  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_07660  hypothetical protein  58.96 
 
 		 423 aa  514  1e-144  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.159548 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0730  hypothetical protein  58.96 
 
 		 423 aa  513  1e-144  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4018  hypothetical protein  58.02 
 
 		 423 aa  509  1e-143  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3057  hypothetical protein  56.88 
 
 		 431 aa  506  9.999999999999999e-143  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.833088  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0427  hypothetical protein  58.43 
 
 		 424 aa  506  9.999999999999999e-143  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.225763  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0396  hypothetical protein  58.19 
 
 		 440 aa  503  1e-141  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0546  hypothetical protein  57.08 
 
 		 423 aa  502  1e-141  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5140  hypothetical protein  58.39 
 
 		 423 aa  503  1e-141  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0430  hypothetical protein  58.19 
 
 		 423 aa  504  1e-141  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.220471  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4632  hypothetical protein  57.08 
 
 		 423 aa  500  1e-140  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.209596 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4806  hypothetical protein  57.48 
 
 		 423 aa  500  1e-140  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.146818  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2857  hypothetical protein  55.53 
 
 		 421 aa  493  9.999999999999999e-139  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2568  hypothetical protein  55.95 
 
 		 422 aa  486  1e-136  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0567655  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2726  hypothetical protein  54.5 
 
 		 421 aa  488  1e-136  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1741  hypothetical protein  53.9 
 
 		 420 aa  487  1e-136  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.118571  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1233  hypothetical protein  54.39 
 
 		 419 aa  476  1e-133  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2705  hypothetical protein  54.12 
 
 		 424 aa  474  1e-132  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.139831  normal  0.527639 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0732  hypothetical protein  58.35 
 
 		 424 aa  468  1.0000000000000001e-131  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2049  hypothetical protein  53.43 
 
 		 420 aa  466  9.999999999999999e-131  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.390338  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3554  hypothetical protein  52.02 
 
 		 420 aa  461  1e-129  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1228  hypothetical protein  55.37 
 
 		 423 aa  463  1e-129  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.194655 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3905  hypothetical protein  52.94 
 
 		 423 aa  462  1e-129  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.326986 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3778  hypothetical protein  51.4 
 
 		 436 aa  458  9.999999999999999e-129  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00112787 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1134  hypothetical protein  54.55 
 
 		 422 aa  454  1e-127  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1614  hypothetical protein  54.55 
 
 		 422 aa  454  1e-127  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0111312  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1590  hypothetical protein  54.55 
 
 		 422 aa  454  1e-127  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.559411  normal  0.820493 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1529  hypothetical protein  54.55 
 
 		 422 aa  452  1.0000000000000001e-126  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.508734  normal  0.741685 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2026  hypothetical protein  54.07 
 
 		 421 aa  452  1.0000000000000001e-126  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.924644  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4752  hypothetical protein  54.31 
 
 		 422 aa  454  1.0000000000000001e-126  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0838769  normal  0.248269 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2006  hypothetical protein  54.65 
 
 		 423 aa  452  1.0000000000000001e-126  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2256  hypothetical protein  54.78 
 
 		 423 aa  452  1.0000000000000001e-126  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.286161  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2468  hypothetical protein  53.83 
 
 		 421 aa  449  1e-125  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.367874  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1709  hypothetical protein  51.77 
 
 		 430 aa  450  1e-125  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0614013  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1511  hypothetical protein  54.31 
 
 		 422 aa  451  1e-125  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.104475  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0200  hypothetical protein  51.76 
 
 		 428 aa  450  1e-125  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.315097 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1690  hypothetical protein  54.07 
 
 		 421 aa  450  1e-125  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0559377  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0346  hypothetical protein  54.07 
 
 		 421 aa  450  1e-125  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.315691  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1862  hypothetical protein  54.07 
 
 		 421 aa  451  1e-125  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1874  hypothetical protein  54.07 
 
 		 421 aa  451  1e-125  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0815  hypothetical protein  54.07 
 
 		 421 aa  450  1e-125  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0982154  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1624  hypothetical protein  54.78 
 
 		 422 aa  449  1e-125  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.912678 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2216  hypothetical protein  52.25 
 
 		 422 aa  444  1e-123  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0882  hypothetical protein  55.74 
 
 		 426 aa  443  1e-123  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.796226  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2328  hypothetical protein  51.31 
 
 		 422 aa  443  1e-123  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.40975  normal  0.858132 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2158  hypothetical protein  51.68 
 
 		 423 aa  439  9.999999999999999e-123  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0931116  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2386  hypothetical protein  51.44 
 
 		 424 aa  440  9.999999999999999e-123  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1692  hypothetical protein  47.89 
 
 		 426 aa  381  1e-104  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1222  hypothetical protein  48.24 
 
 		 430 aa  370  1e-101  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.134791 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0175  hypothetical protein  46.96 
 
 		 427 aa  370  1e-101  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.247119  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0975  hypothetical protein  41.51 
 
 		 439 aa  360  2e-98  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1028  hypothetical protein  44.06 
 
 		 438 aa  360  3e-98  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  decreased coverage  0.0000562968  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6313  hypothetical protein  42.35 
 
 		 425 aa  360  4e-98  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0256  hypothetical protein  41.61 
 
 		 436 aa  354  1e-96  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.149537  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7068  hypothetical protein  44.52 
 
 		 436 aa  343  2.9999999999999997e-93  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>