159 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pput_0430 on replicon NC_009512
Organism: Pseudomonas putida F1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002947  PP_0396  hypothetical protein  100 
 
 		 440 aa  877    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0546  hypothetical protein  90.31 
 
 		 423 aa  780    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4632  hypothetical protein  90.54 
 
 		 423 aa  780    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.209596 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5140  hypothetical protein  90.78 
 
 		 423 aa  781    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_46880  hypothetical protein  86.08 
 
 		 424 aa  754    Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_07660  hypothetical protein  87.94 
 
 		 423 aa  769    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.159548 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4018  hypothetical protein  89.83 
 
 		 423 aa  785    Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0430  hypothetical protein  100 
 
 		 423 aa  879    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.220471  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0730  hypothetical protein  87.94 
 
 		 423 aa  769    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0427  hypothetical protein  98.58 
 
 		 424 aa  846    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.225763  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4806  hypothetical protein  98.11 
 
 		 423 aa  865    Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.146818  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3057  hypothetical protein  62 
 
 		 431 aa  570  1e-161  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.833088  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2705  hypothetical protein  61.47 
 
 		 424 aa  551  1e-155  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.139831  normal  0.527639 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0732  hypothetical protein  65.57 
 
 		 424 aa  530  1e-149  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02752  hypothetical protein  58.81 
 
 		 428 aa  511  1e-144  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.374771  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003982  hypothetical protein  58.96 
 
 		 423 aa  509  1e-143  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0882  hypothetical protein  62.21 
 
 		 426 aa  509  1e-143  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.796226  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01540  hypothetical protein  58.91 
 
 		 431 aa  507  9.999999999999999e-143  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1960  hypothetical protein  58.43 
 
 		 424 aa  505  9.999999999999999e-143  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2857  hypothetical protein  57.96 
 
 		 421 aa  504  1e-141  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2726  hypothetical protein  58.19 
 
 		 421 aa  502  1e-141  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1745  hypothetical protein  58.81 
 
 		 421 aa  502  1e-141  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.427783  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2256  hypothetical protein  57.24 
 
 		 424 aa  498  1e-139  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1393  hypothetical protein  55.24 
 
 		 427 aa  495  1e-139  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1464  hypothetical protein  58.25 
 
 		 423 aa  497  1e-139  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01753  hypothetical protein  56.71 
 
 		 427 aa  488  1e-137  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1858  protein of unknown function DUF444  56.71 
 
 		 427 aa  488  1e-137  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0100922  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2072  hypothetical protein  57.51 
 
 		 428 aa  489  1e-137  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000406999 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1394  hypothetical protein  57.51 
 
 		 428 aa  489  1e-137  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000594429 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1891  hypothetical protein  57.51 
 
 		 428 aa  489  1e-137  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.575016  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01741  hypothetical protein  56.71 
 
 		 427 aa  488  1e-137  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1410  hypothetical protein  57.51 
 
 		 428 aa  489  1e-137  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.123931  normal  0.301036 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1992  hypothetical protein  57.01 
 
 		 424 aa  489  1e-137  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0160685  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1377  hypothetical protein  57.51 
 
 		 428 aa  489  1e-137  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.990404 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2008  hypothetical protein  56.71 
 
 		 427 aa  488  1e-137  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2732  hypothetical protein  56.26 
 
 		 422 aa  489  1e-137  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.66622  hitchhiker  0.00119744 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2508  hypothetical protein  56.71 
 
 		 427 aa  488  1e-137  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.482436  normal  0.930565 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2102  hypothetical protein  57.01 
 
 		 424 aa  489  1e-137  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.277028  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1848  hypothetical protein  56.71 
 
 		 427 aa  488  1e-137  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.0243705 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1407  hypothetical protein  56.94 
 
 		 427 aa  489  1e-137  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.955409  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2032  hypothetical protein  56.71 
 
 		 427 aa  487  1e-136  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1228  hypothetical protein  57.18 
 
 		 423 aa  485  1e-136  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.194655 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1832  hypothetical protein  59.14 
 
 		 422 aa  487  1e-136  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1870  hypothetical protein  56.47 
 
 		 427 aa  488  1e-136  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.188375  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1978  hypothetical protein  57.41 
 
 		 425 aa  486  1e-136  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.176712  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2220  hypothetical protein  56.87 
 
 		 431 aa  488  1e-136  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1233  hypothetical protein  55.21 
 
 		 419 aa  483  1e-135  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1670  hypothetical protein  56.71 
 
 		 427 aa  482  1e-135  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3486  hypothetical protein  55.24 
 
 		 425 aa  480  1e-134  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.769021  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2883  hypothetical protein  58.91 
 
 		 422 aa  481  1e-134  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2207  hypothetical protein  55.79 
 
 		 422 aa  478  1e-134  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0557869  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2026  hypothetical protein  57.14 
 
 		 421 aa  478  1e-134  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.924644  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1637  hypothetical protein  58.33 
 
 		 421 aa  478  1e-134  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0700293  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1862  hypothetical protein  57.14 
 
 		 421 aa  478  1e-134  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1874  hypothetical protein  57.14 
 
 		 421 aa  478  1e-134  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1961  hypothetical protein  58.43 
 
 		 422 aa  479  1e-134  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.926778  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2468  hypothetical protein  56.9 
 
 		 421 aa  477  1e-133  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.367874  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2006  hypothetical protein  57.14 
 
 		 423 aa  476  1e-133  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2256  hypothetical protein  57.14 
 
 		 423 aa  476  1e-133  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.286161  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1690  hypothetical protein  57.14 
 
 		 421 aa  478  1e-133  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0559377  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0346  hypothetical protein  57.14 
 
 		 421 aa  478  1e-133  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.315691  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0815  hypothetical protein  57.14 
 
 		 421 aa  478  1e-133  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0982154  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1529  hypothetical protein  56.7 
 
 		 422 aa  475  1e-133  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.508734  normal  0.741685 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2568  hypothetical protein  55.56 
 
 		 422 aa  475  1e-133  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0567655  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4752  hypothetical protein  55.98 
 
 		 422 aa  471  1e-132  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0838769  normal  0.248269 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1134  hypothetical protein  56.22 
 
 		 422 aa  472  1e-132  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1511  hypothetical protein  56.46 
 
 		 422 aa  474  1e-132  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.104475  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1614  hypothetical protein  56.22 
 
 		 422 aa  472  1e-132  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0111312  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1922  hypothetical protein  59.72 
 
 		 423 aa  472  1e-132  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.111913  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1590  hypothetical protein  56.22 
 
 		 422 aa  472  1e-132  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.559411  normal  0.820493 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1741  hypothetical protein  53.55 
 
 		 420 aa  468  1.0000000000000001e-131  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.118571  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2447  hypothetical protein  59.62 
 
 		 428 aa  470  1.0000000000000001e-131  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.319583  normal  0.0698328 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1624  hypothetical protein  56.46 
 
 		 422 aa  469  1.0000000000000001e-131  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.912678 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2505  hypothetical protein  60.1 
 
 		 422 aa  467  9.999999999999999e-131  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000420079  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1780  hypothetical protein  60.1 
 
 		 424 aa  466  9.999999999999999e-131  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000829962  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1773  hypothetical protein  60.1 
 
 		 424 aa  466  9.999999999999999e-131  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000000117853  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2157  hypothetical protein  58.43 
 
 		 428 aa  466  9.999999999999999e-131  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.293839  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2216  hypothetical protein  52.03 
 
 		 422 aa  463  1e-129  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1570  hypothetical protein  58.91 
 
 		 424 aa  462  1e-129  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0194924  normal  0.404003 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1645  hypothetical protein  58.91 
 
 		 424 aa  462  1e-129  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00220119  hitchhiker  0.00165359 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1685  hypothetical protein  58.91 
 
 		 424 aa  463  1e-129  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.000901028  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1817  hypothetical protein  59.86 
 
 		 424 aa  464  1e-129  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00238162  normal  0.502951 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1637  hypothetical protein  58.91 
 
 		 424 aa  461  9.999999999999999e-129  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00171589  normal  0.194153 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3554  hypothetical protein  54.03 
 
 		 420 aa  456  1e-127  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3905  hypothetical protein  54.85 
 
 		 423 aa  457  1e-127  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.326986 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3778  hypothetical protein  52.06 
 
 		 436 aa  444  1e-123  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00112787 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2049  hypothetical protein  52.84 
 
 		 420 aa  444  1e-123  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.390338  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0200  hypothetical protein  52.57 
 
 		 428 aa  439  9.999999999999999e-123  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.315097 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2158  hypothetical protein  52.12 
 
 		 423 aa  431  1e-119  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0931116  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1709  hypothetical protein  51.18 
 
 		 430 aa  425  1e-118  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0614013  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2386  hypothetical protein  51.54 
 
 		 424 aa  421  1e-116  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2328  hypothetical protein  51.2 
 
 		 422 aa  420  1e-116  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.40975  normal  0.858132 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0256  hypothetical protein  46.1 
 
 		 436 aa  369  1e-101  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.149537  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1028  hypothetical protein  45.48 
 
 		 438 aa  357  2.9999999999999997e-97  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  decreased coverage  0.0000562968  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1692  hypothetical protein  46.24 
 
 		 426 aa  355  5.999999999999999e-97  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0975  hypothetical protein  44.27 
 
 		 439 aa  354  2e-96  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1222  hypothetical protein  47.88 
 
 		 430 aa  353  2.9999999999999997e-96  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.134791 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0033  hypothetical protein  45.43 
 
 		 435 aa  340  2e-92  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.19629  normal  0.0885106 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6313  hypothetical protein  43.69 
 
 		 425 aa  337  1.9999999999999998e-91  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0175  hypothetical protein  44.34 
 
 		 427 aa  335  7.999999999999999e-91  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.247119  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>