158 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dred_2005 on replicon NC_009253
Organism: Desulfotomaculum reducens MI-1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009253  Dred_2005  hypothetical protein  100 
 
 		 382 aa  791    Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1157  hypothetical protein  73.07 
 
 		 381 aa  592  1e-168  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.250863  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0592  hypothetical protein  61.5 
 
 		 384 aa  497  1e-139  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0511  hypothetical protein  60.68 
 
 		 387 aa  488  1e-137  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3005  hypothetical protein  57.71 
 
 		 376 aa  461  1e-129  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0509  hypothetical protein  57.74 
 
 		 385 aa  461  9.999999999999999e-129  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00000608063  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1373  hypothetical protein  56.69 
 
 		 385 aa  456  1e-127  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0606  hypothetical protein  56.61 
 
 		 391 aa  451  1.0000000000000001e-126  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4751  hypothetical protein  56.61 
 
 		 391 aa  452  1.0000000000000001e-126  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000719469 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0519  hypothetical protein  56.61 
 
 		 391 aa  451  1.0000000000000001e-126  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0462  hypothetical protein  56.61 
 
 		 391 aa  451  1.0000000000000001e-126  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.781939  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0458  hypothetical protein  56.61 
 
 		 391 aa  451  1.0000000000000001e-126  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0551  hypothetical protein  56.61 
 
 		 391 aa  451  1.0000000000000001e-126  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0466  hypothetical protein  57.14 
 
 		 391 aa  453  1.0000000000000001e-126  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0587  hypothetical protein  56.61 
 
 		 391 aa  451  1e-125  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0461  hypothetical protein  57.29 
 
 		 383 aa  437  1e-121  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.360542  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0473  hypothetical protein  60.71 
 
 		 359 aa  434  1e-120  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0626  hypothetical protein  59.7 
 
 		 366 aa  430  1e-119  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0552  hypothetical protein  59.7 
 
 		 366 aa  430  1e-119  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000241038 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1074  hypothetical protein  53.87 
 
 		 371 aa  414  1e-114  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2508  hypothetical protein  41.89 
 
 		 394 aa  282  6.000000000000001e-75  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.000150245  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1204  hypothetical protein  40.78 
 
 		 422 aa  269  5e-71  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0490  hypothetical protein  42.47 
 
 		 398 aa  255  8e-67  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.924012  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1540  hypothetical protein  41.3 
 
 		 392 aa  254  1.0000000000000001e-66  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.212388  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1333  hypothetical protein  41.3 
 
 		 392 aa  254  2.0000000000000002e-66  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.181704  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4174  hypothetical protein  36.51 
 
 		 367 aa  228  1e-58  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1380  hypothetical protein  38.07 
 
 		 369 aa  223  6e-57  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2209  hypothetical protein  37.2 
 
 		 367 aa  208  1e-52  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3528  hypothetical protein  35.42 
 
 		 369 aa  208  2e-52  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0572559  normal  0.737881 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1229  hypothetical protein  35.79 
 
 		 368 aa  204  2e-51  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4654  protein of unknown function DUF444  34.58 
 
 		 368 aa  196  4.0000000000000005e-49  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2990  protein of unknown function DUF444  33.33 
 
 		 368 aa  191  2e-47  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2538  hypothetical protein  34.81 
 
 		 368 aa  187  4e-46  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.74871 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2730  hypothetical protein  34.97 
 
 		 368 aa  184  2.0000000000000003e-45  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.237195  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2636  hypothetical protein  34.97 
 
 		 368 aa  184  2.0000000000000003e-45  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0975  hypothetical protein  28.33 
 
 		 439 aa  159  5e-38  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01540  hypothetical protein  29.59 
 
 		 431 aa  159  1e-37  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003982  hypothetical protein  29.59 
 
 		 423 aa  158  2e-37  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1464  hypothetical protein  29.02 
 
 		 423 aa  153  4e-36  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2207  hypothetical protein  28.3 
 
 		 422 aa  152  8e-36  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0557869  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02752  hypothetical protein  27.97 
 
 		 428 aa  152  1e-35  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.374771  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2732  hypothetical protein  27.88 
 
 		 422 aa  149  8e-35  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.66622  hitchhiker  0.00119744 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6313  hypothetical protein  28.8 
 
 		 425 aa  148  1.0000000000000001e-34  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3486  hypothetical protein  27.51 
 
 		 425 aa  147  4.0000000000000006e-34  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.769021  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01753  hypothetical protein  27.47 
 
 		 427 aa  145  1e-33  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1858  protein of unknown function DUF444  27.47 
 
 		 427 aa  145  1e-33  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0100922  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2508  hypothetical protein  27.47 
 
 		 427 aa  145  1e-33  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.482436  normal  0.930565 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2026  hypothetical protein  27.8 
 
 		 421 aa  145  1e-33  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.924644  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1978  hypothetical protein  27.47 
 
 		 425 aa  145  1e-33  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.176712  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1690  hypothetical protein  27.8 
 
 		 421 aa  145  1e-33  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0559377  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0346  hypothetical protein  27.8 
 
 		 421 aa  145  1e-33  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.315691  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1862  hypothetical protein  27.8 
 
 		 421 aa  145  1e-33  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1874  hypothetical protein  27.8 
 
 		 421 aa  145  1e-33  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0815  hypothetical protein  27.8 
 
 		 421 aa  145  1e-33  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0982154  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01741  hypothetical protein  27.47 
 
 		 427 aa  145  1e-33  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1870  hypothetical protein  27.47 
 
 		 427 aa  145  1e-33  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.188375  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2008  hypothetical protein  27.47 
 
 		 427 aa  145  1e-33  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1848  hypothetical protein  27.47 
 
 		 427 aa  145  1e-33  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.0243705 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1410  hypothetical protein  27.56 
 
 		 428 aa  144  2e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.123931  normal  0.301036 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2032  hypothetical protein  27.47 
 
 		 427 aa  145  2e-33  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2072  hypothetical protein  27.56 
 
 		 428 aa  144  2e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000406999 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1377  hypothetical protein  27.56 
 
 		 428 aa  144  2e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.990404 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1394  hypothetical protein  27.56 
 
 		 428 aa  144  2e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000594429 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1891  hypothetical protein  27.56 
 
 		 428 aa  144  2e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.575016  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2857  hypothetical protein  26.44 
 
 		 421 aa  143  5e-33  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2220  hypothetical protein  27.95 
 
 		 431 aa  143  6e-33  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3057  hypothetical protein  29.26 
 
 		 431 aa  143  6e-33  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.833088  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1028  hypothetical protein  27.62 
 
 		 438 aa  143  6e-33  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  decreased coverage  0.0000562968  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1745  hypothetical protein  28.37 
 
 		 421 aa  142  9.999999999999999e-33  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.427783  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1992  hypothetical protein  28.02 
 
 		 424 aa  142  9.999999999999999e-33  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0160685  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2102  hypothetical protein  28.02 
 
 		 424 aa  142  9.999999999999999e-33  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.277028  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1407  hypothetical protein  26.99 
 
 		 427 aa  142  9.999999999999999e-33  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.955409  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2468  hypothetical protein  27.07 
 
 		 421 aa  141  1.9999999999999998e-32  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.367874  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4752  hypothetical protein  27.32 
 
 		 422 aa  140  3.9999999999999997e-32  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0838769  normal  0.248269 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1134  hypothetical protein  28.22 
 
 		 422 aa  140  3.9999999999999997e-32  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1511  hypothetical protein  27.56 
 
 		 422 aa  140  3.9999999999999997e-32  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.104475  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1614  hypothetical protein  28.22 
 
 		 422 aa  140  3.9999999999999997e-32  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0111312  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1529  hypothetical protein  27.56 
 
 		 422 aa  140  3.9999999999999997e-32  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.508734  normal  0.741685 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1590  hypothetical protein  28.22 
 
 		 422 aa  140  3.9999999999999997e-32  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.559411  normal  0.820493 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1393  hypothetical protein  27.9 
 
 		 427 aa  140  4.999999999999999e-32  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1960  hypothetical protein  25.84 
 
 		 424 aa  139  7e-32  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2256  hypothetical protein  25.84 
 
 		 424 aa  139  7e-32  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1624  hypothetical protein  28.29 
 
 		 422 aa  139  7e-32  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.912678 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2726  hypothetical protein  26.68 
 
 		 421 aa  139  1e-31  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2158  hypothetical protein  31.97 
 
 		 423 aa  136  5e-31  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0931116  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1670  hypothetical protein  26.02 
 
 		 427 aa  134  1.9999999999999998e-30  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2216  hypothetical protein  30.03 
 
 		 422 aa  133  3.9999999999999996e-30  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2386  hypothetical protein  36.97 
 
 		 424 aa  134  3.9999999999999996e-30  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1922  hypothetical protein  29 
 
 		 423 aa  133  5e-30  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.111913  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1741  hypothetical protein  26.23 
 
 		 420 aa  133  5e-30  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.118571  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2256  hypothetical protein  25.72 
 
 		 423 aa  133  6e-30  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.286161  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3778  hypothetical protein  26.82 
 
 		 436 aa  132  6.999999999999999e-30  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00112787 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1228  hypothetical protein  26.94 
 
 		 423 aa  132  1.0000000000000001e-29  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.194655 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2006  hypothetical protein  25.48 
 
 		 423 aa  132  1.0000000000000001e-29  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0200  hypothetical protein  26.14 
 
 		 428 aa  132  1.0000000000000001e-29  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.315097 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0256  hypothetical protein  26.92 
 
 		 436 aa  131  2.0000000000000002e-29  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.149537  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1961  hypothetical protein  27.75 
 
 		 422 aa  131  2.0000000000000002e-29  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.926778  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1233  hypothetical protein  38.83 
 
 		 419 aa  130  5.0000000000000004e-29  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1692  hypothetical protein  27.05 
 
 		 426 aa  130  5.0000000000000004e-29  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3905  hypothetical protein  27.52 
 
 		 423 aa  130  6e-29  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.326986 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>