158 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hoch_4654 on replicon NC_013440
Organism: Haliangium ochraceum DSM 14365



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013440  Hoch_4654  protein of unknown function DUF444  100 
 
 
368 aa  753    Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1229  hypothetical protein  65.49 
 
 
368 aa  507  9.999999999999999e-143  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1380  hypothetical protein  65.93 
 
 
369 aa  502  1e-141  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3528  hypothetical protein  64.75 
 
 
369 aa  486  1e-136  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0572559  normal  0.737881 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4174  hypothetical protein  60.49 
 
 
367 aa  486  1e-136  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2730  hypothetical protein  64.95 
 
 
368 aa  482  1e-135  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.237195  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2636  hypothetical protein  64.95 
 
 
368 aa  482  1e-135  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2538  hypothetical protein  63.32 
 
 
368 aa  479  1e-134  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.74871 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2209  hypothetical protein  64.48 
 
 
367 aa  471  1.0000000000000001e-131  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2990  protein of unknown function DUF444  57.72 
 
 
368 aa  436  1e-121  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1820  protein of unknown function DUF444  40.44 
 
 
360 aa  281  1e-74  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.18081  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2005  hypothetical protein  35.31 
 
 
382 aa  220  3.9999999999999997e-56  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1157  hypothetical protein  35.37 
 
 
381 aa  219  7.999999999999999e-56  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.250863  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0509  hypothetical protein  40.25 
 
 
385 aa  218  1e-55  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00000608063  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1373  hypothetical protein  35.42 
 
 
385 aa  207  3e-52  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0511  hypothetical protein  34.97 
 
 
387 aa  204  1e-51  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0592  hypothetical protein  34.44 
 
 
384 aa  204  3e-51  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3005  hypothetical protein  34.63 
 
 
376 aa  201  9.999999999999999e-51  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0473  hypothetical protein  36.28 
 
 
359 aa  197  3e-49  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0587  hypothetical protein  37.23 
 
 
391 aa  196  6e-49  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0466  hypothetical protein  36.92 
 
 
391 aa  194  2e-48  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0606  hypothetical protein  36.92 
 
 
391 aa  194  3e-48  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0519  hypothetical protein  36.92 
 
 
391 aa  194  3e-48  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0462  hypothetical protein  36.92 
 
 
391 aa  194  3e-48  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.781939  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0458  hypothetical protein  36.92 
 
 
391 aa  194  3e-48  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0551  hypothetical protein  36.92 
 
 
391 aa  194  3e-48  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4751  hypothetical protein  36.92 
 
 
391 aa  194  3e-48  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000719469 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0626  hypothetical protein  36.92 
 
 
366 aa  193  3e-48  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0552  hypothetical protein  36.92 
 
 
366 aa  193  4e-48  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000241038 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1074  hypothetical protein  34.07 
 
 
371 aa  188  1e-46  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0461  hypothetical protein  31.77 
 
 
383 aa  186  7e-46  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.360542  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2508  hypothetical protein  33.51 
 
 
394 aa  182  6e-45  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.000150245  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1204  hypothetical protein  32.9 
 
 
422 aa  171  2e-41  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0490  hypothetical protein  33.42 
 
 
398 aa  159  8e-38  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.924012  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1333  hypothetical protein  29.62 
 
 
392 aa  159  1e-37  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.181704  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1540  hypothetical protein  29.62 
 
 
392 aa  156  5.0000000000000005e-37  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.212388  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2207  hypothetical protein  27.36 
 
 
422 aa  152  1e-35  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0557869  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01540  hypothetical protein  29.07 
 
 
431 aa  149  1.0000000000000001e-34  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1464  hypothetical protein  28.1 
 
 
423 aa  147  3e-34  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003982  hypothetical protein  28.47 
 
 
423 aa  145  9e-34  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1745  hypothetical protein  27.03 
 
 
421 aa  144  3e-33  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.427783  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1393  hypothetical protein  28.76 
 
 
427 aa  142  7e-33  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0975  hypothetical protein  28.37 
 
 
439 aa  141  1.9999999999999998e-32  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1992  hypothetical protein  27.21 
 
 
424 aa  139  7e-32  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0160685  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1741  hypothetical protein  28.02 
 
 
420 aa  139  7e-32  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.118571  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2102  hypothetical protein  27.21 
 
 
424 aa  139  7e-32  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.277028  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2216  hypothetical protein  30 
 
 
422 aa  139  7.999999999999999e-32  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4018  hypothetical protein  29.48 
 
 
423 aa  138  1e-31  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1858  protein of unknown function DUF444  26.34 
 
 
427 aa  137  2e-31  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0100922  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2006  hypothetical protein  27.95 
 
 
423 aa  138  2e-31  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2256  hypothetical protein  27.95 
 
 
423 aa  138  2e-31  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.286161  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0430  hypothetical protein  29.2 
 
 
423 aa  137  2e-31  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.220471  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2732  hypothetical protein  28.3 
 
 
422 aa  138  2e-31  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.66622  hitchhiker  0.00119744 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01753  hypothetical protein  26.34 
 
 
427 aa  137  3.0000000000000003e-31  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0396  hypothetical protein  29.2 
 
 
440 aa  137  3.0000000000000003e-31  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0546  hypothetical protein  28.85 
 
 
423 aa  137  3.0000000000000003e-31  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1228  hypothetical protein  28.1 
 
 
423 aa  137  3.0000000000000003e-31  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.194655 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2508  hypothetical protein  26.34 
 
 
427 aa  137  3.0000000000000003e-31  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.482436  normal  0.930565 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01741  hypothetical protein  26.34 
 
 
427 aa  137  3.0000000000000003e-31  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1870  hypothetical protein  26.34 
 
 
427 aa  137  3.0000000000000003e-31  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.188375  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2008  hypothetical protein  26.34 
 
 
427 aa  137  3.0000000000000003e-31  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1848  hypothetical protein  26.34 
 
 
427 aa  137  3.0000000000000003e-31  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.0243705 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4806  hypothetical protein  28.65 
 
 
423 aa  137  3.0000000000000003e-31  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.146818  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5140  hypothetical protein  28.42 
 
 
423 aa  137  4e-31  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2386  hypothetical protein  27.21 
 
 
424 aa  137  4e-31  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4632  hypothetical protein  28.85 
 
 
423 aa  136  5e-31  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.209596 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_07660  hypothetical protein  29.23 
 
 
423 aa  136  5e-31  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.159548 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2032  hypothetical protein  26.1 
 
 
427 aa  136  6.0000000000000005e-31  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1978  hypothetical protein  25.66 
 
 
425 aa  136  6.0000000000000005e-31  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.176712  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1134  hypothetical protein  28.3 
 
 
422 aa  136  7.000000000000001e-31  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1614  hypothetical protein  28.3 
 
 
422 aa  136  7.000000000000001e-31  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0111312  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0730  hypothetical protein  29.23 
 
 
423 aa  136  7.000000000000001e-31  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1590  hypothetical protein  28.3 
 
 
422 aa  136  7.000000000000001e-31  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.559411  normal  0.820493 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2072  hypothetical protein  26.57 
 
 
428 aa  135  8e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000406999 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3057  hypothetical protein  29.86 
 
 
431 aa  135  8e-31  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.833088  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0427  hypothetical protein  28.65 
 
 
424 aa  135  8e-31  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.225763  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3486  hypothetical protein  25.47 
 
 
425 aa  135  9e-31  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.769021  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1410  hypothetical protein  26.57 
 
 
428 aa  135  9.999999999999999e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.123931  normal  0.301036 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3905  hypothetical protein  28.39 
 
 
423 aa  135  9.999999999999999e-31  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.326986 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1511  hypothetical protein  28.02 
 
 
422 aa  135  9.999999999999999e-31  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.104475  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1529  hypothetical protein  28.02 
 
 
422 aa  135  9.999999999999999e-31  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.508734  normal  0.741685 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1377  hypothetical protein  26.57 
 
 
428 aa  135  9.999999999999999e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.990404 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1394  hypothetical protein  26.57 
 
 
428 aa  135  9.999999999999999e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000594429 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1891  hypothetical protein  26.57 
 
 
428 aa  135  9.999999999999999e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.575016  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1407  hypothetical protein  25.61 
 
 
427 aa  135  1.9999999999999998e-30  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.955409  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2049  hypothetical protein  28.02 
 
 
420 aa  134  3e-30  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.390338  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1233  hypothetical protein  28.93 
 
 
419 aa  134  3e-30  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4752  hypothetical protein  28.02 
 
 
422 aa  134  3e-30  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0838769  normal  0.248269 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2857  hypothetical protein  27.16 
 
 
421 aa  133  3.9999999999999996e-30  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1637  hypothetical protein  27.51 
 
 
421 aa  134  3.9999999999999996e-30  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0700293  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02752  hypothetical protein  26.47 
 
 
428 aa  133  5e-30  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.374771  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2568  hypothetical protein  29.25 
 
 
422 aa  132  6e-30  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0567655  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1624  hypothetical protein  28.41 
 
 
422 aa  133  6e-30  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.912678 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2726  hypothetical protein  26.67 
 
 
421 aa  132  7.999999999999999e-30  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1692  hypothetical protein  28.95 
 
 
426 aa  132  7.999999999999999e-30  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3778  hypothetical protein  28.61 
 
 
436 aa  132  7.999999999999999e-30  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00112787 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2883  hypothetical protein  26.67 
 
 
422 aa  131  2.0000000000000002e-29  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2468  hypothetical protein  27.79 
 
 
421 aa  131  2.0000000000000002e-29  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.367874  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_46880  hypothetical protein  28.88 
 
 
424 aa  131  2.0000000000000002e-29  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2220  hypothetical protein  26.63 
 
 
431 aa  131  2.0000000000000002e-29  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>