158 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CPR_1333 on replicon NC_008262
Organism: Clostridium perfringens SM101



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008261  CPF_1540  hypothetical protein  98.98 
 
 
392 aa  793    Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.212388  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1333  hypothetical protein  100 
 
 
392 aa  799    Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.181704  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1204  hypothetical protein  53.22 
 
 
422 aa  412  1e-114  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0490  hypothetical protein  53.35 
 
 
398 aa  381  1e-104  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.924012  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2508  hypothetical protein  43.3 
 
 
394 aa  353  2.9999999999999997e-96  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.000150245  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2005  hypothetical protein  41.3 
 
 
382 aa  254  2.0000000000000002e-66  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1157  hypothetical protein  40.16 
 
 
381 aa  245  9e-64  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.250863  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3005  hypothetical protein  37.33 
 
 
376 aa  243  5e-63  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0592  hypothetical protein  36.68 
 
 
384 aa  242  7.999999999999999e-63  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4751  hypothetical protein  38.4 
 
 
391 aa  239  6.999999999999999e-62  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000719469 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0606  hypothetical protein  38.4 
 
 
391 aa  238  1e-61  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0519  hypothetical protein  38.4 
 
 
391 aa  238  1e-61  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0462  hypothetical protein  38.4 
 
 
391 aa  238  1e-61  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.781939  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0458  hypothetical protein  38.4 
 
 
391 aa  238  1e-61  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0551  hypothetical protein  38.4 
 
 
391 aa  238  1e-61  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0466  hypothetical protein  38.14 
 
 
391 aa  237  2e-61  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0461  hypothetical protein  35.2 
 
 
383 aa  237  3e-61  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.360542  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0509  hypothetical protein  37.4 
 
 
385 aa  236  7e-61  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00000608063  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0587  hypothetical protein  37.63 
 
 
391 aa  235  1.0000000000000001e-60  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1373  hypothetical protein  36.34 
 
 
385 aa  233  3e-60  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0511  hypothetical protein  36.83 
 
 
387 aa  233  6e-60  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0552  hypothetical protein  39.41 
 
 
366 aa  221  9.999999999999999e-57  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000241038 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0626  hypothetical protein  39.41 
 
 
366 aa  222  9.999999999999999e-57  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0473  hypothetical protein  39.71 
 
 
359 aa  219  7e-56  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1074  hypothetical protein  31.97 
 
 
371 aa  207  2e-52  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003982  hypothetical protein  30.59 
 
 
423 aa  184  2.0000000000000003e-45  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01540  hypothetical protein  30.42 
 
 
431 aa  183  4.0000000000000006e-45  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1464  hypothetical protein  31.13 
 
 
423 aa  182  8.000000000000001e-45  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2732  hypothetical protein  28.84 
 
 
422 aa  179  9e-44  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.66622  hitchhiker  0.00119744 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1992  hypothetical protein  29.78 
 
 
424 aa  177  2e-43  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0160685  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2102  hypothetical protein  29.78 
 
 
424 aa  177  2e-43  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.277028  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2032  hypothetical protein  29.02 
 
 
427 aa  175  9.999999999999999e-43  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1407  hypothetical protein  29.27 
 
 
427 aa  175  9.999999999999999e-43  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.955409  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01753  hypothetical protein  29.02 
 
 
427 aa  174  1.9999999999999998e-42  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1858  protein of unknown function DUF444  29.02 
 
 
427 aa  174  1.9999999999999998e-42  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0100922  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2508  hypothetical protein  29.02 
 
 
427 aa  174  1.9999999999999998e-42  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.482436  normal  0.930565 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3057  hypothetical protein  29.73 
 
 
431 aa  174  1.9999999999999998e-42  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.833088  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01741  hypothetical protein  29.02 
 
 
427 aa  174  1.9999999999999998e-42  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1870  hypothetical protein  29.02 
 
 
427 aa  174  1.9999999999999998e-42  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.188375  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2008  hypothetical protein  29.02 
 
 
427 aa  174  1.9999999999999998e-42  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1848  hypothetical protein  29.02 
 
 
427 aa  174  1.9999999999999998e-42  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.0243705 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2072  hypothetical protein  28.22 
 
 
428 aa  173  5e-42  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000406999 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1377  hypothetical protein  28.22 
 
 
428 aa  173  5e-42  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.990404 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1891  hypothetical protein  28.22 
 
 
428 aa  173  5e-42  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.575016  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1394  hypothetical protein  28.22 
 
 
428 aa  173  5e-42  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000594429 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1410  hypothetical protein  28.22 
 
 
428 aa  173  5e-42  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.123931  normal  0.301036 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02752  hypothetical protein  29.58 
 
 
428 aa  173  5.999999999999999e-42  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.374771  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4018  hypothetical protein  31.27 
 
 
423 aa  169  6e-41  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2256  hypothetical protein  27.66 
 
 
424 aa  168  1e-40  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4174  hypothetical protein  33.16 
 
 
367 aa  167  2e-40  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2026  hypothetical protein  30.84 
 
 
421 aa  167  2.9999999999999998e-40  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.924644  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1690  hypothetical protein  30.84 
 
 
421 aa  167  2.9999999999999998e-40  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0559377  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1960  hypothetical protein  27.66 
 
 
424 aa  167  2.9999999999999998e-40  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0346  hypothetical protein  30.84 
 
 
421 aa  167  2.9999999999999998e-40  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.315691  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1862  hypothetical protein  30.84 
 
 
421 aa  167  2.9999999999999998e-40  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1874  hypothetical protein  30.84 
 
 
421 aa  167  2.9999999999999998e-40  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0815  hypothetical protein  30.84 
 
 
421 aa  167  2.9999999999999998e-40  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0982154  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2857  hypothetical protein  32.14 
 
 
421 aa  166  5.9999999999999996e-40  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2468  hypothetical protein  30.94 
 
 
421 aa  166  5.9999999999999996e-40  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.367874  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2207  hypothetical protein  30.27 
 
 
422 aa  166  5.9999999999999996e-40  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0557869  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3486  hypothetical protein  29.53 
 
 
425 aa  166  6.9999999999999995e-40  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.769021  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5140  hypothetical protein  30.2 
 
 
423 aa  165  1.0000000000000001e-39  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2220  hypothetical protein  29.36 
 
 
431 aa  165  2.0000000000000002e-39  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1134  hypothetical protein  29.76 
 
 
422 aa  164  3e-39  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1614  hypothetical protein  29.76 
 
 
422 aa  164  3e-39  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0111312  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1590  hypothetical protein  29.76 
 
 
422 aa  164  3e-39  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.559411  normal  0.820493 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1670  hypothetical protein  28.67 
 
 
427 aa  163  4.0000000000000004e-39  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4752  hypothetical protein  29.27 
 
 
422 aa  163  5.0000000000000005e-39  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0838769  normal  0.248269 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2006  hypothetical protein  30.6 
 
 
423 aa  162  8.000000000000001e-39  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1380  hypothetical protein  32.89 
 
 
369 aa  162  8.000000000000001e-39  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2256  hypothetical protein  30.6 
 
 
423 aa  162  1e-38  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.286161  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1741  hypothetical protein  29.51 
 
 
420 aa  162  1e-38  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.118571  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1228  hypothetical protein  28.54 
 
 
423 aa  162  1e-38  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.194655 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1624  hypothetical protein  29.51 
 
 
422 aa  161  1e-38  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.912678 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1978  hypothetical protein  28.71 
 
 
425 aa  162  1e-38  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.176712  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2726  hypothetical protein  31.87 
 
 
421 aa  161  2e-38  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1511  hypothetical protein  31.42 
 
 
422 aa  161  2e-38  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.104475  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_07660  hypothetical protein  29.35 
 
 
423 aa  161  2e-38  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.159548 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1529  hypothetical protein  31.42 
 
 
422 aa  161  2e-38  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.508734  normal  0.741685 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0730  hypothetical protein  29.35 
 
 
423 aa  161  2e-38  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0427  hypothetical protein  29.38 
 
 
424 aa  161  2e-38  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.225763  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1229  hypothetical protein  32.62 
 
 
368 aa  159  6e-38  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1745  hypothetical protein  29.85 
 
 
421 aa  159  7e-38  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.427783  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2049  hypothetical protein  29.51 
 
 
420 aa  159  9e-38  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.390338  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2568  hypothetical protein  28.57 
 
 
422 aa  159  1e-37  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0567655  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4806  hypothetical protein  28.71 
 
 
423 aa  159  1e-37  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.146818  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1393  hypothetical protein  31.96 
 
 
427 aa  157  4e-37  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6313  hypothetical protein  30.71 
 
 
425 aa  156  6e-37  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3554  hypothetical protein  30.75 
 
 
420 aa  155  1e-36  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3905  hypothetical protein  29.63 
 
 
423 aa  155  1e-36  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.326986 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0396  hypothetical protein  29.84 
 
 
440 aa  155  2e-36  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1233  hypothetical protein  29.56 
 
 
419 aa  154  2e-36  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0732  hypothetical protein  31.88 
 
 
424 aa  154  2e-36  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_46880  hypothetical protein  29.21 
 
 
424 aa  154  2e-36  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0430  hypothetical protein  28.22 
 
 
423 aa  155  2e-36  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.220471  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2158  hypothetical protein  29.67 
 
 
423 aa  153  4e-36  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0931116  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0546  hypothetical protein  30.11 
 
 
423 aa  152  1e-35  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4632  hypothetical protein  28.47 
 
 
423 aa  152  1e-35  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.209596 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2386  hypothetical protein  30.41 
 
 
424 aa  151  2e-35  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1637  hypothetical protein  29.38 
 
 
421 aa  150  5e-35  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0700293  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>