158 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dhaf_3005 on replicon NC_011830
Organism: Desulfitobacterium hafniense DCB-2



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011830  Dhaf_3005  hypothetical protein  100 
 
 
376 aa  778    Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0511  hypothetical protein  61.19 
 
 
387 aa  461  1e-129  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2005  hypothetical protein  57.71 
 
 
382 aa  461  1e-129  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1157  hypothetical protein  57.41 
 
 
381 aa  450  1e-125  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.250863  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1373  hypothetical protein  55.05 
 
 
385 aa  431  1e-120  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0509  hypothetical protein  53.99 
 
 
385 aa  424  1e-117  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00000608063  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0461  hypothetical protein  55.05 
 
 
383 aa  422  1e-117  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.360542  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0587  hypothetical protein  52.8 
 
 
391 aa  413  1e-114  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4751  hypothetical protein  52.8 
 
 
391 aa  412  1e-114  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000719469 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0466  hypothetical protein  52.8 
 
 
391 aa  411  1e-114  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0592  hypothetical protein  52.7 
 
 
384 aa  412  1e-114  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0606  hypothetical protein  52.53 
 
 
391 aa  409  1e-113  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0519  hypothetical protein  52.53 
 
 
391 aa  409  1e-113  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0462  hypothetical protein  52.53 
 
 
391 aa  409  1e-113  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.781939  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0458  hypothetical protein  52.53 
 
 
391 aa  409  1e-113  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0551  hypothetical protein  52.53 
 
 
391 aa  409  1e-113  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0473  hypothetical protein  56.12 
 
 
359 aa  389  1e-107  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0626  hypothetical protein  55.42 
 
 
366 aa  382  1e-105  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0552  hypothetical protein  55.42 
 
 
366 aa  382  1e-105  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000241038 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1074  hypothetical protein  49.2 
 
 
371 aa  362  8e-99  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2508  hypothetical protein  36.86 
 
 
394 aa  246  3e-64  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.000150245  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1204  hypothetical protein  38.96 
 
 
422 aa  246  4.9999999999999997e-64  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1540  hypothetical protein  37.33 
 
 
392 aa  245  8e-64  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.212388  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1333  hypothetical protein  37.33 
 
 
392 aa  243  5e-63  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.181704  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0490  hypothetical protein  37.9 
 
 
398 aa  227  3e-58  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.924012  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4174  hypothetical protein  36.26 
 
 
367 aa  213  3.9999999999999995e-54  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1380  hypothetical protein  34.9 
 
 
369 aa  194  2e-48  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3528  hypothetical protein  36.29 
 
 
369 aa  192  6e-48  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0572559  normal  0.737881 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4654  protein of unknown function DUF444  34.07 
 
 
368 aa  186  7e-46  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2209  hypothetical protein  32.42 
 
 
367 aa  184  2.0000000000000003e-45  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1229  hypothetical protein  33.24 
 
 
368 aa  183  4.0000000000000006e-45  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2636  hypothetical protein  36.49 
 
 
368 aa  176  4e-43  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2730  hypothetical protein  36.49 
 
 
368 aa  176  4e-43  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.237195  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2990  protein of unknown function DUF444  32.97 
 
 
368 aa  176  5e-43  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2538  hypothetical protein  33.8 
 
 
368 aa  172  6.999999999999999e-42  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.74871 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003982  hypothetical protein  29.43 
 
 
423 aa  152  7e-36  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01540  hypothetical protein  29.36 
 
 
431 aa  147  3e-34  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0975  hypothetical protein  26.15 
 
 
439 aa  147  4.0000000000000006e-34  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02752  hypothetical protein  28.03 
 
 
428 aa  142  9.999999999999999e-33  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.374771  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1464  hypothetical protein  29.23 
 
 
423 aa  141  1.9999999999999998e-32  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01753  hypothetical protein  27.83 
 
 
427 aa  140  3.9999999999999997e-32  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1858  protein of unknown function DUF444  27.83 
 
 
427 aa  140  3.9999999999999997e-32  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0100922  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01741  hypothetical protein  27.83 
 
 
427 aa  140  3.9999999999999997e-32  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1870  hypothetical protein  27.83 
 
 
427 aa  140  3.9999999999999997e-32  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.188375  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2008  hypothetical protein  27.83 
 
 
427 aa  140  3.9999999999999997e-32  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2508  hypothetical protein  27.83 
 
 
427 aa  140  3.9999999999999997e-32  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.482436  normal  0.930565 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1848  hypothetical protein  27.83 
 
 
427 aa  140  3.9999999999999997e-32  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.0243705 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6313  hypothetical protein  28.97 
 
 
425 aa  139  7.999999999999999e-32  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2032  hypothetical protein  27.59 
 
 
427 aa  139  8.999999999999999e-32  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1407  hypothetical protein  27.59 
 
 
427 aa  139  8.999999999999999e-32  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.955409  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2857  hypothetical protein  27.79 
 
 
421 aa  138  1e-31  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1820  protein of unknown function DUF444  26.32 
 
 
360 aa  138  1e-31  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.18081  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2220  hypothetical protein  30.13 
 
 
431 aa  136  6.0000000000000005e-31  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2726  hypothetical protein  27.55 
 
 
421 aa  135  9.999999999999999e-31  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3057  hypothetical protein  29.41 
 
 
431 aa  135  9.999999999999999e-31  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.833088  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2256  hypothetical protein  27.12 
 
 
424 aa  135  9.999999999999999e-31  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3486  hypothetical protein  27.98 
 
 
425 aa  134  3e-30  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.769021  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1891  hypothetical protein  27.27 
 
 
428 aa  134  3e-30  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.575016  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1377  hypothetical protein  27.27 
 
 
428 aa  134  3e-30  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.990404 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1410  hypothetical protein  27.27 
 
 
428 aa  134  3e-30  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.123931  normal  0.301036 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1394  hypothetical protein  27.27 
 
 
428 aa  134  3e-30  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000594429 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2072  hypothetical protein  27.27 
 
 
428 aa  134  3e-30  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000406999 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1960  hypothetical protein  26.88 
 
 
424 aa  134  3.9999999999999996e-30  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2732  hypothetical protein  27.16 
 
 
422 aa  133  5e-30  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.66622  hitchhiker  0.00119744 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2207  hypothetical protein  27.47 
 
 
422 aa  133  5e-30  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0557869  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1992  hypothetical protein  27.85 
 
 
424 aa  132  1.0000000000000001e-29  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0160685  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2102  hypothetical protein  27.85 
 
 
424 aa  132  1.0000000000000001e-29  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.277028  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1978  hypothetical protein  28.01 
 
 
425 aa  131  2.0000000000000002e-29  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.176712  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_07660  hypothetical protein  29.51 
 
 
423 aa  128  2.0000000000000002e-28  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.159548 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1393  hypothetical protein  28.12 
 
 
427 aa  127  3e-28  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1745  hypothetical protein  28.49 
 
 
421 aa  127  3e-28  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.427783  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0730  hypothetical protein  29.51 
 
 
423 aa  127  3e-28  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4018  hypothetical protein  29.51 
 
 
423 aa  127  4.0000000000000003e-28  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0396  hypothetical protein  29.38 
 
 
440 aa  125  8.000000000000001e-28  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0430  hypothetical protein  29.38 
 
 
423 aa  125  9e-28  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.220471  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0427  hypothetical protein  29.3 
 
 
424 aa  125  1e-27  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.225763  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0546  hypothetical protein  29.78 
 
 
423 aa  125  2e-27  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4632  hypothetical protein  28.96 
 
 
423 aa  124  2e-27  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.209596 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4806  hypothetical protein  29.38 
 
 
423 aa  125  2e-27  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.146818  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1670  hypothetical protein  27.09 
 
 
427 aa  124  3e-27  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5140  hypothetical protein  29.23 
 
 
423 aa  123  4e-27  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2158  hypothetical protein  26.18 
 
 
423 aa  120  3e-26  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0931116  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0033  hypothetical protein  26.49 
 
 
435 aa  120  3e-26  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.19629  normal  0.0885106 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1741  hypothetical protein  25.99 
 
 
420 aa  120  3e-26  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.118571  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4752  hypothetical protein  24.14 
 
 
422 aa  120  3.9999999999999996e-26  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0838769  normal  0.248269 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1228  hypothetical protein  24.88 
 
 
423 aa  120  3.9999999999999996e-26  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.194655 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1028  hypothetical protein  26 
 
 
438 aa  120  4.9999999999999996e-26  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  decreased coverage  0.0000562968  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2216  hypothetical protein  27.9 
 
 
422 aa  119  6e-26  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1233  hypothetical protein  28.57 
 
 
419 aa  119  7e-26  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2256  hypothetical protein  24.14 
 
 
423 aa  119  7e-26  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.286161  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1222  hypothetical protein  27.21 
 
 
430 aa  119  7.999999999999999e-26  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.134791 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1134  hypothetical protein  24.38 
 
 
422 aa  119  9e-26  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1614  hypothetical protein  24.38 
 
 
422 aa  119  9e-26  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0111312  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1529  hypothetical protein  24.38 
 
 
422 aa  119  9e-26  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.508734  normal  0.741685 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1590  hypothetical protein  24.38 
 
 
422 aa  119  9e-26  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.559411  normal  0.820493 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3554  hypothetical protein  26.74 
 
 
420 aa  119  9.999999999999999e-26  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0175  hypothetical protein  28.28 
 
 
427 aa  118  9.999999999999999e-26  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.247119  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1511  hypothetical protein  24.14 
 
 
422 aa  118  9.999999999999999e-26  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.104475  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2006  hypothetical protein  24.38 
 
 
423 aa  117  1.9999999999999998e-25  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3905  hypothetical protein  26.74 
 
 
423 aa  117  1.9999999999999998e-25  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.326986 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>