158 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Htur_1748 on replicon NC_013743
Organism: Haloterrigena turkmenica DSM 5511



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013743  Htur_1748  protein of unknown function DUF444  100 
 
 
441 aa  887    Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3369  protein of unknown function DUF444  89.14 
 
 
442 aa  741    Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.0981107  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2233  hypothetical protein  75.34 
 
 
441 aa  629  1e-179  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.960863  normal  0.309285 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0410  hypothetical protein  71.3 
 
 
436 aa  568  1e-161  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0030  hypothetical protein  63.09 
 
 
460 aa  511  1e-144  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.0419378 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1229  hypothetical protein  29.5 
 
 
368 aa  134  3.9999999999999996e-30  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1204  hypothetical protein  29.32 
 
 
422 aa  124  3e-27  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2636  hypothetical protein  29.44 
 
 
368 aa  117  3.9999999999999997e-25  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2730  hypothetical protein  29.44 
 
 
368 aa  117  3.9999999999999997e-25  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.237195  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2209  hypothetical protein  36.84 
 
 
367 aa  114  5e-24  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4654  protein of unknown function DUF444  38.14 
 
 
368 aa  113  6e-24  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3528  hypothetical protein  34.87 
 
 
369 aa  113  7.000000000000001e-24  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0572559  normal  0.737881 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1380  hypothetical protein  34.87 
 
 
369 aa  112  9e-24  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1820  protein of unknown function DUF444  33.18 
 
 
360 aa  108  3e-22  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.18081  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4174  hypothetical protein  35.9 
 
 
367 aa  106  6e-22  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0490  hypothetical protein  34.13 
 
 
398 aa  103  9e-21  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.924012  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2538  hypothetical protein  35.71 
 
 
368 aa  99  1e-19  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.74871 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2857  hypothetical protein  28.34 
 
 
421 aa  98.6  2e-19  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0033  hypothetical protein  31.62 
 
 
435 aa  97.8  4e-19  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.19629  normal  0.0885106 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2726  hypothetical protein  28.61 
 
 
421 aa  97.4  5e-19  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1741  hypothetical protein  27.05 
 
 
420 aa  97.1  5e-19  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.118571  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2005  hypothetical protein  34.27 
 
 
382 aa  95.9  1e-18  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2990  protein of unknown function DUF444  30.73 
 
 
368 aa  95.5  2e-18  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3057  hypothetical protein  26.6 
 
 
431 aa  94.4  4e-18  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.833088  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2508  hypothetical protein  29.87 
 
 
394 aa  94  5e-18  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.000150245  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1333  hypothetical protein  33.65 
 
 
392 aa  92.4  1e-17  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.181704  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003982  hypothetical protein  24.66 
 
 
423 aa  92.8  1e-17  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1540  hypothetical protein  33.65 
 
 
392 aa  92  2e-17  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.212388  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0975  hypothetical protein  26.75 
 
 
439 aa  91.3  3e-17  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3905  hypothetical protein  32.95 
 
 
423 aa  90.9  4e-17  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.326986 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2705  hypothetical protein  31.87 
 
 
424 aa  90.9  4e-17  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.139831  normal  0.527639 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01540  hypothetical protein  24.15 
 
 
431 aa  90.9  4e-17  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2157  hypothetical protein  29.25 
 
 
428 aa  90.5  5e-17  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.293839  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6313  hypothetical protein  26.91 
 
 
425 aa  90.1  8e-17  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1233  hypothetical protein  29.49 
 
 
419 aa  89.7  9e-17  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1745  hypothetical protein  24.7 
 
 
421 aa  89.7  9e-17  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.427783  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2049  hypothetical protein  33.74 
 
 
420 aa  89.7  1e-16  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.390338  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1157  hypothetical protein  32.02 
 
 
381 aa  89.4  1e-16  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.250863  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1685  hypothetical protein  27.65 
 
 
424 aa  89.7  1e-16  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.000901028  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4806  hypothetical protein  25.9 
 
 
423 aa  89.7  1e-16  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.146818  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2505  hypothetical protein  27.36 
 
 
422 aa  89  2e-16  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000420079  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1780  hypothetical protein  27.36 
 
 
424 aa  88.6  2e-16  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000829962  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1464  hypothetical protein  24.72 
 
 
423 aa  88.2  2e-16  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1773  hypothetical protein  27.36 
 
 
424 aa  88.6  2e-16  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000000117853  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1817  hypothetical protein  27.36 
 
 
424 aa  88.6  2e-16  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00238162  normal  0.502951 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02752  hypothetical protein  25.81 
 
 
428 aa  88.6  2e-16  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.374771  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01753  hypothetical protein  24.72 
 
 
427 aa  87.8  3e-16  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1858  protein of unknown function DUF444  24.72 
 
 
427 aa  87.8  3e-16  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0100922  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2508  hypothetical protein  24.72 
 
 
427 aa  87.8  3e-16  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.482436  normal  0.930565 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01741  hypothetical protein  24.72 
 
 
427 aa  87.8  3e-16  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1870  hypothetical protein  24.72 
 
 
427 aa  87.8  3e-16  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.188375  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2008  hypothetical protein  24.72 
 
 
427 aa  87.8  3e-16  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1848  hypothetical protein  24.72 
 
 
427 aa  87.8  3e-16  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.0243705 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2032  hypothetical protein  24.72 
 
 
427 aa  87.8  4e-16  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2256  hypothetical protein  28.57 
 
 
424 aa  87.4  4e-16  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1960  hypothetical protein  28.57 
 
 
424 aa  87.4  4e-16  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0592  hypothetical protein  34.46 
 
 
384 aa  87.4  4e-16  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2883  hypothetical protein  27.36 
 
 
422 aa  87.4  5e-16  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1570  hypothetical protein  27.36 
 
 
424 aa  87.4  5e-16  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0194924  normal  0.404003 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1645  hypothetical protein  27.36 
 
 
424 aa  87.4  5e-16  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00220119  hitchhiker  0.00165359 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1992  hypothetical protein  24.58 
 
 
424 aa  87.4  5e-16  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0160685  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0427  hypothetical protein  33.15 
 
 
424 aa  87  5e-16  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.225763  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2102  hypothetical protein  24.58 
 
 
424 aa  87.4  5e-16  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.277028  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4018  hypothetical protein  23.91 
 
 
423 aa  87  6e-16  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2328  hypothetical protein  35.17 
 
 
422 aa  86.7  7e-16  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.40975  normal  0.858132 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2447  hypothetical protein  28.3 
 
 
428 aa  85.9  0.000000000000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.319583  normal  0.0698328 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1407  hypothetical protein  24.44 
 
 
427 aa  85.9  0.000000000000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.955409  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0396  hypothetical protein  32.6 
 
 
440 aa  85.5  0.000000000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1377  hypothetical protein  29.25 
 
 
428 aa  85.5  0.000000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.990404 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1410  hypothetical protein  29.25 
 
 
428 aa  85.5  0.000000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.123931  normal  0.301036 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1394  hypothetical protein  29.25 
 
 
428 aa  85.5  0.000000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000594429 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1891  hypothetical protein  29.25 
 
 
428 aa  85.5  0.000000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.575016  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2072  hypothetical protein  29.25 
 
 
428 aa  85.5  0.000000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000406999 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1637  hypothetical protein  26.89 
 
 
424 aa  85.5  0.000000000000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00171589  normal  0.194153 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1228  hypothetical protein  24.76 
 
 
423 aa  85.5  0.000000000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.194655 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0430  hypothetical protein  32.6 
 
 
423 aa  85.1  0.000000000000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.220471  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2732  hypothetical protein  23.46 
 
 
422 aa  85.1  0.000000000000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.66622  hitchhiker  0.00119744 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2216  hypothetical protein  33.71 
 
 
422 aa  84.3  0.000000000000003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0511  hypothetical protein  32.58 
 
 
387 aa  84.3  0.000000000000004  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1670  hypothetical protein  24.5 
 
 
427 aa  84.3  0.000000000000004  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2220  hypothetical protein  24.3 
 
 
431 aa  84.3  0.000000000000004  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3962  hypothetical protein  31.28 
 
 
433 aa  84.3  0.000000000000004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.0275062 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1961  hypothetical protein  27.36 
 
 
422 aa  83.6  0.000000000000006  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.926778  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4632  hypothetical protein  23.92 
 
 
423 aa  82.8  0.00000000000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.209596 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2021  hypothetical protein  31.73 
 
 
432 aa  82.8  0.00000000000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2386  hypothetical protein  28.03 
 
 
424 aa  82.8  0.00000000000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1832  hypothetical protein  28.71 
 
 
422 aa  82.8  0.00000000000001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6237  hypothetical protein  31.53 
 
 
436 aa  82.8  0.00000000000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7068  hypothetical protein  32.83 
 
 
436 aa  82.4  0.00000000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0546  hypothetical protein  36.15 
 
 
423 aa  82  0.00000000000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1637  hypothetical protein  26.42 
 
 
421 aa  82.4  0.00000000000002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0700293  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2335  hypothetical protein  31.79 
 
 
434 aa  81.6  0.00000000000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.617679 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1393  hypothetical protein  24.94 
 
 
427 aa  82  0.00000000000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1222  hypothetical protein  28.43 
 
 
430 aa  82.4  0.00000000000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.134791 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2060  hypothetical protein  31.79 
 
 
434 aa  81.6  0.00000000000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.614387  normal  0.107647 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1978  hypothetical protein  25.89 
 
 
425 aa  81.3  0.00000000000003  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.176712  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5140  hypothetical protein  25.41 
 
 
423 aa  81.3  0.00000000000004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_46880  hypothetical protein  34.62 
 
 
424 aa  81.3  0.00000000000004  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2568  hypothetical protein  37.78 
 
 
422 aa  80.9  0.00000000000004  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0567655  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0346  hypothetical protein  29.35 
 
 
421 aa  80.5  0.00000000000006  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.315691  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>