More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Glov_0246 on replicon NC_010814
Organism: Geobacter lovleyi SZ



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010814  Glov_0246  ABC transporter related  100 
 
 
506 aa  1033    Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1023  ABC transporter related  49.6 
 
 
506 aa  474  1e-132  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1609  ABC transporter related  44.38 
 
 
504 aa  395  1e-109  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  decreased coverage  0.0000030441  hitchhiker  0.000000000000475647 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_11870  ATPase component of ABC transporters with duplicated ATPase domain protein  42.15 
 
 
531 aa  378  1e-103  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0211  ABC transporter related  40.08 
 
 
515 aa  364  2e-99  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal  0.182312 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2987  ABC transporter related  37.5 
 
 
496 aa  248  1e-64  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.769539  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2801  ABC transporter, ATPase subunit  36.97 
 
 
496 aa  241  2e-62  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.712574  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2896  ABC transporter-related protein  36.97 
 
 
496 aa  240  5e-62  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.601917  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2755  ABC transporter related  37.4 
 
 
507 aa  238  2e-61  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2346  ABC transporter ATP-binding protein  28.01 
 
 
542 aa  162  2e-38  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.574829  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2617  ABC transporter, ATP-binding protein  27.33 
 
 
548 aa  160  3e-38  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000147161 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2750  nucleotide-binding protein ExpZ  27.29 
 
 
548 aa  161  3e-38  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000173219 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2534  ABC transporter related  28.07 
 
 
542 aa  160  5e-38  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.165488  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2573  ABC transporter, ATP-binding protein  26.79 
 
 
542 aa  158  2e-37  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.160568  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2620  ABC transporter, ATP-binding protein, putative  27.48 
 
 
542 aa  158  3e-37  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.00269042  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2658  ABC transporter, ATP-binding protein  27.48 
 
 
548 aa  158  3e-37  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000890134  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3169  ABC transporter related  31.08 
 
 
541 aa  156  6e-37  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000739402 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4514  ABC transporter-related protein  30.87 
 
 
535 aa  156  7e-37  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  hitchhiker  0.00577215  normal  0.484903 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7127  ABC transporter related  29.94 
 
 
541 aa  156  8e-37  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.618924 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2381  ABC transporter, ATP-binding protein  27.23 
 
 
543 aa  155  2e-36  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.138547  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2791  ABC transporter related  29.07 
 
 
487 aa  155  2e-36  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.741515 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3596  ABC transporter related  29.38 
 
 
527 aa  155  2e-36  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.737822  normal 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0831  ABC transporter related  27.4 
 
 
577 aa  151  3e-35  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.00618018  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2181  ABC transporter related  29.8 
 
 
565 aa  149  1.0000000000000001e-34  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0163034  normal  0.527959 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4308  ABC transporter-related protein  30.47 
 
 
539 aa  149  2.0000000000000003e-34  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0518  ABC transporter related  27.63 
 
 
533 aa  146  8.000000000000001e-34  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5386  ABC transporter ATP-binding protein  28.26 
 
 
544 aa  145  2e-33  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.221909  normal  0.37846 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3220  ABC transporter related  28.41 
 
 
653 aa  143  7e-33  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000221597  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4684  ABC transporter related protein  32.08 
 
 
536 aa  142  9.999999999999999e-33  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4068  ABC transporter related  26.92 
 
 
630 aa  142  9.999999999999999e-33  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.000000802504  hitchhiker  0.000858095 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0368  ABC transporter related  26.58 
 
 
606 aa  141  1.9999999999999998e-32  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4406  ABC transporter related protein  27.3 
 
 
630 aa  141  1.9999999999999998e-32  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.336146  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2147  ABC transporter related protein  29.44 
 
 
554 aa  142  1.9999999999999998e-32  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.168618  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0497  ABC transporter, ATP-binding protein  24.61 
 
 
523 aa  142  1.9999999999999998e-32  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.208057 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0945  ABC transporter related  27.07 
 
 
580 aa  141  3e-32  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4972  ABC transporter related  28.42 
 
 
544 aa  140  4.999999999999999e-32  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0873  ABC transporter, ATP-binding protein  26.36 
 
 
487 aa  140  7e-32  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0750  ABC transporter related  27.36 
 
 
537 aa  140  7.999999999999999e-32  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2364  ABC transporter related  26.69 
 
 
642 aa  139  1e-31  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.217741  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4241  ABC transporter related  29.52 
 
 
537 aa  139  1e-31  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.189048 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0963  ABC transporter related  27.95 
 
 
526 aa  139  1e-31  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5951  ABC transporter related protein  29.6 
 
 
558 aa  139  1e-31  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.810064 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4011  ABC transporter related  29.52 
 
 
537 aa  139  1e-31  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.460893  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4085  ABC transporter related  29.52 
 
 
537 aa  139  1e-31  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.425666  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2836  ABC transporter related  30.02 
 
 
546 aa  138  2e-31  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1613  ABC transporter-related protein  27.95 
 
 
630 aa  138  3.0000000000000003e-31  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000050504  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3897  ABC transporter related  27.24 
 
 
613 aa  138  3.0000000000000003e-31  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2495  ABC transporter  25.99 
 
 
529 aa  137  4e-31  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5296  putative macrolide efflux pump  29.09 
 
 
544 aa  137  5e-31  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1374  ABC transporter-related protein  27.7 
 
 
610 aa  136  8e-31  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0334  ABC transporter related protein  27.33 
 
 
606 aa  135  9.999999999999999e-31  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.136705  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1888  ABC transporter related  29.34 
 
 
545 aa  135  9.999999999999999e-31  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3547  ABC transporter-like protein protein  25.38 
 
 
640 aa  135  1.9999999999999998e-30  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2190  ABC transporter, ATP-binding protein  28.04 
 
 
631 aa  134  3e-30  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.783831 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_15950  ATPase component of ABC transporters with duplicated ATPase domain  27.91 
 
 
550 aa  134  3e-30  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0299  ABC transporter related  27.13 
 
 
642 aa  134  3e-30  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1085  ABC transporter related  25.85 
 
 
534 aa  134  3e-30  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000470508  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2312  ABC transporter related  26.76 
 
 
642 aa  134  5e-30  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03121  ABC transporter ATP-binding protein  25.75 
 
 
530 aa  134  5e-30  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0047  ABC transporter component  28.18 
 
 
535 aa  133  6.999999999999999e-30  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2308  ABC transporter, ATP-binding protein  28.04 
 
 
631 aa  133  7.999999999999999e-30  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000184058  n/a   
 
 
-
 
NC_011688  PHATRDRAFT_51174  predicted protein  27.11 
 
 
623 aa  133  7.999999999999999e-30  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2973  ABC transporter related  29.93 
 
 
546 aa  133  7.999999999999999e-30  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06614  hypothetical protein  25.61 
 
 
526 aa  133  9e-30  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3334  ABC transporter related  27.98 
 
 
637 aa  133  9e-30  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.115349 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2766  ABC transporter, ATP-binding protein  25.71 
 
 
521 aa  132  1.0000000000000001e-29  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0491169  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1982  ABC transporter, ATP-binding protein  27.87 
 
 
631 aa  132  1.0000000000000001e-29  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000663544  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2220  ABC transporter related  25.62 
 
 
492 aa  132  1.0000000000000001e-29  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1964  ABC transporter, ATP-binding protein  27.87 
 
 
631 aa  132  1.0000000000000001e-29  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0386922  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2000  ABC transporter related  27.66 
 
 
631 aa  132  1.0000000000000001e-29  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000123424  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2003  ABC transporter related  25.8 
 
 
528 aa  132  1.0000000000000001e-29  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.118433  decreased coverage  0.00762466 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2884  ABC transporter related  26.63 
 
 
634 aa  132  2.0000000000000002e-29  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.314966  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2480  ABC transporter related  27.57 
 
 
529 aa  131  3e-29  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3997  ABC transporter related  27.13 
 
 
641 aa  131  3e-29  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2225  ABC transporter, ATP-binding protein  27.87 
 
 
631 aa  131  4.0000000000000003e-29  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.0000195061  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2194  ABC transporter related  27.68 
 
 
464 aa  130  4.0000000000000003e-29  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1612  ABC transporter related  25.83 
 
 
495 aa  131  4.0000000000000003e-29  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.052092  normal 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0218  ABC transporter, ATP-binding protein  25.86 
 
 
525 aa  130  5.0000000000000004e-29  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.307752  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3145  ABC transporter, ATP-binding protein  27.93 
 
 
631 aa  130  6e-29  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.0000000568363  normal  0.0176571 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2077  ABC transporter related  26.78 
 
 
553 aa  130  6e-29  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0247  ABC transporter-related protein  26.11 
 
 
659 aa  130  6e-29  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6267  ABC transporter, fused ATPase subunits  28.44 
 
 
548 aa  130  7.000000000000001e-29  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1709  ABC transporter related  25.93 
 
 
530 aa  130  7.000000000000001e-29  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4130  ABC transporter related  25.56 
 
 
533 aa  130  8.000000000000001e-29  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1237  ABC transporter related  24.36 
 
 
638 aa  129  9.000000000000001e-29  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  0.00000223212  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1747  ABC transporter related  27.19 
 
 
615 aa  129  9.000000000000001e-29  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.219257  normal  0.123618 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0690  ABC transporter related  27.86 
 
 
636 aa  129  1.0000000000000001e-28  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2936  ABC transporter ATP-binding protein  26.55 
 
 
528 aa  129  1.0000000000000001e-28  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.914866  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2010  ABC transporter ATP-binding protein  27.87 
 
 
631 aa  129  1.0000000000000001e-28  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  unclonable  0.00000675061  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2164  ABC transporter ATP-binding protein  27.87 
 
 
631 aa  129  1.0000000000000001e-28  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00326588  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0568  ABC transporter related protein  26.52 
 
 
632 aa  129  1.0000000000000001e-28  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4180  ABC transporter related  26.7 
 
 
534 aa  129  1.0000000000000001e-28  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0101186  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0818  ABC transporter ATPase  24.85 
 
 
501 aa  129  1.0000000000000001e-28  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  decreased coverage  0.00000307399  normal  0.444871 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4100  ABC transporter-related protein  25.79 
 
 
533 aa  128  2.0000000000000002e-28  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0935  ABC transporter related  26.81 
 
 
530 aa  129  2.0000000000000002e-28  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1681  ABC transporter related  26.04 
 
 
522 aa  129  2.0000000000000002e-28  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.607164  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0770  ABC transporter related  25.58 
 
 
629 aa  129  2.0000000000000002e-28  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.0943746 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3988  ABC transporter, ATPase subunit  25.79 
 
 
533 aa  129  2.0000000000000002e-28  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1770  ABC transporter related  25.93 
 
 
530 aa  128  2.0000000000000002e-28  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.210956  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2215  ABC transporter related  27.61 
 
 
545 aa  129  2.0000000000000002e-28  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.242507  normal  0.0157835 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>