More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Apar_0211 on replicon NC_013203
Organism: Atopobium parvulum DSM 20469



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013203  Apar_0211  ABC transporter related  100 
 
 		 515 aa  1063    Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  0.182312 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_11870  ATPase component of ABC transporters with duplicated ATPase domain protein  65.95 
 
 		 531 aa  703    Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1609  ABC transporter related  41.63 
 
 		 504 aa  371  1e-101  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  decreased coverage  0.0000030441  hitchhiker  0.000000000000475647 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0246  ABC transporter related  40.87 
 
 		 506 aa  361  2e-98  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1023  ABC transporter related  39.41 
 
 		 506 aa  360  3e-98  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2987  ABC transporter related  35.97 
 
 		 496 aa  243  7e-63  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.769539  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2801  ABC transporter, ATPase subunit  35.64 
 
 		 496 aa  234  2.0000000000000002e-60  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.712574  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2896  ABC transporter-related protein  35.05 
 
 		 496 aa  234  3e-60  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.601917  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2755  ABC transporter related  33.6 
 
 		 507 aa  221  3e-56  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2750  nucleotide-binding protein ExpZ  26.21 
 
 		 548 aa  159  1e-37  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000173219 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3596  ABC transporter related  29.64 
 
 		 527 aa  155  1e-36  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.737822  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2617  ABC transporter, ATP-binding protein  26.26 
 
 		 548 aa  155  2e-36  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000147161 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2573  ABC transporter, ATP-binding protein  26.52 
 
 		 542 aa  155  2e-36  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.160568  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2658  ABC transporter, ATP-binding protein  26.53 
 
 		 548 aa  154  4e-36  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000890134  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4972  ABC transporter related  28.78 
 
 		 544 aa  154  4e-36  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1754  ABC transporter related  26.89 
 
 		 625 aa  154  5e-36  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.544165  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2534  ABC transporter related  25.79 
 
 		 542 aa  154  5e-36  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.165488  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2620  ABC transporter, ATP-binding protein, putative  26.46 
 
 		 542 aa  153  5.9999999999999996e-36  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.00269042  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0047  ABC transporter component  29.4 
 
 		 535 aa  153  7e-36  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7127  ABC transporter related  28.22 
 
 		 541 aa  153  8e-36  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.618924 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2346  ABC transporter ATP-binding protein  26.26 
 
 		 542 aa  153  8.999999999999999e-36  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.574829  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0945  ABC transporter related  27.35 
 
 		 580 aa  152  1e-35  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2381  ABC transporter, ATP-binding protein  26.26 
 
 		 543 aa  151  3e-35  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.138547  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0692  ABC transporter, ATP-binding protein  26.83 
 
 		 627 aa  150  5e-35  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.242868  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4267  ABC transporter related  27.78 
 
 		 621 aa  150  5e-35  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.183783  normal  0.517303 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4634  ABC transporter related  27.59 
 
 		 621 aa  150  7e-35  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0506  ABC transporter related  28.52 
 
 		 691 aa  149  8e-35  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1085  ABC transporter related  29.12 
 
 		 534 aa  149  9e-35  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000470508  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0683  ABC transporter, ATP-binding protein  26.83 
 
 		 640 aa  149  1.0000000000000001e-34  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0247  ABC transporter-related protein  26.13 
 
 		 659 aa  148  2.0000000000000003e-34  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4782  ABC transporter related  27.43 
 
 		 620 aa  147  5e-34  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.372131  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5296  putative macrolide efflux pump  28.63 
 
 		 544 aa  146  7.0000000000000006e-34  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0284  ABC transporter, ATP-binding protein  26.63 
 
 		 662 aa  145  2e-33  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.541093  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0248  ABC transporter ATP-binding protein  26.63 
 
 		 658 aa  145  2e-33  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0312  ABC transporter, ATP-binding protein  26.63 
 
 		 644 aa  145  2e-33  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0790869  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0234  ABC transporter, ATP-binding protein  26.63 
 
 		 658 aa  145  2e-33  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0393194  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0262  ABC transporter ATP-binding protein  26.63 
 
 		 640 aa  145  2e-33  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00579905  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2596  ABC transporter related  25.94 
 
 		 627 aa  145  2e-33  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4996  ABC transporter related  25 
 
 		 620 aa  145  2e-33  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4514  ABC transporter-related protein  28.88 
 
 		 535 aa  145  2e-33  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  hitchhiker  0.00577215  normal  0.484903 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0236  ABC transporter, ATP-binding protein  26.63 
 
 		 658 aa  144  3e-33  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.281236  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0288  ABC transporter, ATP-binding protein  26.63 
 
 		 658 aa  144  3e-33  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0293  ABC transporter, ATP-binding protein  26.44 
 
 		 659 aa  144  3e-33  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0524615  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0935  ABC transporter related  28.55 
 
 		 530 aa  144  4e-33  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0831  ABC transporter related  26.92 
 
 		 577 aa  144  6e-33  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.00618018  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2791  ABC transporter related  29.27 
 
 		 487 aa  142  9.999999999999999e-33  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.741515 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0093  ABC transporter ATP-binding protein  28.19 
 
 		 536 aa  142  9.999999999999999e-33  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.785822  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0963  ABC transporter related  27.84 
 
 		 526 aa  142  9.999999999999999e-33  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5028  macrolide efflux pump  28.75 
 
 		 544 aa  141  1.9999999999999998e-32  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5409  macrolide efflux pump  28.75 
 
 		 544 aa  141  1.9999999999999998e-32  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.952575  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4873  MDR-type ABC transporter, ATP-binding protein  28.9 
 
 		 544 aa  141  3e-32  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1500  ABC transporter related  26.36 
 
 		 630 aa  141  3e-32  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.384495  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0241  ABC transporter related  26.21 
 
 		 658 aa  141  3e-32  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.348865  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0660  ABC transporter related  27.27 
 
 		 626 aa  140  3.9999999999999997e-32  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.14515  normal  0.023928 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1888  ABC transporter related  28.02 
 
 		 545 aa  140  3.9999999999999997e-32  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1008  Fis family transcriptional regulator  26.44 
 
 		 629 aa  140  3.9999999999999997e-32  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0900  ABC transporter related  26.65 
 
 		 666 aa  140  3.9999999999999997e-32  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5031  ABC transporter, ATP-binding protein  26.21 
 
 		 644 aa  140  4.999999999999999e-32  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0210373  normal  0.641963 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5386  ABC transporter ATP-binding protein  27.29 
 
 		 544 aa  140  7e-32  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.221909  normal  0.37846 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1447  ABC transporter related  27.61 
 
 		 632 aa  140  7.999999999999999e-32  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0780  ATPase  26.45 
 
 		 630 aa  139  8.999999999999999e-32  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.989868  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3897  ABC transporter related  26.25 
 
 		 613 aa  139  1e-31  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5328  ABC transporter related  27.21 
 
 		 524 aa  139  1e-31  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.862409 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1220  ABC transporter related  25.79 
 
 		 627 aa  139  1e-31  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000289587 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0067  ABC transporter related  24.55 
 
 		 581 aa  138  2e-31  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_01021  ABC transporter, ATP binding component  29.2 
 
 		 541 aa  139  2e-31  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.663375  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4858  MDR-type ABC transporter, ATP-binding protein  28.69 
 
 		 544 aa  137  3.0000000000000003e-31  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_14070  ABC transporter related  26.18 
 
 		 640 aa  138  3.0000000000000003e-31  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0328486  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3220  ABC transporter related  25.27 
 
 		 653 aa  137  3.0000000000000003e-31  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000221597  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5053  putative ABC transporter ATP-binding protein  27.88 
 
 		 536 aa  138  3.0000000000000003e-31  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2144  ABC transporter related  25.91 
 
 		 529 aa  138  3.0000000000000003e-31  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0972  ABC transporter related  25.8 
 
 		 626 aa  137  4e-31  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0066159 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0568  ABC transporter related protein  28.68 
 
 		 632 aa  137  4e-31  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5266  putative macrolide efflux pump  28.69 
 
 		 544 aa  137  4e-31  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2428  ABC transporter related  26.43 
 
 		 625 aa  137  5e-31  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0822  ABC transporter related  28.11 
 
 		 531 aa  136  7.000000000000001e-31  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0684569  normal  0.79375 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1761  ABC transporter related  26.92 
 
 		 647 aa  136  8e-31  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0375  ATPase  26.68 
 
 		 631 aa  136  9e-31  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3169  ABC transporter related  28.11 
 
 		 541 aa  136  9e-31  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000739402 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0368  ABC transporter related  24.39 
 
 		 606 aa  136  9.999999999999999e-31  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_01041  ABC transporter, ATP binding component  28.71 
 
 		 541 aa  135  9.999999999999999e-31  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.15596  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1075  ABC transporter related  25 
 
 		 627 aa  136  9.999999999999999e-31  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000840512 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4548  ABC transporter related protein  26.97 
 
 		 644 aa  135  9.999999999999999e-31  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.550971 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4011  ABC transporter related  27.83 
 
 		 537 aa  136  9.999999999999999e-31  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.460893  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1823  ABC transporter related  25.92 
 
 		 632 aa  136  9.999999999999999e-31  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  decreased coverage  0.00644209  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4241  ABC transporter related  27.83 
 
 		 537 aa  136  9.999999999999999e-31  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.189048 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4085  ABC transporter related  27.83 
 
 		 537 aa  136  9.999999999999999e-31  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.425666  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0854  ABC transporter ATP-binding protein  25.09 
 
 		 534 aa  135  1.9999999999999998e-30  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2270  ABC transporter related protein  27.91 
 
 		 540 aa  135  1.9999999999999998e-30  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.196548  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2884  ABC transporter related  26.08 
 
 		 634 aa  135  1.9999999999999998e-30  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.314966  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2115  ABC transporter related  25.67 
 
 		 621 aa  135  1.9999999999999998e-30  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.0255573  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3830  ABC transporter-related protein  27.48 
 
 		 632 aa  135  1.9999999999999998e-30  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.457691 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1436  ABC transporter ATPase  29.6 
 
 		 527 aa  135  1.9999999999999998e-30  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1158  ABC transporter ATPase  26.73 
 
 		 635 aa  135  1.9999999999999998e-30  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4684  ABC transporter related protein  26.42 
 
 		 536 aa  135  1.9999999999999998e-30  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0770  ABC transporter related  25.05 
 
 		 629 aa  134  3e-30  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.0943746 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01943  ABC transporter ATP-binding protein  27.19 
 
 		 630 aa  134  3e-30  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2896  ABC transporter-like protein  28.55 
 
 		 549 aa  134  3e-30  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1101  ABC transporter related protein  29.38 
 
 		 641 aa  134  3.9999999999999996e-30  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2877  ABC transporter related  26.39 
 
 		 621 aa  134  3.9999999999999996e-30  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.358823  normal  0.296098 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>