87 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbem_3283 on replicon NC_011146
Organism: Geobacter bemidjiensis Bem



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011146  Gbem_3283  inhibitor of MCP methylation CheC-like protein  100 
 
 		 166 aa  336  8e-92  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0966  inhibitor of MCP methylation CheC-like protein  92.77 
 
 		 166 aa  314  3e-85  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4219  inhibitor of MCP methylation CheC-like protein  54.82 
 
 		 168 aa  185  3e-46  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3844  inhibitor of MCP methylation CheC-like protein  53.61 
 
 		 169 aa  180  7e-45  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3928  inhibitor of MCP methylation CheC-like protein  53.61 
 
 		 169 aa  180  1e-44  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.045223 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3118  hypothetical protein  50.6 
 
 		 168 aa  176  9e-44  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3420  hypothetical protein  50 
 
 		 168 aa  176  1e-43  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0404  hypothetical protein  51.2 
 
 		 168 aa  175  3e-43  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.639025  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3310  hypothetical protein  47.65 
 
 		 172 aa  154  6e-37  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1829  hypothetical protein  42.51 
 
 		 168 aa  139  1.9999999999999998e-32  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.666718  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0650  inhibitor of MCP methylation, CheC-like protein  37.8 
 
 		 158 aa  129  2.0000000000000002e-29  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.207901 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3060  hypothetical protein  42.58 
 
 		 166 aa  124  5e-28  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00029683  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0132  hypothetical protein  42.5 
 
 		 168 aa  122  3e-27  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0184  putative chemotaxis protein CheX  42.68 
 
 		 169 aa  122  3e-27  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000013186  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1206  inhibitor of MCP methylation, CheC-like  36.81 
 
 		 152 aa  121  5e-27  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.333742  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0567  hypothetical protein  33.99 
 
 		 157 aa  99.4  2e-20  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00522543  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3133  chemotaxis protein CheX, putative  33.57 
 
 		 152 aa  86.3  2e-16  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0717  chemotaxis protein CheX, putative  32.88 
 
 		 152 aa  86.3  2e-16  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.908176  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1196  chemotaxis protein CheX, putative  29.2 
 
 		 160 aa  79.7  0.00000000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.5213  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0281  chemotaxis protein CheX, putative  28.77 
 
 		 155 aa  77  0.0000000000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.180055  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0248  CheC-like protein  32.54 
 
 		 154 aa  74.7  0.0000000000005  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0557914  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1817  chemotaxis protein CheX, putative  28.08 
 
 		 154 aa  74.3  0.0000000000007  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2679  chemotaxis protein CheX, putative  28.77 
 
 		 155 aa  73.2  0.000000000002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.513529 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0436  hypothetical protein  30.63 
 
 		 176 aa  70.5  0.00000000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0739  CheC domain protein  30.65 
 
 		 154 aa  70.1  0.00000000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000054191  hitchhiker  0.000000000759122 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3636  putative chemotaxis protein CheX  30.65 
 
 		 154 aa  70.1  0.00000000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0000517443  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0719  putative chemotaxis protein CheX  30.65 
 
 		 154 aa  70.1  0.00000000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.00000000137536  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0748  CheC domain-containing protein  30.65 
 
 		 154 aa  69.7  0.00000000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.000188683  hitchhiker  0.000145879 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0386  putative chemotaxis protein  30.65 
 
 		 164 aa  68.9  0.00000000003  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.352728  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3246  putative chemotaxis protein CheX  29.84 
 
 		 154 aa  68.9  0.00000000003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00000130186  hitchhiker  0.00000986039 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0696  putative chemotaxis protein CheX  29.84 
 
 		 154 aa  68.9  0.00000000003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.0000403522  hitchhiker  0.000308121 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2921  hypothetical protein  36.56 
 
 		 184 aa  68.9  0.00000000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0715  putative chemotaxis protein CheX  29.84 
 
 		 154 aa  68.9  0.00000000003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00000857864  hitchhiker  0.000181388 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3915  hypothetical protein  29.84 
 
 		 154 aa  68.6  0.00000000004  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00011  chemotaxis protein CheX  29.84 
 
 		 153 aa  66.6  0.0000000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3056  putative chemotaxis protein CheX  29.84 
 
 		 154 aa  66.6  0.0000000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.23032  normal  0.617715 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0760  putative chemotaxis protein CheX  29.03 
 
 		 154 aa  66.2  0.0000000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00000652399  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002342  chemotaxis protein CheX  29.84 
 
 		 153 aa  66.6  0.0000000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4092  hypothetical protein  25.75 
 
 		 171 aa  65.9  0.0000000003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0178506  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0409  cheC-like family protein  28.15 
 
 		 154 aa  65.1  0.0000000005  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2787  hypothetical protein  29.84 
 
 		 153 aa  63.9  0.0000000008  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.834766  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0523  CheC-like protein  29.03 
 
 		 155 aa  62.4  0.000000003  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000195961  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0765  putative chemotaxis protein CheX  28.23 
 
 		 154 aa  62.4  0.000000003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000000000539649 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3344  CheC domain-containing protein  29.03 
 
 		 155 aa  62.4  0.000000003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3275  CheC domain-containing protein  28.23 
 
 		 154 aa  62  0.000000004  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000378704 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1986  chemotaxis protein CheX, putative  30.07 
 
 		 158 aa  61.6  0.000000004  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00638  CheC-like protein  25 
 
 		 154 aa  60.5  0.00000001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.00187096  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2135  putative chemotaxis protein CheX  28.46 
 
 		 164 aa  60.5  0.00000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.234891  normal  0.802402 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2009  inhibitor of MCP methylation-like protein  31.25 
 
 		 165 aa  58.5  0.00000004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.458725  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0151  CheC domain-containing protein  31.13 
 
 		 156 aa  58.2  0.00000005  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.176363  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4204  CheC domain-containing protein  27.42 
 
 		 204 aa  56.6  0.0000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.994344  hitchhiker  0.00000174212 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1092  putative chemotaxis protein CheX  26.45 
 
 		 159 aa  54.3  0.0000008  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.391751 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2875  CheC domain protein  28.28 
 
 		 171 aa  53.9  0.000001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0888  inhibitor of MCP methylation-like protein  26.06 
 
 		 166 aa  53.9  0.000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0522691  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3372  inhibitor of MCP methylation-like protein  26.06 
 
 		 166 aa  51.6  0.000005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1769  inhibitor of MCP methylation-like protein  23.49 
 
 		 217 aa  49.7  0.00002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0802325  hitchhiker  0.000530497 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0634  CheC domain protein  28.04 
 
 		 160 aa  50.1  0.00002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0387  CheC-like family protein  27.73 
 
 		 149 aa  49.3  0.00002  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.535958 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2308  CheC-like protein  27.54 
 
 		 154 aa  49.7  0.00002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1282  CheC domain-containing protein  29.01 
 
 		 155 aa  48.9  0.00003  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.233529  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2134  CheC domain protein  29.81 
 
 		 158 aa  48.5  0.00004  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3584  hypothetical protein  28.03 
 
 		 152 aa  48.1  0.00005  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1530  type IV pilus assembly PilZ  27.48 
 
 		 300 aa  48.1  0.00005  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.174773  normal  0.910266 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0126  CheC-like protein  27.1 
 
 		 154 aa  48.5  0.00005  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.000893437  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1786  hypothetical protein  36.14 
 
 		 153 aa  47.8  0.00007  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.12078  normal  0.851363 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1999  hypothetical protein  34.92 
 
 		 162 aa  47  0.0001  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2318  hypothetical protein  36.8 
 
 		 161 aa  46.6  0.0001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1604  CheC, inhibitor of MCP methylation  22 
 
 		 464 aa  47  0.0001  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1176  CheC-like protein  32.2 
 
 		 148 aa  46.6  0.0001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1173  CheC domain-containing protein  29.01 
 
 		 155 aa  47  0.0001  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.362697  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1530  hypothetical protein  28.44 
 
 		 172 aa  45.8  0.0002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1768  inhibitor of MCP methylation-like protein  27.06 
 
 		 159 aa  46.2  0.0002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0985649  hitchhiker  0.00193959 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1904  inhibitor of MCP methylation-like protein  32.61 
 
 		 163 aa  46.2  0.0002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00098373  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0324  hypothetical protein  34.72 
 
 		 167 aa  45.1  0.0005  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.460798  normal  0.496823 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3596  hypothetical protein  30.77 
 
 		 150 aa  45.1  0.0005  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0500  hypothetical protein  29.36 
 
 		 350 aa  44.3  0.0008  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.260407  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0484  CheC domain-containing protein  27.84 
 
 		 155 aa  44.3  0.0008  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1446  CheX protein (uncharacterized ORF in chemotaxis operon)  29.75 
 
 		 152 aa  43.9  0.001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.238883  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2279  CheC domain protein  26.85 
 
 		 154 aa  43.1  0.002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0352491  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2059  hypothetical protein  23.89 
 
 		 159 aa  42.7  0.002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0826  CheC domain-containing protein  30.38 
 
 		 155 aa  43.1  0.002  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0811  chemotaxis protein CheX, putative  30 
 
 		 167 aa  42  0.003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_30880  hypothetical protein  31.93 
 
 		 157 aa  42  0.004  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2263  CheC domain protein  28.3 
 
 		 152 aa  41.6  0.005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000000104148  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0691  CheC-like family protein  29.82 
 
 		 161 aa  41.6  0.005  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  0.0452521  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_5000  hypothetical protein  36.51 
 
 		 183 aa  41.2  0.006  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3272  hypothetical protein  28.95 
 
 		 159 aa  40.8  0.009  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.265581  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>