69 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CPS_0409 on replicon NC_003910
Organism: Colwellia psychrerythraea 34H



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_003910  CPS_0409  cheC-like family protein  100 
 
 		 154 aa  308  2e-83  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0386  putative chemotaxis protein  62.75 
 
 		 164 aa  212  1.9999999999999998e-54  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.352728  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00011  chemotaxis protein CheX  60.78 
 
 		 153 aa  207  5e-53  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002342  chemotaxis protein CheX  60.78 
 
 		 153 aa  207  5e-53  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3275  CheC domain-containing protein  65.36 
 
 		 154 aa  205  2e-52  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000378704 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0523  CheC-like protein  63.64 
 
 		 155 aa  203  8e-52  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000195961  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3056  putative chemotaxis protein CheX  62.75 
 
 		 154 aa  202  1e-51  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.23032  normal  0.617715 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3344  CheC domain-containing protein  62.34 
 
 		 155 aa  200  5e-51  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2787  hypothetical protein  58.17 
 
 		 153 aa  200  7e-51  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.834766  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3915  hypothetical protein  62.09 
 
 		 154 aa  199  9.999999999999999e-51  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3246  putative chemotaxis protein CheX  62.09 
 
 		 154 aa  198  1.9999999999999998e-50  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00000130186  hitchhiker  0.00000986039 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0715  putative chemotaxis protein CheX  62.09 
 
 		 154 aa  197  3e-50  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00000857864  hitchhiker  0.000181388 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0696  putative chemotaxis protein CheX  62.09 
 
 		 154 aa  198  3e-50  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.0000403522  hitchhiker  0.000308121 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0719  putative chemotaxis protein CheX  62.09 
 
 		 154 aa  197  3.9999999999999996e-50  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.00000000137536  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0739  CheC domain protein  62.09 
 
 		 154 aa  197  3.9999999999999996e-50  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000054191  hitchhiker  0.000000000759122 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3636  putative chemotaxis protein CheX  62.09 
 
 		 154 aa  197  3.9999999999999996e-50  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0000517443  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0760  putative chemotaxis protein CheX  62.09 
 
 		 154 aa  197  3.9999999999999996e-50  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00000652399  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0748  CheC domain-containing protein  62.09 
 
 		 154 aa  197  3.9999999999999996e-50  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.000188683  hitchhiker  0.000145879 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0765  putative chemotaxis protein CheX  63.4 
 
 		 154 aa  197  5e-50  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000000000539649 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4204  CheC domain-containing protein  64.29 
 
 		 204 aa  195  2.0000000000000003e-49  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.994344  hitchhiker  0.00000174212 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0248  CheC-like protein  55.19 
 
 		 154 aa  183  9e-46  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0557914  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00638  CheC-like protein  51.95 
 
 		 154 aa  178  2.9999999999999997e-44  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.00187096  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1196  chemotaxis protein CheX, putative  41.06 
 
 		 160 aa  129  1.0000000000000001e-29  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.5213  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0281  chemotaxis protein CheX, putative  40.4 
 
 		 155 aa  129  2.0000000000000002e-29  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.180055  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2679  chemotaxis protein CheX, putative  40.4 
 
 		 155 aa  123  8.000000000000001e-28  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.513529 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1817  chemotaxis protein CheX, putative  39.74 
 
 		 154 aa  120  6e-27  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3133  chemotaxis protein CheX, putative  35.29 
 
 		 152 aa  114  5e-25  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0717  chemotaxis protein CheX, putative  34.64 
 
 		 152 aa  112  1.0000000000000001e-24  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.908176  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1986  chemotaxis protein CheX, putative  33.33 
 
 		 158 aa  95.1  3e-19  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2875  CheC domain protein  31.01 
 
 		 171 aa  78.2  0.00000000000004  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3420  hypothetical protein  32.31 
 
 		 168 aa  72.4  0.000000000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3928  inhibitor of MCP methylation CheC-like protein  32.31 
 
 		 169 aa  69.7  0.00000000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.045223 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4219  inhibitor of MCP methylation CheC-like protein  31.5 
 
 		 168 aa  69.7  0.00000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3844  inhibitor of MCP methylation CheC-like protein  32.31 
 
 		 169 aa  68.6  0.00000000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3118  hypothetical protein  33.08 
 
 		 168 aa  67.8  0.00000000005  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3283  inhibitor of MCP methylation CheC-like protein  28.15 
 
 		 166 aa  65.1  0.0000000004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1206  inhibitor of MCP methylation, CheC-like  27.61 
 
 		 152 aa  62.8  0.000000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.333742  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0404  hypothetical protein  32.26 
 
 		 168 aa  62  0.000000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.639025  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0811  chemotaxis protein CheX, putative  28.76 
 
 		 167 aa  62  0.000000003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0151  CheC domain-containing protein  29.45 
 
 		 156 aa  58.9  0.00000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.176363  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0634  CheC domain protein  25.81 
 
 		 160 aa  57.8  0.00000005  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1829  hypothetical protein  30.65 
 
 		 168 aa  57.4  0.00000007  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.666718  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0966  inhibitor of MCP methylation CheC-like protein  25.19 
 
 		 166 aa  56.2  0.0000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0387  CheC-like family protein  32.37 
 
 		 149 aa  56.6  0.0000001  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.535958 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0035  CheC domain protein  30 
 
 		 158 aa  54.3  0.0000005  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2134  CheC domain protein  27.66 
 
 		 158 aa  53.9  0.0000007  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1493  chemotaxis protein CheX  26.85 
 
 		 154 aa  53.5  0.0000009  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3060  hypothetical protein  29.57 
 
 		 166 aa  53.1  0.000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00029683  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0650  inhibitor of MCP methylation, CheC-like protein  26.62 
 
 		 158 aa  52.8  0.000002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.207901 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0826  CheC domain-containing protein  28.06 
 
 		 155 aa  52  0.000003  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2279  CheC domain protein  30.34 
 
 		 154 aa  51.6  0.000004  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0352491  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3310  hypothetical protein  26.47 
 
 		 172 aa  49.7  0.00001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1446  CheX protein (uncharacterized ORF in chemotaxis operon)  31.75 
 
 		 152 aa  50.1  0.00001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.238883  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0567  hypothetical protein  28.7 
 
 		 157 aa  49.3  0.00002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00522543  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0132  hypothetical protein  26.19 
 
 		 168 aa  48.1  0.00005  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1932  CheC domain protein  24.83 
 
 		 157 aa  47.8  0.00005  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.0227289  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2135  putative chemotaxis protein CheX  24.68 
 
 		 164 aa  47.8  0.00005  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.234891  normal  0.802402 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0184  putative chemotaxis protein CheX  29.57 
 
 		 169 aa  47  0.00009  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000013186  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0126  CheC-like protein  26.43 
 
 		 154 aa  47  0.0001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.000893437  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3584  hypothetical protein  26.98 
 
 		 152 aa  46.2  0.0002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2308  CheC-like protein  26.67 
 
 		 154 aa  44.7  0.0004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0388  hypothetical protein  29.51 
 
 		 149 aa  44.3  0.0006  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.368051  normal  0.837689 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0436  hypothetical protein  33.71 
 
 		 176 aa  44.3  0.0006  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1769  inhibitor of MCP methylation-like protein  30.39 
 
 		 217 aa  42  0.003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0802325  hitchhiker  0.000530497 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0484  CheC domain-containing protein  24.46 
 
 		 155 aa  41.6  0.004  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0691  CheC-like family protein  26.06 
 
 		 161 aa  41.2  0.005  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  0.0452521  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0500  hypothetical protein  33.33 
 
 		 350 aa  40.4  0.008  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.260407  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2921  hypothetical protein  25.81 
 
 		 184 aa  40.4  0.009  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4092  hypothetical protein  30.12 
 
 		 171 aa  40  0.01  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0178506  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>