24 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Krad_0324 on replicon NC_009664
Organism: Kineococcus radiotolerans SRS30216



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009664  Krad_0324  hypothetical protein  100 
 
 		 167 aa  337  5.9999999999999996e-92  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.460798  normal  0.496823 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2318  hypothetical protein  36.42 
 
 		 161 aa  71.6  0.000000000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_5000  hypothetical protein  32.87 
 
 		 183 aa  66.2  0.0000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0567  hypothetical protein  29 
 
 		 157 aa  53.9  0.000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00522543  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_30880  hypothetical protein  33.03 
 
 		 157 aa  52  0.000004  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3060  hypothetical protein  29.91 
 
 		 166 aa  51.6  0.000005  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00029683  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1999  hypothetical protein  34.67 
 
 		 162 aa  51.2  0.000007  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1786  hypothetical protein  32.45 
 
 		 153 aa  50.1  0.00001  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.12078  normal  0.851363 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3596  hypothetical protein  32.48 
 
 		 150 aa  48.5  0.00004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1829  hypothetical protein  27.52 
 
 		 168 aa  47  0.0001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.666718  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3272  hypothetical protein  37.11 
 
 		 159 aa  46.6  0.0002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.265581  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1769  inhibitor of MCP methylation-like protein  31.3 
 
 		 217 aa  45.4  0.0004  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0802325  hitchhiker  0.000530497 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3283  inhibitor of MCP methylation CheC-like protein  34.72 
 
 		 166 aa  45.1  0.0005  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1692  hypothetical protein  32.61 
 
 		 152 aa  43.5  0.001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.797242 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4219  inhibitor of MCP methylation CheC-like protein  31.94 
 
 		 168 aa  43.5  0.002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3928  inhibitor of MCP methylation CheC-like protein  31.94 
 
 		 169 aa  42.7  0.002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.045223 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2584  hypothetical protein  38.57 
 
 		 141 aa  42.4  0.003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.836759  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3420  hypothetical protein  27.78 
 
 		 168 aa  42.4  0.003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3844  inhibitor of MCP methylation CheC-like protein  31.94 
 
 		 169 aa  42  0.004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2921  hypothetical protein  29.7 
 
 		 184 aa  42  0.004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0966  inhibitor of MCP methylation CheC-like protein  33.33 
 
 		 166 aa  41.6  0.005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1206  inhibitor of MCP methylation, CheC-like  29.03 
 
 		 152 aa  41.6  0.006  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.333742  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2488  hypothetical protein  38.57 
 
 		 141 aa  41.2  0.007  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  decreased coverage  0.00975112  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1530  hypothetical protein  27.54 
 
 		 172 aa  40.4  0.01  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>