31 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Acel_1786 on replicon NC_008578
Organism: Acidothermus cellulolyticus 11B



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008578  Acel_1786  hypothetical protein  100 
 
 
153 aa  305  2.0000000000000002e-82  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.12078  normal  0.851363 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2318  hypothetical protein  37.33 
 
 
161 aa  92.8  2e-18  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1530  hypothetical protein  33.55 
 
 
172 aa  77.4  0.00000000000006  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_5000  hypothetical protein  37.78 
 
 
183 aa  73.2  0.000000000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_30880  hypothetical protein  36 
 
 
157 aa  71.6  0.000000000004  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1999  hypothetical protein  40.7 
 
 
162 aa  60.5  0.000000009  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0324  hypothetical protein  32.45 
 
 
167 aa  57.8  0.00000005  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.460798  normal  0.496823 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3596  hypothetical protein  38 
 
 
150 aa  55.8  0.0000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1206  inhibitor of MCP methylation, CheC-like  31.19 
 
 
152 aa  51.6  0.000003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.333742  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3283  inhibitor of MCP methylation CheC-like protein  36.14 
 
 
166 aa  50.1  0.00001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0811  chemotaxis protein CheX, putative  38.04 
 
 
167 aa  49.7  0.00002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2921  hypothetical protein  34.86 
 
 
184 aa  49.3  0.00002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0966  inhibitor of MCP methylation CheC-like protein  36.14 
 
 
166 aa  49.3  0.00002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2875  CheC domain protein  41.03 
 
 
171 aa  48.1  0.00005  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0567  hypothetical protein  35 
 
 
157 aa  47  0.0001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00522543  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3420  hypothetical protein  35 
 
 
168 aa  45.4  0.0003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3928  inhibitor of MCP methylation CheC-like protein  36.25 
 
 
169 aa  45.1  0.0003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.045223 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3060  hypothetical protein  36.14 
 
 
166 aa  45.1  0.0004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00029683  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4219  inhibitor of MCP methylation CheC-like protein  36.25 
 
 
168 aa  45.1  0.0004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3310  hypothetical protein  35.37 
 
 
172 aa  44.3  0.0005  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3844  inhibitor of MCP methylation CheC-like protein  33.6 
 
 
169 aa  44.7  0.0005  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1829  hypothetical protein  32.14 
 
 
168 aa  44.3  0.0007  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.666718  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4092  hypothetical protein  38.1 
 
 
171 aa  43.9  0.0009  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0178506  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0132  hypothetical protein  29.27 
 
 
168 aa  43.5  0.001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2009  inhibitor of MCP methylation-like protein  30.91 
 
 
165 aa  42.7  0.002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.458725  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2059  hypothetical protein  34.55 
 
 
159 aa  42.4  0.002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0404  hypothetical protein  37.5 
 
 
168 aa  42  0.003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.639025  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3372  inhibitor of MCP methylation-like protein  30 
 
 
166 aa  41.6  0.004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3118  hypothetical protein  37.5 
 
 
168 aa  41.6  0.004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0436  hypothetical protein  34.12 
 
 
176 aa  40.4  0.009  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0184  putative chemotaxis protein CheX  30.86 
 
 
169 aa  40.4  0.01  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000013186  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>