25 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GSU2059 on replicon NC_002939
Organism: Geobacter sulfurreducens PCA



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002939  GSU2059  hypothetical protein  100 
 
 		 159 aa  323  6e-88  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0888  inhibitor of MCP methylation-like protein  69.18 
 
 		 166 aa  231  4.0000000000000004e-60  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0522691  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3372  inhibitor of MCP methylation-like protein  69.18 
 
 		 166 aa  231  5e-60  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1904  inhibitor of MCP methylation-like protein  67.92 
 
 		 163 aa  228  2e-59  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00098373  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2009  inhibitor of MCP methylation-like protein  65.41 
 
 		 165 aa  228  2e-59  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.458725  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1206  inhibitor of MCP methylation, CheC-like  26.45 
 
 		 152 aa  56.2  0.0000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.333742  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2921  hypothetical protein  40.74 
 
 		 184 aa  53.1  0.000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0717  chemotaxis protein CheX, putative  27.92 
 
 		 152 aa  50.8  0.000007  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.908176  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2135  putative chemotaxis protein CheX  27.35 
 
 		 164 aa  49.3  0.00002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.234891  normal  0.802402 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1829  hypothetical protein  26.61 
 
 		 168 aa  48.5  0.00003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.666718  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0650  inhibitor of MCP methylation, CheC-like protein  28.57 
 
 		 158 aa  46.6  0.0001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.207901 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3420  hypothetical protein  27.81 
 
 		 168 aa  45.8  0.0002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0567  hypothetical protein  32.47 
 
 		 157 aa  46.2  0.0002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00522543  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0248  CheC-like protein  25.16 
 
 		 154 aa  45.1  0.0004  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0557914  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3283  inhibitor of MCP methylation CheC-like protein  22.22 
 
 		 166 aa  45.1  0.0004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3133  chemotaxis protein CheX, putative  27.92 
 
 		 152 aa  43.5  0.001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4219  inhibitor of MCP methylation CheC-like protein  27.12 
 
 		 168 aa  42.7  0.002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0184  putative chemotaxis protein CheX  33.33 
 
 		 169 aa  41.6  0.004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000013186  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00638  CheC-like protein  27.74 
 
 		 154 aa  40.8  0.007  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.00187096  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1768  inhibitor of MCP methylation-like protein  22.32 
 
 		 159 aa  40.8  0.008  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0985649  hitchhiker  0.00193959 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3844  inhibitor of MCP methylation CheC-like protein  24.67 
 
 		 169 aa  40.8  0.008  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3928  inhibitor of MCP methylation CheC-like protein  24.67 
 
 		 169 aa  40.8  0.008  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.045223 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0132  hypothetical protein  36.26 
 
 		 168 aa  40.8  0.008  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0760  putative chemotaxis protein CheX  27.78 
 
 		 154 aa  40.4  0.009  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00000652399  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3275  CheC domain-containing protein  26.96 
 
 		 154 aa  40.4  0.01  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000378704 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>