67 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GSU0132 on replicon NC_002939
Organism: Geobacter sulfurreducens PCA



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002939  GSU0132  hypothetical protein  100 
 
 		 168 aa  334  3.9999999999999995e-91  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0184  putative chemotaxis protein CheX  72.62 
 
 		 169 aa  231  3e-60  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000013186  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3420  hypothetical protein  44.87 
 
 		 168 aa  145  2.0000000000000003e-34  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4219  inhibitor of MCP methylation CheC-like protein  42.86 
 
 		 168 aa  145  2.0000000000000003e-34  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3118  hypothetical protein  42.26 
 
 		 168 aa  145  2.0000000000000003e-34  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3844  inhibitor of MCP methylation CheC-like protein  42.26 
 
 		 169 aa  141  3e-33  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3310  hypothetical protein  43.67 
 
 		 172 aa  140  9.999999999999999e-33  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3928  inhibitor of MCP methylation CheC-like protein  41.67 
 
 		 169 aa  139  9.999999999999999e-33  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.045223 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0404  hypothetical protein  40.51 
 
 		 168 aa  136  2e-31  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.639025  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3283  inhibitor of MCP methylation CheC-like protein  42.5 
 
 		 166 aa  132  3e-30  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0966  inhibitor of MCP methylation CheC-like protein  41.88 
 
 		 166 aa  127  5.0000000000000004e-29  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1206  inhibitor of MCP methylation, CheC-like  36.84 
 
 		 152 aa  109  2.0000000000000002e-23  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.333742  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1829  hypothetical protein  33.55 
 
 		 168 aa  109  2.0000000000000002e-23  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.666718  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3060  hypothetical protein  35.53 
 
 		 166 aa  98.6  3e-20  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00029683  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0650  inhibitor of MCP methylation, CheC-like protein  37.34 
 
 		 158 aa  98.2  5e-20  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.207901 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0567  hypothetical protein  36.73 
 
 		 157 aa  94  9e-19  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00522543  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0436  hypothetical protein  36.22 
 
 		 176 aa  75.9  0.0000000000003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0248  CheC-like protein  29.45 
 
 		 154 aa  70.1  0.00000000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0557914  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4092  hypothetical protein  29.8 
 
 		 171 aa  68.9  0.00000000003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0178506  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3133  chemotaxis protein CheX, putative  28.47 
 
 		 152 aa  66.6  0.0000000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0281  chemotaxis protein CheX, putative  28.08 
 
 		 155 aa  65.1  0.0000000005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.180055  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1196  chemotaxis protein CheX, putative  28.21 
 
 		 160 aa  63.5  0.000000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.5213  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0717  chemotaxis protein CheX, putative  26.9 
 
 		 152 aa  63.5  0.000000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.908176  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2875  CheC domain protein  26.35 
 
 		 171 aa  58.5  0.00000005  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2921  hypothetical protein  31.86 
 
 		 184 aa  57  0.0000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00638  CheC-like protein  28.1 
 
 		 154 aa  56.6  0.0000002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.00187096  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002342  chemotaxis protein CheX  26.06 
 
 		 153 aa  56.2  0.0000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00011  chemotaxis protein CheX  26.06 
 
 		 153 aa  56.2  0.0000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1769  inhibitor of MCP methylation-like protein  28 
 
 		 217 aa  56.6  0.0000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0802325  hitchhiker  0.000530497 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2787  hypothetical protein  26.76 
 
 		 153 aa  56.2  0.0000002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.834766  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0739  CheC domain protein  25.9 
 
 		 154 aa  54.7  0.0000005  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000054191  hitchhiker  0.000000000759122 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1604  CheC, inhibitor of MCP methylation  31.25 
 
 		 464 aa  55.1  0.0000005  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0719  putative chemotaxis protein CheX  25.9 
 
 		 154 aa  54.7  0.0000005  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.00000000137536  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3636  putative chemotaxis protein CheX  25.9 
 
 		 154 aa  54.7  0.0000005  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0000517443  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1817  chemotaxis protein CheX, putative  26.62 
 
 		 154 aa  54.7  0.0000006  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0748  CheC domain-containing protein  25.9 
 
 		 154 aa  54.7  0.0000007  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.000188683  hitchhiker  0.000145879 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0409  cheC-like family protein  25.52 
 
 		 154 aa  54.3  0.0000008  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3246  putative chemotaxis protein CheX  25.18 
 
 		 154 aa  53.9  0.000001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00000130186  hitchhiker  0.00000986039 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0715  putative chemotaxis protein CheX  25.18 
 
 		 154 aa  53.9  0.000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00000857864  hitchhiker  0.000181388 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0696  putative chemotaxis protein CheX  25.18 
 
 		 154 aa  53.9  0.000001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.0000403522  hitchhiker  0.000308121 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0760  putative chemotaxis protein CheX  25.18 
 
 		 154 aa  52.8  0.000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00000652399  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0386  putative chemotaxis protein  24.82 
 
 		 164 aa  52.8  0.000002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.352728  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3344  CheC domain-containing protein  28.99 
 
 		 155 aa  53.1  0.000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3275  CheC domain-containing protein  25.9 
 
 		 154 aa  52.4  0.000003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000378704 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0484  CheC domain-containing protein  26.9 
 
 		 155 aa  52.4  0.000003  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3915  hypothetical protein  24.46 
 
 		 154 aa  52.4  0.000003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2679  chemotaxis protein CheX, putative  27.12 
 
 		 155 aa  52  0.000004  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.513529 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0523  CheC-like protein  26.95 
 
 		 155 aa  51.2  0.000007  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000195961  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3596  hypothetical protein  26.92 
 
 		 150 aa  51.2  0.000007  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3056  putative chemotaxis protein CheX  25.18 
 
 		 154 aa  50.8  0.000009  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.23032  normal  0.617715 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0765  putative chemotaxis protein CheX  26.62 
 
 		 154 aa  50.1  0.00002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000000000539649 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1530  hypothetical protein  30.43 
 
 		 172 aa  50.1  0.00002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2134  CheC domain protein  29.46 
 
 		 158 aa  48.9  0.00003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1986  chemotaxis protein CheX, putative  25.71 
 
 		 158 aa  48.5  0.00004  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1904  inhibitor of MCP methylation-like protein  30.43 
 
 		 163 aa  47.8  0.00008  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00098373  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2135  putative chemotaxis protein CheX  25.87 
 
 		 164 aa  47.8  0.00008  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.234891  normal  0.802402 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4204  CheC domain-containing protein  25.9 
 
 		 204 aa  46.2  0.0002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.994344  hitchhiker  0.00000174212 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3584  hypothetical protein  29.58 
 
 		 152 aa  46.6  0.0002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1092  putative chemotaxis protein CheX  28.3 
 
 		 159 aa  44.7  0.0006  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.391751 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0151  CheC domain-containing protein  26.24 
 
 		 156 aa  43.5  0.001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.176363  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1768  inhibitor of MCP methylation-like protein  25.62 
 
 		 159 aa  42.7  0.003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0985649  hitchhiker  0.00193959 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0888  inhibitor of MCP methylation-like protein  31.15 
 
 		 166 aa  42  0.004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0522691  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2009  inhibitor of MCP methylation-like protein  34.48 
 
 		 165 aa  42  0.004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.458725  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3372  inhibitor of MCP methylation-like protein  31.15 
 
 		 166 aa  41.6  0.005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0811  chemotaxis protein CheX, putative  24.14 
 
 		 167 aa  41.2  0.006  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2059  hypothetical protein  36.26 
 
 		 159 aa  41.2  0.006  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2308  CheC-like protein  23.24 
 
 		 154 aa  40.8  0.01  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>