68 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sama_3056 on replicon NC_008700
Organism: Shewanella amazonensis SB2B



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008700  Sama_3056  putative chemotaxis protein CheX  100 
 
 		 154 aa  315  1e-85  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.23032  normal  0.617715 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0715  putative chemotaxis protein CheX  86.36 
 
 		 154 aa  279  1e-74  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00000857864  hitchhiker  0.000181388 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0696  putative chemotaxis protein CheX  86.36 
 
 		 154 aa  279  1e-74  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.0000403522  hitchhiker  0.000308121 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0765  putative chemotaxis protein CheX  85.62 
 
 		 154 aa  278  2e-74  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000000000539649 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0748  CheC domain-containing protein  86.36 
 
 		 154 aa  278  2e-74  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.000188683  hitchhiker  0.000145879 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0719  putative chemotaxis protein CheX  85.71 
 
 		 154 aa  277  3e-74  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.00000000137536  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0739  CheC domain protein  85.71 
 
 		 154 aa  277  3e-74  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000054191  hitchhiker  0.000000000759122 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3636  putative chemotaxis protein CheX  85.71 
 
 		 154 aa  277  3e-74  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0000517443  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3246  putative chemotaxis protein CheX  85.06 
 
 		 154 aa  275  1e-73  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00000130186  hitchhiker  0.00000986039 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0760  putative chemotaxis protein CheX  85.06 
 
 		 154 aa  275  2e-73  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00000652399  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3915  hypothetical protein  84.42 
 
 		 154 aa  275  2e-73  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4204  CheC domain-containing protein  79.87 
 
 		 204 aa  261  2e-69  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.994344  hitchhiker  0.00000174212 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3275  CheC domain-containing protein  77.12 
 
 		 154 aa  252  2.0000000000000002e-66  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000378704 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0523  CheC-like protein  75.82 
 
 		 155 aa  246  1e-64  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000195961  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3344  CheC domain-containing protein  74.68 
 
 		 155 aa  242  1.9999999999999999e-63  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0386  putative chemotaxis protein  70.13 
 
 		 164 aa  239  1e-62  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.352728  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00011  chemotaxis protein CheX  69.93 
 
 		 153 aa  238  2e-62  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002342  chemotaxis protein CheX  69.93 
 
 		 153 aa  238  2e-62  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2787  hypothetical protein  69.28 
 
 		 153 aa  237  2.9999999999999997e-62  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.834766  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0248  CheC-like protein  62.75 
 
 		 154 aa  206  6e-53  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0557914  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0409  cheC-like family protein  62.75 
 
 		 154 aa  202  1e-51  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00638  CheC-like protein  59.74 
 
 		 154 aa  202  1e-51  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.00187096  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1196  chemotaxis protein CheX, putative  44.37 
 
 		 160 aa  138  3e-32  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.5213  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2679  chemotaxis protein CheX, putative  42.38 
 
 		 155 aa  129  1.0000000000000001e-29  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.513529 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0281  chemotaxis protein CheX, putative  41.72 
 
 		 155 aa  129  2.0000000000000002e-29  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.180055  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1817  chemotaxis protein CheX, putative  41.72 
 
 		 154 aa  128  3e-29  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3133  chemotaxis protein CheX, putative  37.91 
 
 		 152 aa  121  3e-27  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1986  chemotaxis protein CheX, putative  40.27 
 
 		 158 aa  111  3e-24  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0717  chemotaxis protein CheX, putative  34.64 
 
 		 152 aa  107  4.0000000000000004e-23  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.908176  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3928  inhibitor of MCP methylation CheC-like protein  35.71 
 
 		 169 aa  78.6  0.00000000000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.045223 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2875  CheC domain protein  31.01 
 
 		 171 aa  78.6  0.00000000000003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3844  inhibitor of MCP methylation CheC-like protein  34.92 
 
 		 169 aa  77  0.00000000000009  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4219  inhibitor of MCP methylation CheC-like protein  33.33 
 
 		 168 aa  74.7  0.0000000000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3420  hypothetical protein  32.26 
 
 		 168 aa  72.8  0.000000000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1206  inhibitor of MCP methylation, CheC-like  27.14 
 
 		 152 aa  71.2  0.000000000004  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.333742  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3118  hypothetical protein  32.28 
 
 		 168 aa  70.5  0.000000000008  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1493  chemotaxis protein CheX  26.62 
 
 		 154 aa  67.4  0.00000000008  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3283  inhibitor of MCP methylation CheC-like protein  29.84 
 
 		 166 aa  66.6  0.0000000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0404  hypothetical protein  32.8 
 
 		 168 aa  67  0.0000000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.639025  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0966  inhibitor of MCP methylation CheC-like protein  29.84 
 
 		 166 aa  64.7  0.0000000004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2134  CheC domain protein  31.25 
 
 		 158 aa  61.2  0.000000005  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0826  CheC domain-containing protein  28.26 
 
 		 155 aa  61.2  0.000000005  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1829  hypothetical protein  32.8 
 
 		 168 aa  60.8  0.000000006  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.666718  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0634  CheC domain protein  25 
 
 		 160 aa  58.2  0.00000004  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3310  hypothetical protein  28.91 
 
 		 172 aa  57.4  0.00000007  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0567  hypothetical protein  31.19 
 
 		 157 aa  57  0.00000009  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00522543  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0126  CheC-like protein  29.69 
 
 		 154 aa  56.6  0.0000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.000893437  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0811  chemotaxis protein CheX, putative  27.33 
 
 		 167 aa  55.8  0.0000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0650  inhibitor of MCP methylation, CheC-like protein  24.82 
 
 		 158 aa  55.5  0.0000003  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.207901 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3060  hypothetical protein  37.5 
 
 		 166 aa  54.7  0.0000004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00029683  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2135  putative chemotaxis protein CheX  24.53 
 
 		 164 aa  54.7  0.0000005  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.234891  normal  0.802402 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2279  CheC domain protein  27.13 
 
 		 154 aa  53.1  0.000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0352491  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1768  inhibitor of MCP methylation-like protein  23.57 
 
 		 159 aa  52.4  0.000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0985649  hitchhiker  0.00193959 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0151  CheC domain-containing protein  25.41 
 
 		 156 aa  52  0.000003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.176363  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1446  CheX protein (uncharacterized ORF in chemotaxis operon)  25.95 
 
 		 152 aa  51.2  0.000005  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.238883  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0691  CheC-like family protein  26.67 
 
 		 161 aa  50.4  0.000008  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  0.0452521  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2308  CheC-like protein  22.88 
 
 		 154 aa  50.1  0.00001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0035  CheC domain protein  27.11 
 
 		 158 aa  49.3  0.00002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1530  type IV pilus assembly PilZ  24.35 
 
 		 300 aa  47.8  0.00005  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.174773  normal  0.910266 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4092  hypothetical protein  31.25 
 
 		 171 aa  47.8  0.00005  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0178506  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2921  hypothetical protein  24.78 
 
 		 184 aa  47.4  0.00007  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0387  CheC-like family protein  26.53 
 
 		 149 aa  47.4  0.00007  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.535958 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0184  putative chemotaxis protein CheX  31 
 
 		 169 aa  45.4  0.0003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000013186  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0436  hypothetical protein  29.52 
 
 		 176 aa  45.1  0.0003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0132  hypothetical protein  25.18 
 
 		 168 aa  44.3  0.0006  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1769  inhibitor of MCP methylation-like protein  24.68 
 
 		 217 aa  41.6  0.004  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0802325  hitchhiker  0.000530497 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1768  CheC-like protein  18.83 
 
 		 165 aa  40.8  0.007  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1904  inhibitor of MCP methylation-like protein  24.58 
 
 		 163 aa  40.4  0.009  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00098373  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>