35 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmc1_3584 on replicon NC_008576
Organism: Magnetococcus sp. MC-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008576  Mmc1_3584  hypothetical protein  100 
 
 		 152 aa  305  1.0000000000000001e-82  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2135  putative chemotaxis protein CheX  30.33 
 
 		 164 aa  56.2  0.0000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.234891  normal  0.802402 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0248  CheC-like protein  29.75 
 
 		 154 aa  52.4  0.000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0557914  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4219  inhibitor of MCP methylation CheC-like protein  28.57 
 
 		 168 aa  52  0.000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1769  inhibitor of MCP methylation-like protein  28.39 
 
 		 217 aa  48.1  0.00004  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0802325  hitchhiker  0.000530497 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3283  inhibitor of MCP methylation CheC-like protein  28.03 
 
 		 166 aa  48.1  0.00004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0650  inhibitor of MCP methylation, CheC-like protein  26.62 
 
 		 158 aa  47.8  0.00005  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.207901 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0523  CheC-like protein  27.41 
 
 		 155 aa  47.4  0.00007  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000195961  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1829  hypothetical protein  28.03 
 
 		 168 aa  47.4  0.00008  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.666718  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0404  hypothetical protein  28.06 
 
 		 168 aa  46.2  0.0002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.639025  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00638  CheC-like protein  25.18 
 
 		 154 aa  45.8  0.0002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.00187096  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3928  inhibitor of MCP methylation CheC-like protein  28.86 
 
 		 169 aa  45.8  0.0002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.045223 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0409  cheC-like family protein  26.98 
 
 		 154 aa  46.2  0.0002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3844  inhibitor of MCP methylation CheC-like protein  31.25 
 
 		 169 aa  45.4  0.0003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0966  inhibitor of MCP methylation CheC-like protein  27.27 
 
 		 166 aa  45.4  0.0003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0132  hypothetical protein  30.77 
 
 		 168 aa  45.4  0.0003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3344  CheC domain-containing protein  24.5 
 
 		 155 aa  45.1  0.0004  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1092  putative chemotaxis protein CheX  30.77 
 
 		 159 aa  44.3  0.0005  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.391751 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3420  hypothetical protein  31.31 
 
 		 168 aa  43.9  0.0009  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3118  hypothetical protein  28.67 
 
 		 168 aa  43.5  0.001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3275  CheC domain-containing protein  25 
 
 		 154 aa  43.5  0.001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000378704 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2787  hypothetical protein  27.78 
 
 		 153 aa  43.1  0.001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.834766  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00011  chemotaxis protein CheX  27.78 
 
 		 153 aa  42.4  0.002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002342  chemotaxis protein CheX  27.78 
 
 		 153 aa  42.4  0.002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3915  hypothetical protein  25.19 
 
 		 154 aa  42  0.003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2921  hypothetical protein  26.59 
 
 		 184 aa  41.6  0.004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1530  hypothetical protein  32.14 
 
 		 172 aa  41.6  0.004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3246  putative chemotaxis protein CheX  24.44 
 
 		 154 aa  41.2  0.005  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00000130186  hitchhiker  0.00000986039 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0719  putative chemotaxis protein CheX  23.13 
 
 		 154 aa  41.2  0.006  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.00000000137536  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3636  putative chemotaxis protein CheX  23.13 
 
 		 154 aa  41.2  0.006  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0000517443  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0715  putative chemotaxis protein CheX  24.44 
 
 		 154 aa  40.8  0.006  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00000857864  hitchhiker  0.000181388 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0696  putative chemotaxis protein CheX  24.44 
 
 		 154 aa  40.8  0.006  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.0000403522  hitchhiker  0.000308121 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0739  CheC domain protein  23.13 
 
 		 154 aa  41.2  0.006  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000054191  hitchhiker  0.000000000759122 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0748  CheC domain-containing protein  23.13 
 
 		 154 aa  40.8  0.007  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.000188683  hitchhiker  0.000145879 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1196  chemotaxis protein CheX, putative  28.46 
 
 		 160 aa  40.4  0.009  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.5213  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>