68 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmc1_2135 on replicon NC_008576
Organism: Magnetococcus sp. MC-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008576  Mmc1_2135  putative chemotaxis protein CheX  100 
 
 		 164 aa  335  1.9999999999999998e-91  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.234891  normal  0.802402 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1530  type IV pilus assembly PilZ  51.28 
 
 		 300 aa  174  4e-43  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.174773  normal  0.910266 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1092  putative chemotaxis protein CheX  38.85 
 
 		 159 aa  118  3.9999999999999996e-26  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.391751 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1769  inhibitor of MCP methylation-like protein  35.44 
 
 		 217 aa  95.9  2e-19  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0802325  hitchhiker  0.000530497 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1768  inhibitor of MCP methylation-like protein  29.75 
 
 		 159 aa  72.4  0.000000000003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0985649  hitchhiker  0.00193959 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3420  hypothetical protein  25.49 
 
 		 168 aa  72  0.000000000004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3310  hypothetical protein  27.95 
 
 		 172 aa  70.1  0.00000000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1206  inhibitor of MCP methylation, CheC-like  26.75 
 
 		 152 aa  68.6  0.00000000004  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.333742  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0567  hypothetical protein  28 
 
 		 157 aa  62.8  0.000000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00522543  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0966  inhibitor of MCP methylation CheC-like protein  28.46 
 
 		 166 aa  62.4  0.000000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1829  hypothetical protein  24.68 
 
 		 168 aa  62  0.000000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.666718  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3283  inhibitor of MCP methylation CheC-like protein  28.46 
 
 		 166 aa  60.5  0.00000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0248  CheC-like protein  24.05 
 
 		 154 aa  60.1  0.00000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0557914  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0484  CheC domain-containing protein  31.93 
 
 		 155 aa  58.2  0.00000005  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0719  putative chemotaxis protein CheX  24.53 
 
 		 154 aa  56.6  0.0000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.00000000137536  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3636  putative chemotaxis protein CheX  24.53 
 
 		 154 aa  56.6  0.0000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0000517443  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0748  CheC domain-containing protein  24.53 
 
 		 154 aa  56.6  0.0000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.000188683  hitchhiker  0.000145879 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4204  CheC domain-containing protein  23.6 
 
 		 204 aa  56.6  0.0000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.994344  hitchhiker  0.00000174212 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0739  CheC domain protein  24.53 
 
 		 154 aa  56.6  0.0000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000054191  hitchhiker  0.000000000759122 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3344  CheC domain-containing protein  23.9 
 
 		 155 aa  55.8  0.0000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3584  hypothetical protein  30.33 
 
 		 152 aa  56.2  0.0000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1196  chemotaxis protein CheX, putative  26.8 
 
 		 160 aa  55.8  0.0000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.5213  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0404  hypothetical protein  23.84 
 
 		 168 aa  56.6  0.0000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.639025  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0760  putative chemotaxis protein CheX  24.68 
 
 		 154 aa  55.5  0.0000003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00000652399  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0650  inhibitor of MCP methylation, CheC-like protein  27.03 
 
 		 158 aa  55.8  0.0000003  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.207901 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3915  hypothetical protein  25.32 
 
 		 154 aa  55.5  0.0000003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0715  putative chemotaxis protein CheX  24.53 
 
 		 154 aa  55.1  0.0000004  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00000857864  hitchhiker  0.000181388 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0696  putative chemotaxis protein CheX  24.53 
 
 		 154 aa  55.1  0.0000004  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.0000403522  hitchhiker  0.000308121 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3275  CheC domain-containing protein  24.05 
 
 		 154 aa  55.1  0.0000004  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000378704 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0281  chemotaxis protein CheX, putative  28 
 
 		 155 aa  55.1  0.0000004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.180055  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3056  putative chemotaxis protein CheX  24.53 
 
 		 154 aa  54.7  0.0000005  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.23032  normal  0.617715 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3118  hypothetical protein  25.69 
 
 		 168 aa  54.7  0.0000006  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002342  chemotaxis protein CheX  25.32 
 
 		 153 aa  54.3  0.0000007  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0717  chemotaxis protein CheX, putative  24.68 
 
 		 152 aa  54.3  0.0000007  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.908176  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00011  chemotaxis protein CheX  25.32 
 
 		 153 aa  54.3  0.0000007  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0386  putative chemotaxis protein  25.16 
 
 		 164 aa  54.3  0.0000008  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.352728  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2875  CheC domain protein  23.27 
 
 		 171 aa  53.9  0.0000009  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3246  putative chemotaxis protein CheX  24.53 
 
 		 154 aa  53.9  0.000001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00000130186  hitchhiker  0.00000986039 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4219  inhibitor of MCP methylation CheC-like protein  23.53 
 
 		 168 aa  53.1  0.000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2921  hypothetical protein  30.17 
 
 		 184 aa  52.8  0.000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0765  putative chemotaxis protein CheX  24.05 
 
 		 154 aa  52.8  0.000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000000000539649 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3133  chemotaxis protein CheX, putative  24.34 
 
 		 152 aa  52.4  0.000003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2787  hypothetical protein  24.68 
 
 		 153 aa  52.4  0.000003  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.834766  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2009  inhibitor of MCP methylation-like protein  25.78 
 
 		 165 aa  51.6  0.000005  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.458725  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3060  hypothetical protein  22.29 
 
 		 166 aa  51.6  0.000005  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00029683  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0523  CheC-like protein  22.78 
 
 		 155 aa  50.4  0.000009  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000195961  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3844  inhibitor of MCP methylation CheC-like protein  23.93 
 
 		 169 aa  50.4  0.00001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2679  chemotaxis protein CheX, putative  26.4 
 
 		 155 aa  50.4  0.00001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.513529 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3928  inhibitor of MCP methylation CheC-like protein  23.93 
 
 		 169 aa  50.4  0.00001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.045223 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1817  chemotaxis protein CheX, putative  27.42 
 
 		 154 aa  49.7  0.00002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00638  CheC-like protein  22.64 
 
 		 154 aa  48.9  0.00003  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.00187096  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2059  hypothetical protein  27.35 
 
 		 159 aa  49.3  0.00003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0409  cheC-like family protein  24.68 
 
 		 154 aa  47.8  0.00006  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0132  hypothetical protein  26.98 
 
 		 168 aa  47.8  0.00007  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1447  chemotaxis operon protein  28 
 
 		 158 aa  46.2  0.0002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.34666  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1904  inhibitor of MCP methylation-like protein  24.39 
 
 		 163 aa  46.6  0.0002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00098373  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0826  CheC domain-containing protein  29.13 
 
 		 155 aa  46.6  0.0002  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1173  CheC domain-containing protein  25.93 
 
 		 155 aa  45.4  0.0003  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.362697  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2134  CheC domain protein  22.68 
 
 		 158 aa  45.1  0.0004  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1832  CheC domain-containing protein  34.74 
 
 		 137 aa  45.1  0.0004  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  hitchhiker  0.00000797818  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1282  CheC domain-containing protein  25.93 
 
 		 155 aa  44.7  0.0005  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.233529  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0151  CheC domain-containing protein  30.21 
 
 		 156 aa  44.7  0.0005  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.176363  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0184  putative chemotaxis protein CheX  24.44 
 
 		 169 aa  44.7  0.0006  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000013186  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0811  chemotaxis protein CheX, putative  25.17 
 
 		 167 aa  43.1  0.002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1530  hypothetical protein  28.57 
 
 		 172 aa  42  0.004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0888  inhibitor of MCP methylation-like protein  23.58 
 
 		 166 aa  40.8  0.008  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0522691  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3372  inhibitor of MCP methylation-like protein  23.58 
 
 		 166 aa  40.8  0.008  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1446  CheX protein (uncharacterized ORF in chemotaxis operon)  27.2 
 
 		 152 aa  40.8  0.008  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.238883  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>