39 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Glov_1904 on replicon NC_010814
Organism: Geobacter lovleyi SZ



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010814  Glov_1904  inhibitor of MCP methylation-like protein  100 
 
 		 163 aa  336  8e-92  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00098373  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2009  inhibitor of MCP methylation-like protein  70.91 
 
 		 165 aa  257  4e-68  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.458725  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0888  inhibitor of MCP methylation-like protein  62.05 
 
 		 166 aa  233  8e-61  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0522691  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3372  inhibitor of MCP methylation-like protein  60.84 
 
 		 166 aa  230  5e-60  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2059  hypothetical protein  67.92 
 
 		 159 aa  223  6e-58  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1206  inhibitor of MCP methylation, CheC-like  27.86 
 
 		 152 aa  56.2  0.0000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.333742  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4219  inhibitor of MCP methylation CheC-like protein  30.28 
 
 		 168 aa  53.9  0.0000009  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2921  hypothetical protein  36.67 
 
 		 184 aa  53.1  0.000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0717  chemotaxis protein CheX, putative  31.3 
 
 		 152 aa  53.5  0.000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.908176  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3928  inhibitor of MCP methylation CheC-like protein  28.37 
 
 		 169 aa  51.6  0.000005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.045223 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3133  chemotaxis protein CheX, putative  27.59 
 
 		 152 aa  51.2  0.000006  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3844  inhibitor of MCP methylation CheC-like protein  28.37 
 
 		 169 aa  51.2  0.000006  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0248  CheC-like protein  25.81 
 
 		 154 aa  49.7  0.00002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0557914  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0386  putative chemotaxis protein  28.1 
 
 		 164 aa  47.4  0.00008  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.352728  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0650  inhibitor of MCP methylation, CheC-like protein  26.79 
 
 		 158 aa  47.4  0.00009  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.207901 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0132  hypothetical protein  32.22 
 
 		 168 aa  47  0.0001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2135  putative chemotaxis protein CheX  24.39 
 
 		 164 aa  46.6  0.0002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.234891  normal  0.802402 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3283  inhibitor of MCP methylation CheC-like protein  32.61 
 
 		 166 aa  46.2  0.0002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3420  hypothetical protein  28.19 
 
 		 168 aa  45.8  0.0002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3118  hypothetical protein  27.81 
 
 		 168 aa  46.2  0.0002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00638  CheC-like protein  27.94 
 
 		 154 aa  45.4  0.0003  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.00187096  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1768  inhibitor of MCP methylation-like protein  22.22 
 
 		 159 aa  45.4  0.0003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0985649  hitchhiker  0.00193959 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1829  hypothetical protein  35 
 
 		 168 aa  45.4  0.0003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.666718  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0567  hypothetical protein  31.71 
 
 		 157 aa  45.1  0.0004  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00522543  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0404  hypothetical protein  27.81 
 
 		 168 aa  45.1  0.0004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.639025  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0184  putative chemotaxis protein CheX  28.28 
 
 		 169 aa  45.1  0.0005  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000013186  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002342  chemotaxis protein CheX  26.45 
 
 		 153 aa  43.9  0.0009  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00011  chemotaxis protein CheX  26.45 
 
 		 153 aa  43.9  0.0009  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0966  inhibitor of MCP methylation CheC-like protein  31.25 
 
 		 166 aa  43.9  0.001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3275  CheC domain-containing protein  23.61 
 
 		 154 aa  43.9  0.001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000378704 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2318  hypothetical protein  29.21 
 
 		 161 aa  43.9  0.001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3310  hypothetical protein  26.32 
 
 		 172 aa  42.7  0.002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3344  CheC domain-containing protein  25.21 
 
 		 155 aa  42.7  0.002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1196  chemotaxis protein CheX, putative  28.83 
 
 		 160 aa  42.4  0.003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.5213  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0765  putative chemotaxis protein CheX  26.09 
 
 		 154 aa  41.6  0.004  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000000000539649 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4204  CheC domain-containing protein  27.73 
 
 		 204 aa  41.6  0.005  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.994344  hitchhiker  0.00000174212 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3915  hypothetical protein  24.82 
 
 		 154 aa  41.6  0.005  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0281  chemotaxis protein CheX, putative  26.4 
 
 		 155 aa  41.2  0.006  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.180055  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2787  hypothetical protein  26.45 
 
 		 153 aa  40.8  0.008  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.834766  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>