78 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbem_3844 on replicon NC_011146
Organism: Geobacter bemidjiensis Bem



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011146  Gbem_3844  inhibitor of MCP methylation CheC-like protein  100 
 
 		 169 aa  346  1e-94  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3928  inhibitor of MCP methylation CheC-like protein  98.22 
 
 		 169 aa  342  2e-93  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.045223 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4219  inhibitor of MCP methylation CheC-like protein  84.52 
 
 		 168 aa  301  4.0000000000000003e-81  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3118  hypothetical protein  77.25 
 
 		 168 aa  275  2e-73  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0404  hypothetical protein  74.85 
 
 		 168 aa  264  5e-70  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.639025  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3420  hypothetical protein  68.26 
 
 		 168 aa  246  2e-64  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3310  hypothetical protein  66.08 
 
 		 172 aa  232  2.0000000000000002e-60  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3283  inhibitor of MCP methylation CheC-like protein  53.61 
 
 		 166 aa  180  7e-45  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0966  inhibitor of MCP methylation CheC-like protein  52.41 
 
 		 166 aa  174  4e-43  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1829  hypothetical protein  44.64 
 
 		 168 aa  145  3e-34  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.666718  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0650  inhibitor of MCP methylation, CheC-like protein  43.59 
 
 		 158 aa  140  9.999999999999999e-33  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.207901 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0184  putative chemotaxis protein CheX  45.51 
 
 		 169 aa  139  1.9999999999999998e-32  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000013186  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0132  hypothetical protein  42.26 
 
 		 168 aa  135  3.0000000000000003e-31  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1206  inhibitor of MCP methylation, CheC-like  43.62 
 
 		 152 aa  133  9.999999999999999e-31  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.333742  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3060  hypothetical protein  46.76 
 
 		 166 aa  119  1.9999999999999998e-26  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00029683  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0567  hypothetical protein  34.06 
 
 		 157 aa  87  1e-16  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00522543  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0248  CheC-like protein  35.71 
 
 		 154 aa  85.1  4e-16  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0557914  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0386  putative chemotaxis protein  31.97 
 
 		 164 aa  84.7  5e-16  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.352728  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3133  chemotaxis protein CheX, putative  32.62 
 
 		 152 aa  82.4  0.000000000000003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0717  chemotaxis protein CheX, putative  32.87 
 
 		 152 aa  82.4  0.000000000000003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.908176  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1196  chemotaxis protein CheX, putative  30.99 
 
 		 160 aa  80.9  0.000000000000007  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.5213  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00011  chemotaxis protein CheX  30.61 
 
 		 153 aa  80.1  0.00000000000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002342  chemotaxis protein CheX  30.61 
 
 		 153 aa  80.1  0.00000000000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0739  CheC domain protein  35.71 
 
 		 154 aa  79  0.00000000000003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000054191  hitchhiker  0.000000000759122 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0719  putative chemotaxis protein CheX  35.71 
 
 		 154 aa  79  0.00000000000003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.00000000137536  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3636  putative chemotaxis protein CheX  35.71 
 
 		 154 aa  79  0.00000000000003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0000517443  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0748  CheC domain-containing protein  35.71 
 
 		 154 aa  78.6  0.00000000000003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.000188683  hitchhiker  0.000145879 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3344  CheC domain-containing protein  34.59 
 
 		 155 aa  78.6  0.00000000000004  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3915  hypothetical protein  33.83 
 
 		 154 aa  77.8  0.00000000000007  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3246  putative chemotaxis protein CheX  33.83 
 
 		 154 aa  77.4  0.00000000000008  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00000130186  hitchhiker  0.00000986039 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0760  putative chemotaxis protein CheX  34.59 
 
 		 154 aa  77  0.0000000000001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00000652399  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3056  putative chemotaxis protein CheX  34.92 
 
 		 154 aa  77  0.0000000000001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.23032  normal  0.617715 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2787  hypothetical protein  29.93 
 
 		 153 aa  77  0.0000000000001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.834766  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0696  putative chemotaxis protein CheX  34.13 
 
 		 154 aa  76.6  0.0000000000001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.0000403522  hitchhiker  0.000308121 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0715  putative chemotaxis protein CheX  34.13 
 
 		 154 aa  76.6  0.0000000000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00000857864  hitchhiker  0.000181388 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3275  CheC domain-containing protein  31.16 
 
 		 154 aa  75.5  0.0000000000003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000378704 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0281  chemotaxis protein CheX, putative  29.08 
 
 		 155 aa  74.3  0.0000000000008  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.180055  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00638  CheC-like protein  29.93 
 
 		 154 aa  72  0.000000000004  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.00187096  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2875  CheC domain protein  32.48 
 
 		 171 aa  71.6  0.000000000005  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0523  CheC-like protein  32.54 
 
 		 155 aa  71.6  0.000000000005  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000195961  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2679  chemotaxis protein CheX, putative  29.08 
 
 		 155 aa  70.9  0.000000000008  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.513529 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2921  hypothetical protein  33.99 
 
 		 184 aa  70.9  0.000000000008  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0765  putative chemotaxis protein CheX  33.87 
 
 		 154 aa  70.5  0.00000000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000000000539649 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1817  chemotaxis protein CheX, putative  26.95 
 
 		 154 aa  68.2  0.00000000005  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0409  cheC-like family protein  32.31 
 
 		 154 aa  68.6  0.00000000005  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4092  hypothetical protein  29.7 
 
 		 171 aa  66.2  0.0000000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0178506  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4204  CheC domain-containing protein  33.6 
 
 		 204 aa  66.6  0.0000000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.994344  hitchhiker  0.00000174212 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0436  hypothetical protein  27.5 
 
 		 176 aa  64.3  0.0000000008  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1986  chemotaxis protein CheX, putative  29.08 
 
 		 158 aa  63.2  0.000000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1092  putative chemotaxis protein CheX  35.44 
 
 		 159 aa  55.5  0.0000004  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.391751 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1769  inhibitor of MCP methylation-like protein  27.54 
 
 		 217 aa  52.8  0.000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0802325  hitchhiker  0.000530497 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1904  inhibitor of MCP methylation-like protein  28.37 
 
 		 163 aa  51.2  0.000006  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00098373  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0151  CheC domain-containing protein  29.69 
 
 		 156 aa  50.4  0.00001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.176363  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0484  CheC domain-containing protein  26.8 
 
 		 155 aa  50.4  0.00001  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2135  putative chemotaxis protein CheX  23.93 
 
 		 164 aa  50.4  0.00001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.234891  normal  0.802402 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1530  hypothetical protein  28.7 
 
 		 172 aa  49.7  0.00002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1530  type IV pilus assembly PilZ  25.48 
 
 		 300 aa  50.1  0.00002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.174773  normal  0.910266 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0634  CheC domain protein  25.23 
 
 		 160 aa  48.5  0.00005  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2134  CheC domain protein  26.96 
 
 		 158 aa  48.1  0.00006  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0811  chemotaxis protein CheX, putative  25.56 
 
 		 167 aa  47.4  0.0001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0888  inhibitor of MCP methylation-like protein  25.68 
 
 		 166 aa  47  0.0001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0522691  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1173  CheC domain-containing protein  30.39 
 
 		 155 aa  47.4  0.0001  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.362697  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0826  CheC domain-containing protein  26.45 
 
 		 155 aa  47.4  0.0001  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3596  hypothetical protein  29.63 
 
 		 150 aa  46.6  0.0002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2009  inhibitor of MCP methylation-like protein  28.17 
 
 		 165 aa  46.2  0.0002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.458725  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1768  inhibitor of MCP methylation-like protein  22.63 
 
 		 159 aa  46.2  0.0002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0985649  hitchhiker  0.00193959 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1282  CheC domain-containing protein  32.61 
 
 		 155 aa  46.6  0.0002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.233529  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3584  hypothetical protein  31.25 
 
 		 152 aa  45.4  0.0004  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2318  hypothetical protein  37.66 
 
 		 161 aa  45.1  0.0005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1832  CheC domain-containing protein  28.06 
 
 		 137 aa  44.3  0.0008  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  hitchhiker  0.00000797818  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3372  inhibitor of MCP methylation-like protein  28.57 
 
 		 166 aa  43.5  0.001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1999  hypothetical protein  33.62 
 
 		 162 aa  43.9  0.001  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2308  CheC-like protein  24.07 
 
 		 154 aa  43.9  0.001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1493  chemotaxis protein CheX  26.32 
 
 		 154 aa  43.5  0.001  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2279  CheC domain protein  29.29 
 
 		 154 aa  43.1  0.002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0352491  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1786  hypothetical protein  33.6 
 
 		 153 aa  42.7  0.003  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.12078  normal  0.851363 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0324  hypothetical protein  31.94 
 
 		 167 aa  42  0.004  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.460798  normal  0.496823 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1604  CheC, inhibitor of MCP methylation  23.85 
 
 		 464 aa  40.8  0.009  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>