73 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SO_3915 on replicon NC_004347
Organism: Shewanella oneidensis MR-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_004347  SO_3915  hypothetical protein  100 
 
 		 154 aa  309  7.999999999999999e-84  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0696  putative chemotaxis protein CheX  96.1 
 
 		 154 aa  301  2.0000000000000002e-81  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.0000403522  hitchhiker  0.000308121 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0715  putative chemotaxis protein CheX  95.45 
 
 		 154 aa  300  6.000000000000001e-81  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00000857864  hitchhiker  0.000181388 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0760  putative chemotaxis protein CheX  94.81 
 
 		 154 aa  296  7e-80  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00000652399  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3246  putative chemotaxis protein CheX  94.16 
 
 		 154 aa  296  8e-80  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00000130186  hitchhiker  0.00000986039 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0719  putative chemotaxis protein CheX  93.51 
 
 		 154 aa  295  1e-79  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.00000000137536  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0739  CheC domain protein  93.51 
 
 		 154 aa  295  1e-79  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000054191  hitchhiker  0.000000000759122 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3636  putative chemotaxis protein CheX  93.51 
 
 		 154 aa  295  1e-79  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0000517443  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0748  CheC domain-containing protein  92.86 
 
 		 154 aa  295  2e-79  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.000188683  hitchhiker  0.000145879 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3056  putative chemotaxis protein CheX  84.42 
 
 		 154 aa  275  2e-73  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.23032  normal  0.617715 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0765  putative chemotaxis protein CheX  85.06 
 
 		 154 aa  274  4e-73  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000000000539649 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4204  CheC domain-containing protein  82.47 
 
 		 204 aa  264  4e-70  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.994344  hitchhiker  0.00000174212 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3275  CheC domain-containing protein  77.12 
 
 		 154 aa  251  3e-66  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000378704 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3344  CheC domain-containing protein  74.68 
 
 		 155 aa  243  6.999999999999999e-64  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0523  CheC-like protein  73.86 
 
 		 155 aa  241  1.9999999999999999e-63  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000195961  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002342  chemotaxis protein CheX  69.28 
 
 		 153 aa  235  1e-61  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00011  chemotaxis protein CheX  69.28 
 
 		 153 aa  235  1e-61  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0386  putative chemotaxis protein  68.83 
 
 		 164 aa  235  2e-61  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.352728  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2787  hypothetical protein  67.32 
 
 		 153 aa  231  3e-60  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.834766  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0248  CheC-like protein  62.75 
 
 		 154 aa  206  1e-52  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0557914  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00638  CheC-like protein  58.82 
 
 		 154 aa  201  2e-51  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.00187096  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0409  cheC-like family protein  62.09 
 
 		 154 aa  199  9.999999999999999e-51  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1196  chemotaxis protein CheX, putative  44.37 
 
 		 160 aa  140  5e-33  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.5213  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1817  chemotaxis protein CheX, putative  42.18 
 
 		 154 aa  129  2.0000000000000002e-29  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3133  chemotaxis protein CheX, putative  39.22 
 
 		 152 aa  129  2.0000000000000002e-29  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0281  chemotaxis protein CheX, putative  39.74 
 
 		 155 aa  129  2.0000000000000002e-29  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.180055  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2679  chemotaxis protein CheX, putative  41.67 
 
 		 155 aa  129  2.0000000000000002e-29  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.513529 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0717  chemotaxis protein CheX, putative  35.29 
 
 		 152 aa  113  1.0000000000000001e-24  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.908176  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1986  chemotaxis protein CheX, putative  38.93 
 
 		 158 aa  109  1.0000000000000001e-23  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2875  CheC domain protein  31.21 
 
 		 171 aa  80.1  0.000000000000009  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3844  inhibitor of MCP methylation CheC-like protein  33.83 
 
 		 169 aa  77.8  0.00000000000005  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3928  inhibitor of MCP methylation CheC-like protein  33.83 
 
 		 169 aa  77.4  0.00000000000007  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.045223 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4219  inhibitor of MCP methylation CheC-like protein  33.08 
 
 		 168 aa  76.3  0.0000000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3420  hypothetical protein  29.84 
 
 		 168 aa  72.4  0.000000000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3118  hypothetical protein  33.06 
 
 		 168 aa  72  0.000000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3283  inhibitor of MCP methylation CheC-like protein  29.84 
 
 		 166 aa  68.6  0.00000000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0966  inhibitor of MCP methylation CheC-like protein  29.84 
 
 		 166 aa  67.8  0.00000000005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0404  hypothetical protein  34.69 
 
 		 168 aa  65.5  0.0000000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.639025  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1206  inhibitor of MCP methylation, CheC-like  26.81 
 
 		 152 aa  64.7  0.0000000004  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.333742  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2134  CheC domain protein  31.25 
 
 		 158 aa  62.4  0.000000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0634  CheC domain protein  26.39 
 
 		 160 aa  62.8  0.000000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0826  CheC domain-containing protein  29.13 
 
 		 155 aa  60.1  0.00000001  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1829  hypothetical protein  33.67 
 
 		 168 aa  58.5  0.00000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.666718  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1493  chemotaxis protein CheX  24.03 
 
 		 154 aa  57.8  0.00000006  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0567  hypothetical protein  30.28 
 
 		 157 aa  57.4  0.00000007  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00522543  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0811  chemotaxis protein CheX, putative  26 
 
 		 167 aa  57.4  0.00000007  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3310  hypothetical protein  25.74 
 
 		 172 aa  57  0.00000009  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0650  inhibitor of MCP methylation, CheC-like protein  25.83 
 
 		 158 aa  55.8  0.0000002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.207901 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0151  CheC domain-containing protein  25.62 
 
 		 156 aa  55.1  0.0000003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.176363  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2135  putative chemotaxis protein CheX  25.32 
 
 		 164 aa  55.5  0.0000003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.234891  normal  0.802402 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3060  hypothetical protein  28.46 
 
 		 166 aa  54.7  0.0000004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00029683  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0126  CheC-like protein  26.56 
 
 		 154 aa  52  0.000003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.000893437  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0035  CheC domain protein  27.67 
 
 		 158 aa  50.4  0.000008  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0387  CheC-like family protein  28.57 
 
 		 149 aa  50.4  0.000008  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.535958 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4092  hypothetical protein  33.33 
 
 		 171 aa  48.5  0.00003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0178506  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1768  inhibitor of MCP methylation-like protein  22.86 
 
 		 159 aa  48.5  0.00003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0985649  hitchhiker  0.00193959 
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0691  CheC-like family protein  26.03 
 
 		 161 aa  48.1  0.00004  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  0.0452521  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2308  CheC-like protein  24.59 
 
 		 154 aa  48.1  0.00004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1446  CheX protein (uncharacterized ORF in chemotaxis operon)  24.68 
 
 		 152 aa  47.8  0.00006  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.238883  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0184  putative chemotaxis protein CheX  30 
 
 		 169 aa  47.4  0.00007  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000013186  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2279  CheC domain protein  25.87 
 
 		 154 aa  47.4  0.00008  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0352491  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0132  hypothetical protein  24.46 
 
 		 168 aa  45.4  0.0003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0436  hypothetical protein  26.67 
 
 		 176 aa  44.3  0.0006  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2009  inhibitor of MCP methylation-like protein  26.17 
 
 		 165 aa  42.7  0.002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.458725  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1769  inhibitor of MCP methylation-like protein  24.03 
 
 		 217 aa  42  0.003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0802325  hitchhiker  0.000530497 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3584  hypothetical protein  25.19 
 
 		 152 aa  42  0.003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1530  type IV pilus assembly PilZ  23.76 
 
 		 300 aa  41.6  0.004  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.174773  normal  0.910266 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1904  inhibitor of MCP methylation-like protein  24.82 
 
 		 163 aa  41.6  0.004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00098373  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1173  CheC domain-containing protein  24.82 
 
 		 155 aa  40.8  0.006  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.362697  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1282  CheC domain-containing protein  24.82 
 
 		 155 aa  40.8  0.006  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.233529  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2031  anhydro-N-acetylmuramic acid kinase  32.1 
 
 		 375 aa  40.4  0.009  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1447  chemotaxis operon protein  24.03 
 
 		 158 aa  40.4  0.01  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.34666  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0484  CheC domain-containing protein  22.3 
 
 		 155 aa  40.4  0.01  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>