64 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swol_1446 on replicon NC_008346
Organism: Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008346  Swol_1446  CheX protein (uncharacterized ORF in chemotaxis operon)  100 
 
 		 152 aa  306  6.999999999999999e-83  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.238883  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2134  CheC domain protein  42.28 
 
 		 158 aa  94  7e-19  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1493  chemotaxis protein CheX  31.58 
 
 		 154 aa  92  2e-18  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0126  CheC-like protein  32.89 
 
 		 154 aa  89.4  2e-17  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.000893437  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1173  CheC domain-containing protein  33.77 
 
 		 155 aa  85.5  3e-16  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.362697  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1282  CheC domain-containing protein  34.42 
 
 		 155 aa  84.7  4e-16  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.233529  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2279  CheC domain protein  36.64 
 
 		 154 aa  82.8  0.000000000000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0352491  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2232  CheC domain protein  31.47 
 
 		 158 aa  79.7  0.00000000000001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0634  CheC domain protein  32.24 
 
 		 160 aa  76.3  0.0000000000001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0826  CheC domain-containing protein  36.22 
 
 		 155 aa  75.9  0.0000000000002  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0151  CheC domain-containing protein  35.9 
 
 		 156 aa  72.8  0.000000000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.176363  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0484  CheC domain-containing protein  31.37 
 
 		 155 aa  73.2  0.000000000001  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1176  CheC-like protein  35.25 
 
 		 148 aa  71.2  0.000000000004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1476  CheX protein (uncharacterized ORF in chemotaxis operon)  46.24 
 
 		 94 aa  70.9  0.000000000007  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2308  CheC-like protein  28.29 
 
 		 154 aa  66.2  0.0000000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1832  CheC domain-containing protein  38.89 
 
 		 137 aa  66.2  0.0000000001  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  hitchhiker  0.00000797818  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0691  CheC-like family protein  32.3 
 
 		 161 aa  63.9  0.0000000006  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  0.0452521  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0035  CheC domain protein  27.39 
 
 		 158 aa  63.5  0.0000000009  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00638  CheC-like protein  27.92 
 
 		 154 aa  62  0.000000003  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.00187096  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1768  CheC-like protein  32.77 
 
 		 165 aa  61.2  0.000000005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3275  CheC domain-containing protein  29.22 
 
 		 154 aa  61.2  0.000000005  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000378704 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1063  CheC domain protein  27.63 
 
 		 155 aa  60.8  0.000000007  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2875  CheC domain protein  30.57 
 
 		 171 aa  57.4  0.00000007  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2263  CheC domain protein  34.12 
 
 		 152 aa  57  0.00000009  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000000104148  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3133  chemotaxis protein CheX, putative  27.27 
 
 		 152 aa  55.8  0.0000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1196  chemotaxis protein CheX, putative  28.28 
 
 		 160 aa  55.8  0.0000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.5213  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3344  CheC domain-containing protein  29.84 
 
 		 155 aa  54.7  0.0000005  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002342  chemotaxis protein CheX  29.27 
 
 		 153 aa  52.4  0.000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00011  chemotaxis protein CheX  29.27 
 
 		 153 aa  52.4  0.000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3056  putative chemotaxis protein CheX  25.95 
 
 		 154 aa  51.2  0.000005  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.23032  normal  0.617715 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0248  CheC-like protein  25.48 
 
 		 154 aa  51.2  0.000005  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0557914  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1447  chemotaxis operon protein  25 
 
 		 158 aa  50.8  0.000006  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.34666  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0748  CheC domain-containing protein  25.97 
 
 		 154 aa  50.4  0.000008  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.000188683  hitchhiker  0.000145879 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3636  putative chemotaxis protein CheX  25.97 
 
 		 154 aa  50.4  0.000009  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0000517443  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0719  putative chemotaxis protein CheX  25.97 
 
 		 154 aa  50.4  0.000009  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.00000000137536  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2787  hypothetical protein  27.64 
 
 		 153 aa  50.4  0.000009  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.834766  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0739  CheC domain protein  25.97 
 
 		 154 aa  50.4  0.000009  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000054191  hitchhiker  0.000000000759122 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0386  putative chemotaxis protein  27.64 
 
 		 164 aa  50.1  0.00001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.352728  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0409  cheC-like family protein  31.75 
 
 		 154 aa  50.1  0.00001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0523  CheC-like protein  24.84 
 
 		 155 aa  49.7  0.00001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000195961  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0760  putative chemotaxis protein CheX  25.32 
 
 		 154 aa  49.3  0.00002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00000652399  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1206  inhibitor of MCP methylation, CheC-like  35.24 
 
 		 152 aa  49.7  0.00002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.333742  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2679  chemotaxis protein CheX, putative  25 
 
 		 155 aa  49.7  0.00002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.513529 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0650  inhibitor of MCP methylation, CheC-like protein  31.58 
 
 		 158 aa  49.3  0.00002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.207901 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1666  CheC, inhibitor of MCP methylation  32.05 
 
 		 205 aa  48.9  0.00003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0231538  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0765  putative chemotaxis protein CheX  25.95 
 
 		 154 aa  48.5  0.00003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000000000539649 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0281  chemotaxis protein CheX, putative  23.68 
 
 		 155 aa  48.5  0.00003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.180055  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1829  hypothetical protein  28.89 
 
 		 168 aa  48.9  0.00003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.666718  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3246  putative chemotaxis protein CheX  27.64 
 
 		 154 aa  47.8  0.00005  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00000130186  hitchhiker  0.00000986039 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3915  hypothetical protein  24.68 
 
 		 154 aa  47.8  0.00006  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0715  putative chemotaxis protein CheX  27.64 
 
 		 154 aa  47.8  0.00006  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00000857864  hitchhiker  0.000181388 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1932  CheC domain protein  30.86 
 
 		 157 aa  45.8  0.0002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.0227289  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0696  putative chemotaxis protein CheX  26.83 
 
 		 154 aa  46.2  0.0002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.0000403522  hitchhiker  0.000308121 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1768  inhibitor of MCP methylation-like protein  34.18 
 
 		 159 aa  46.2  0.0002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0985649  hitchhiker  0.00193959 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1531  CheC, inhibitor of MCP methylation  36.14 
 
 		 357 aa  45.8  0.0002  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.226498  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0717  chemotaxis protein CheX, putative  25.68 
 
 		 152 aa  44.3  0.0005  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.908176  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1817  chemotaxis protein CheX, putative  22.93 
 
 		 154 aa  44.3  0.0006  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4204  CheC domain-containing protein  24.68 
 
 		 204 aa  44.3  0.0006  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.994344  hitchhiker  0.00000174212 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3283  inhibitor of MCP methylation CheC-like protein  29.75 
 
 		 166 aa  43.9  0.0007  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0308  hypothetical protein  30.33 
 
 		 162 aa  42  0.003  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  unclonable  0.0000000030204  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1769  inhibitor of MCP methylation-like protein  29.21 
 
 		 217 aa  41.6  0.004  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0802325  hitchhiker  0.000530497 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2406  hypothetical protein  22.05 
 
 		 170 aa  41.6  0.004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2135  putative chemotaxis protein CheX  27.2 
 
 		 164 aa  40.8  0.006  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.234891  normal  0.802402 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0966  inhibitor of MCP methylation CheC-like protein  28.95 
 
 		 166 aa  40  0.01  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>