29 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swol_1447 on replicon NC_008346
Organism: Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008346  Swol_1447  chemotaxis operon protein  100 
 
 
158 aa  317  3e-86  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.34666  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1493  chemotaxis protein CheX  29.68 
 
 
154 aa  79.7  0.00000000000001  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1768  CheC-like protein  28.22 
 
 
165 aa  72  0.000000000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2406  hypothetical protein  29.11 
 
 
170 aa  71.6  0.000000000004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0691  CheC-like family protein  30.43 
 
 
161 aa  67.4  0.00000000007  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  0.0452521  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2134  CheC domain protein  29.61 
 
 
158 aa  67.4  0.00000000008  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0634  CheC domain protein  26.42 
 
 
160 aa  65.5  0.0000000003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0126  CheC-like protein  25.32 
 
 
154 aa  62.4  0.000000003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.000893437  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0151  CheC domain-containing protein  26.11 
 
 
156 aa  61.6  0.000000004  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.176363  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2279  CheC domain protein  25 
 
 
154 aa  60.5  0.000000009  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0352491  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0826  CheC domain-containing protein  31.25 
 
 
155 aa  56.2  0.0000002  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1063  CheC domain protein  28.66 
 
 
155 aa  55.5  0.0000003  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3133  chemotaxis protein CheX, putative  27.42 
 
 
152 aa  54.3  0.0000007  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0035  CheC domain protein  25.79 
 
 
158 aa  53.5  0.000001  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1932  CheC domain protein  25.41 
 
 
157 aa  52.4  0.000003  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.0227289  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1446  CheX protein (uncharacterized ORF in chemotaxis operon)  25 
 
 
152 aa  50.8  0.000007  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.238883  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1173  CheC domain-containing protein  26.4 
 
 
155 aa  50.4  0.000008  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.362697  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1282  CheC domain-containing protein  27.68 
 
 
155 aa  50.1  0.00001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.233529  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2308  CheC-like protein  24.41 
 
 
154 aa  50.4  0.00001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0717  chemotaxis protein CheX, putative  28.21 
 
 
152 aa  50.1  0.00001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.908176  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0484  CheC domain-containing protein  35 
 
 
155 aa  47  0.0001  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2135  putative chemotaxis protein CheX  28 
 
 
164 aa  46.2  0.0002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.234891  normal  0.802402 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2263  CheC domain protein  24.8 
 
 
152 aa  45.4  0.0003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000000104148  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4092  hypothetical protein  28.57 
 
 
171 aa  45.1  0.0004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0178506  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2232  CheC domain protein  20.78 
 
 
158 aa  45.1  0.0004  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2233  hypothetical protein  23.85 
 
 
157 aa  43.9  0.0008  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1196  chemotaxis protein CheX, putative  25.4 
 
 
160 aa  43.5  0.001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.5213  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1768  inhibitor of MCP methylation-like protein  26.28 
 
 
159 aa  42.4  0.002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0985649  hitchhiker  0.00193959 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0913  response regulator receiver protein  27.45 
 
 
301 aa  40.8  0.008  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.348072  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>