80 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dde_1196 on replicon NC_007519
Organism: Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007519  Dde_1196  chemotaxis protein CheX, putative  100 
 
 		 160 aa  327  6e-89  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.5213  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1817  chemotaxis protein CheX, putative  51.61 
 
 		 154 aa  159  2e-38  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2679  chemotaxis protein CheX, putative  50.34 
 
 		 155 aa  158  3e-38  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.513529 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0281  chemotaxis protein CheX, putative  46.41 
 
 		 155 aa  154  4e-37  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.180055  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3636  putative chemotaxis protein CheX  45.03 
 
 		 154 aa  143  9e-34  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0000517443  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0719  putative chemotaxis protein CheX  45.03 
 
 		 154 aa  143  9e-34  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.00000000137536  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0739  CheC domain protein  45.03 
 
 		 154 aa  143  9e-34  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000054191  hitchhiker  0.000000000759122 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0748  CheC domain-containing protein  45.03 
 
 		 154 aa  143  1e-33  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.000188683  hitchhiker  0.000145879 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0715  putative chemotaxis protein CheX  45.03 
 
 		 154 aa  143  1e-33  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00000857864  hitchhiker  0.000181388 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3246  putative chemotaxis protein CheX  45.03 
 
 		 154 aa  142  2e-33  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00000130186  hitchhiker  0.00000986039 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0696  putative chemotaxis protein CheX  44.37 
 
 		 154 aa  141  3e-33  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.0000403522  hitchhiker  0.000308121 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3915  hypothetical protein  44.37 
 
 		 154 aa  140  6e-33  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0760  putative chemotaxis protein CheX  44.37 
 
 		 154 aa  140  7e-33  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00000652399  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3133  chemotaxis protein CheX, putative  43.33 
 
 		 152 aa  140  9e-33  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0523  CheC-like protein  43.05 
 
 		 155 aa  139  9.999999999999999e-33  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000195961  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0248  CheC-like protein  45.7 
 
 		 154 aa  139  1.9999999999999998e-32  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0557914  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0765  putative chemotaxis protein CheX  45.7 
 
 		 154 aa  138  1.9999999999999998e-32  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000000000539649 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3056  putative chemotaxis protein CheX  44.37 
 
 		 154 aa  138  3e-32  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.23032  normal  0.617715 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4204  CheC domain-containing protein  44.97 
 
 		 204 aa  134  7.000000000000001e-31  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.994344  hitchhiker  0.00000174212 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3275  CheC domain-containing protein  43.05 
 
 		 154 aa  132  9.999999999999999e-31  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000378704 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3344  CheC domain-containing protein  43.71 
 
 		 155 aa  132  3e-30  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2787  hypothetical protein  41.89 
 
 		 153 aa  130  6e-30  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.834766  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0386  putative chemotaxis protein  41.22 
 
 		 164 aa  130  1.0000000000000001e-29  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.352728  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0409  cheC-like family protein  41.06 
 
 		 154 aa  129  2.0000000000000002e-29  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1986  chemotaxis protein CheX, putative  48.3 
 
 		 158 aa  128  3e-29  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002342  chemotaxis protein CheX  41.22 
 
 		 153 aa  127  5.0000000000000004e-29  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00011  chemotaxis protein CheX  41.22 
 
 		 153 aa  127  5.0000000000000004e-29  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0717  chemotaxis protein CheX, putative  37.93 
 
 		 152 aa  121  5e-27  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.908176  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00638  CheC-like protein  41.43 
 
 		 154 aa  117  6e-26  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.00187096  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3420  hypothetical protein  31.69 
 
 		 168 aa  84.3  6e-16  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4219  inhibitor of MCP methylation CheC-like protein  31.69 
 
 		 168 aa  81.3  0.000000000000005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0404  hypothetical protein  30.99 
 
 		 168 aa  81.3  0.000000000000005  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.639025  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3928  inhibitor of MCP methylation CheC-like protein  31.65 
 
 		 169 aa  81.3  0.000000000000005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.045223 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0811  chemotaxis protein CheX, putative  32.67 
 
 		 167 aa  81.3  0.000000000000005  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3844  inhibitor of MCP methylation CheC-like protein  30.99 
 
 		 169 aa  80.9  0.000000000000006  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3118  hypothetical protein  30.28 
 
 		 168 aa  79.3  0.00000000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3283  inhibitor of MCP methylation CheC-like protein  29.2 
 
 		 166 aa  79.7  0.00000000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2875  CheC domain protein  30.77 
 
 		 171 aa  79  0.00000000000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0650  inhibitor of MCP methylation, CheC-like protein  29.11 
 
 		 158 aa  78.2  0.00000000000004  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.207901 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0966  inhibitor of MCP methylation CheC-like protein  29.2 
 
 		 166 aa  76.3  0.0000000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1206  inhibitor of MCP methylation, CheC-like  27.74 
 
 		 152 aa  76.3  0.0000000000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.333742  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0634  CheC domain protein  31.82 
 
 		 160 aa  74.3  0.0000000000007  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1829  hypothetical protein  30 
 
 		 168 aa  70.9  0.000000000007  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.666718  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2134  CheC domain protein  33.33 
 
 		 158 aa  70.1  0.00000000001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1493  chemotaxis protein CheX  27.52 
 
 		 154 aa  69.3  0.00000000002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0151  CheC domain-containing protein  33.9 
 
 		 156 aa  67.8  0.00000000006  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.176363  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3310  hypothetical protein  30.88 
 
 		 172 aa  66.6  0.0000000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0184  putative chemotaxis protein CheX  28.57 
 
 		 169 aa  63.9  0.0000000009  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000013186  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0567  hypothetical protein  28.18 
 
 		 157 aa  63.2  0.000000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00522543  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2921  hypothetical protein  35.29 
 
 		 184 aa  61.6  0.000000004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0826  CheC domain-containing protein  30.4 
 
 		 155 aa  60.5  0.000000009  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3060  hypothetical protein  34.15 
 
 		 166 aa  60.5  0.00000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00029683  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0132  hypothetical protein  28.21 
 
 		 168 aa  59.7  0.00000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2279  CheC domain protein  28.26 
 
 		 154 aa  59.7  0.00000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0352491  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1768  inhibitor of MCP methylation-like protein  26.47 
 
 		 159 aa  56.6  0.0000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0985649  hitchhiker  0.00193959 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1446  CheX protein (uncharacterized ORF in chemotaxis operon)  28.28 
 
 		 152 aa  55.8  0.0000002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.238883  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0484  CheC domain-containing protein  29.17 
 
 		 155 aa  55.8  0.0000002  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2135  putative chemotaxis protein CheX  26.8 
 
 		 164 aa  55.8  0.0000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.234891  normal  0.802402 
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0691  CheC-like family protein  26 
 
 		 161 aa  54.3  0.0000007  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  0.0452521  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0126  CheC-like protein  26.81 
 
 		 154 aa  53.9  0.0000008  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.000893437  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1282  CheC domain-containing protein  27.87 
 
 		 155 aa  52.8  0.000002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.233529  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1173  CheC domain-containing protein  27.05 
 
 		 155 aa  52.4  0.000003  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.362697  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1092  putative chemotaxis protein CheX  29.73 
 
 		 159 aa  51.2  0.000006  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.391751 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1530  type IV pilus assembly PilZ  28.18 
 
 		 300 aa  51.2  0.000006  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.174773  normal  0.910266 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0035  CheC domain protein  26.58 
 
 		 158 aa  50.8  0.000008  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2308  CheC-like protein  23.94 
 
 		 154 aa  49.3  0.00002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1176  CheC-like protein  35.9 
 
 		 148 aa  48.9  0.00002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1932  CheC domain protein  20.13 
 
 		 157 aa  48.9  0.00003  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.0227289  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0387  CheC-like family protein  26.06 
 
 		 149 aa  48.1  0.00004  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.535958 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0436  hypothetical protein  32.99 
 
 		 176 aa  46.6  0.0002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1769  inhibitor of MCP methylation-like protein  23.58 
 
 		 217 aa  45.8  0.0002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0802325  hitchhiker  0.000530497 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1768  CheC-like protein  23.89 
 
 		 165 aa  44.7  0.0005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0388  hypothetical protein  26.39 
 
 		 149 aa  44.3  0.0007  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.368051  normal  0.837689 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1832  CheC domain-containing protein  31.58 
 
 		 137 aa  43.5  0.001  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  hitchhiker  0.00000797818  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1447  chemotaxis operon protein  25.4 
 
 		 158 aa  43.5  0.001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.34666  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3272  hypothetical protein  26.92 
 
 		 159 aa  43.1  0.002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.265581  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1904  inhibitor of MCP methylation-like protein  28.83 
 
 		 163 aa  42.4  0.002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00098373  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4092  hypothetical protein  26.36 
 
 		 171 aa  42.4  0.003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0178506  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1692  hypothetical protein  23.14 
 
 		 152 aa  41.2  0.006  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.797242 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1530  hypothetical protein  33.82 
 
 		 172 aa  40.8  0.008  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>