28 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Acid345_1530 on replicon NC_008009
Organism: Candidatus Koribacter versatilis Ellin345



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008009  Acid345_1530  hypothetical protein  100 
 
 
172 aa  351  4e-96  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2318  hypothetical protein  35.57 
 
 
161 aa  74.3  0.0000000000007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1786  hypothetical protein  33.55 
 
 
153 aa  70.5  0.00000000001  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.12078  normal  0.851363 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3420  hypothetical protein  27.68 
 
 
168 aa  52  0.000005  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1829  hypothetical protein  30 
 
 
168 aa  51.6  0.000005  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.666718  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_5000  hypothetical protein  32.71 
 
 
183 aa  50.4  0.00001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3928  inhibitor of MCP methylation CheC-like protein  28.7 
 
 
169 aa  50.4  0.00001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.045223 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_30880  hypothetical protein  28.12 
 
 
157 aa  49.7  0.00002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3844  inhibitor of MCP methylation CheC-like protein  28.7 
 
 
169 aa  49.7  0.00002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3060  hypothetical protein  28.86 
 
 
166 aa  50.1  0.00002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00029683  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1206  inhibitor of MCP methylation, CheC-like  26.23 
 
 
152 aa  48.9  0.00003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.333742  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0404  hypothetical protein  29.52 
 
 
168 aa  48.5  0.00004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.639025  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0132  hypothetical protein  30.43 
 
 
168 aa  47.8  0.00008  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3596  hypothetical protein  28.68 
 
 
150 aa  47  0.0001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4219  inhibitor of MCP methylation CheC-like protein  26.85 
 
 
168 aa  46.6  0.0002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0966  inhibitor of MCP methylation CheC-like protein  30.61 
 
 
166 aa  46.2  0.0002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3310  hypothetical protein  28.26 
 
 
172 aa  46.2  0.0002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3283  inhibitor of MCP methylation CheC-like protein  28.44 
 
 
166 aa  45.8  0.0003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3118  hypothetical protein  27.62 
 
 
168 aa  45.4  0.0004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1999  hypothetical protein  33.71 
 
 
162 aa  44.3  0.0008  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3344  CheC domain-containing protein  26.55 
 
 
155 aa  44.3  0.001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0567  hypothetical protein  34.72 
 
 
157 aa  42.4  0.003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00522543  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2135  putative chemotaxis protein CheX  28.57 
 
 
164 aa  42  0.004  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.234891  normal  0.802402 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3584  hypothetical protein  32.14 
 
 
152 aa  41.6  0.005  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0523  CheC-like protein  27.88 
 
 
155 aa  41.2  0.007  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000195961  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0184  putative chemotaxis protein CheX  30.77 
 
 
169 aa  40.8  0.009  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000013186  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1196  chemotaxis protein CheX, putative  33.82 
 
 
160 aa  40.8  0.009  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.5213  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2921  hypothetical protein  28.57 
 
 
184 aa  40.8  0.01  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>