83 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gura_4219 on replicon NC_009483
Organism: Geobacter uraniireducens Rf4



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009483  Gura_4219  inhibitor of MCP methylation CheC-like protein  100 
 
 		 168 aa  343  8.999999999999999e-94  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3928  inhibitor of MCP methylation CheC-like protein  85.12 
 
 		 169 aa  303  8.000000000000001e-82  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.045223 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3844  inhibitor of MCP methylation CheC-like protein  84.52 
 
 		 169 aa  301  4.0000000000000003e-81  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3118  hypothetical protein  77.25 
 
 		 168 aa  278  3e-74  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0404  hypothetical protein  74.25 
 
 		 168 aa  261  3e-69  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.639025  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3420  hypothetical protein  68.26 
 
 		 168 aa  245  2e-64  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3310  hypothetical protein  61.99 
 
 		 172 aa  224  5.0000000000000005e-58  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3283  inhibitor of MCP methylation CheC-like protein  54.82 
 
 		 166 aa  185  3e-46  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0966  inhibitor of MCP methylation CheC-like protein  53.61 
 
 		 166 aa  180  8.000000000000001e-45  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1829  hypothetical protein  44.44 
 
 		 168 aa  144  5e-34  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.666718  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0184  putative chemotaxis protein CheX  48.72 
 
 		 169 aa  142  2e-33  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000013186  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0132  hypothetical protein  42.86 
 
 		 168 aa  138  3e-32  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1206  inhibitor of MCP methylation, CheC-like  46.67 
 
 		 152 aa  137  7e-32  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.333742  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0650  inhibitor of MCP methylation, CheC-like protein  43.62 
 
 		 158 aa  134  9e-31  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.207901 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3060  hypothetical protein  44.05 
 
 		 166 aa  127  6e-29  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00029683  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0567  hypothetical protein  35.21 
 
 		 157 aa  91.3  5e-18  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00522543  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3133  chemotaxis protein CheX, putative  33.33 
 
 		 152 aa  87  1e-16  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0386  putative chemotaxis protein  34.65 
 
 		 164 aa  85.9  3e-16  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.352728  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0248  CheC-like protein  35.34 
 
 		 154 aa  84.3  7e-16  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0557914  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002342  chemotaxis protein CheX  33.86 
 
 		 153 aa  82  0.000000000000003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00011  chemotaxis protein CheX  33.86 
 
 		 153 aa  82  0.000000000000003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1196  chemotaxis protein CheX, putative  31.69 
 
 		 160 aa  81.3  0.000000000000006  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.5213  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2787  hypothetical protein  34.13 
 
 		 153 aa  79.3  0.00000000000002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.834766  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0717  chemotaxis protein CheX, putative  29.58 
 
 		 152 aa  79  0.00000000000003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.908176  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0719  putative chemotaxis protein CheX  34.4 
 
 		 154 aa  77.4  0.00000000000009  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.00000000137536  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0739  CheC domain protein  34.4 
 
 		 154 aa  77.4  0.00000000000009  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000054191  hitchhiker  0.000000000759122 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3636  putative chemotaxis protein CheX  34.4 
 
 		 154 aa  77.4  0.00000000000009  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0000517443  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0748  CheC domain-containing protein  34.4 
 
 		 154 aa  77  0.0000000000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.000188683  hitchhiker  0.000145879 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3344  CheC domain-containing protein  32.33 
 
 		 155 aa  76.6  0.0000000000001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0760  putative chemotaxis protein CheX  33.08 
 
 		 154 aa  76.6  0.0000000000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00000652399  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3915  hypothetical protein  33.08 
 
 		 154 aa  76.3  0.0000000000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0696  putative chemotaxis protein CheX  32.8 
 
 		 154 aa  75.5  0.0000000000004  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.0000403522  hitchhiker  0.000308121 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3275  CheC domain-containing protein  32.54 
 
 		 154 aa  75.1  0.0000000000004  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000378704 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3246  putative chemotaxis protein CheX  32.33 
 
 		 154 aa  75.1  0.0000000000004  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00000130186  hitchhiker  0.00000986039 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0715  putative chemotaxis protein CheX  32.8 
 
 		 154 aa  74.7  0.0000000000005  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00000857864  hitchhiker  0.000181388 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3056  putative chemotaxis protein CheX  33.33 
 
 		 154 aa  74.7  0.0000000000005  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.23032  normal  0.617715 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0281  chemotaxis protein CheX, putative  29.08 
 
 		 155 aa  73.6  0.000000000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.180055  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2679  chemotaxis protein CheX, putative  29.79 
 
 		 155 aa  73.2  0.000000000002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.513529 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2921  hypothetical protein  33.55 
 
 		 184 aa  71.2  0.000000000006  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0523  CheC-like protein  30.95 
 
 		 155 aa  70.9  0.000000000007  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000195961  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00638  CheC-like protein  29.41 
 
 		 154 aa  69.7  0.00000000002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.00187096  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2875  CheC domain protein  34.27 
 
 		 171 aa  69.7  0.00000000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0409  cheC-like family protein  31.5 
 
 		 154 aa  69.7  0.00000000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0436  hypothetical protein  28.75 
 
 		 176 aa  69.3  0.00000000003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1986  chemotaxis protein CheX, putative  31.21 
 
 		 158 aa  68.6  0.00000000004  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4092  hypothetical protein  30.49 
 
 		 171 aa  67.4  0.00000000008  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0178506  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0765  putative chemotaxis protein CheX  31.45 
 
 		 154 aa  67  0.0000000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000000000539649 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1817  chemotaxis protein CheX, putative  25 
 
 		 154 aa  65.9  0.0000000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4204  CheC domain-containing protein  32 
 
 		 204 aa  64.3  0.0000000007  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.994344  hitchhiker  0.00000174212 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1530  type IV pilus assembly PilZ  27.45 
 
 		 300 aa  56.2  0.0000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.174773  normal  0.910266 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1769  inhibitor of MCP methylation-like protein  28.47 
 
 		 217 aa  55.8  0.0000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0802325  hitchhiker  0.000530497 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1092  putative chemotaxis protein CheX  34.18 
 
 		 159 aa  53.5  0.000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.391751 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1904  inhibitor of MCP methylation-like protein  30.28 
 
 		 163 aa  53.9  0.000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00098373  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0151  CheC domain-containing protein  26.77 
 
 		 156 aa  53.1  0.000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.176363  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2135  putative chemotaxis protein CheX  23.53 
 
 		 164 aa  53.1  0.000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.234891  normal  0.802402 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3584  hypothetical protein  28.57 
 
 		 152 aa  52  0.000003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0484  CheC domain-containing protein  26.89 
 
 		 155 aa  51.2  0.000006  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3596  hypothetical protein  29.73 
 
 		 150 aa  51.6  0.000006  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2009  inhibitor of MCP methylation-like protein  29.53 
 
 		 165 aa  50.4  0.00001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.458725  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1768  inhibitor of MCP methylation-like protein  23.53 
 
 		 159 aa  49.7  0.00002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0985649  hitchhiker  0.00193959 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0888  inhibitor of MCP methylation-like protein  26.17 
 
 		 166 aa  49.3  0.00003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0522691  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0634  CheC domain protein  25 
 
 		 160 aa  48.9  0.00003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0826  CheC domain-containing protein  34.57 
 
 		 155 aa  48.5  0.00005  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2308  CheC-like protein  27.82 
 
 		 154 aa  47.8  0.00007  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0811  chemotaxis protein CheX, putative  26.32 
 
 		 167 aa  47  0.0001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2279  CheC domain protein  31.31 
 
 		 154 aa  46.6  0.0002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0352491  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3372  inhibitor of MCP methylation-like protein  25.33 
 
 		 166 aa  46.2  0.0002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1530  hypothetical protein  26.85 
 
 		 172 aa  46.6  0.0002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2318  hypothetical protein  33.04 
 
 		 161 aa  46.2  0.0002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2134  CheC domain protein  23.36 
 
 		 158 aa  45.4  0.0003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2263  CheC domain protein  27.78 
 
 		 152 aa  45.4  0.0004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000000104148  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1173  CheC domain-containing protein  29.7 
 
 		 155 aa  44.7  0.0005  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.362697  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1832  CheC domain-containing protein  29.66 
 
 		 137 aa  44.7  0.0007  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  hitchhiker  0.00000797818  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1282  CheC domain-containing protein  31.87 
 
 		 155 aa  43.9  0.001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.233529  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1493  chemotaxis protein CheX  27.93 
 
 		 154 aa  43.5  0.001  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2059  hypothetical protein  27.97 
 
 		 159 aa  42.7  0.002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0324  hypothetical protein  31.94 
 
 		 167 aa  43.5  0.002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.460798  normal  0.496823 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_5000  hypothetical protein  36.36 
 
 		 183 aa  42  0.004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1999  hypothetical protein  31.03 
 
 		 162 aa  41.6  0.005  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1786  hypothetical protein  36.25 
 
 		 153 aa  41.6  0.005  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.12078  normal  0.851363 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_30880  hypothetical protein  33.33 
 
 		 157 aa  41.6  0.006  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0388  hypothetical protein  26.61 
 
 		 149 aa  41.2  0.007  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.368051  normal  0.837689 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1604  CheC, inhibitor of MCP methylation  26.67 
 
 		 464 aa  40.8  0.009  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>