58 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Acid345_2921 on replicon NC_008009
Organism: Candidatus Koribacter versatilis Ellin345



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008009  Acid345_2921  hypothetical protein  100 
 
 
184 aa  378  1e-104  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0404  hypothetical protein  32.74 
 
 
168 aa  77  0.0000000000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.639025  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1829  hypothetical protein  33.04 
 
 
168 aa  75.9  0.0000000000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.666718  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3118  hypothetical protein  33.14 
 
 
168 aa  75.9  0.0000000000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3310  hypothetical protein  42.55 
 
 
172 aa  72.4  0.000000000003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3928  inhibitor of MCP methylation CheC-like protein  33.99 
 
 
169 aa  72.4  0.000000000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.045223 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4219  inhibitor of MCP methylation CheC-like protein  33.55 
 
 
168 aa  71.2  0.000000000007  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3844  inhibitor of MCP methylation CheC-like protein  33.99 
 
 
169 aa  70.9  0.00000000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3283  inhibitor of MCP methylation CheC-like protein  36.56 
 
 
166 aa  68.9  0.00000000004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3420  hypothetical protein  36.7 
 
 
168 aa  66.6  0.0000000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0966  inhibitor of MCP methylation CheC-like protein  35.48 
 
 
166 aa  65.9  0.0000000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0436  hypothetical protein  38.24 
 
 
176 aa  65.9  0.0000000003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3060  hypothetical protein  30.5 
 
 
166 aa  62.8  0.000000003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00029683  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1196  chemotaxis protein CheX, putative  35.29 
 
 
160 aa  61.6  0.000000006  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.5213  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1206  inhibitor of MCP methylation, CheC-like  28.29 
 
 
152 aa  58.5  0.00000005  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.333742  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4092  hypothetical protein  34.55 
 
 
171 aa  57.8  0.00000009  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0178506  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2009  inhibitor of MCP methylation-like protein  40.66 
 
 
165 aa  57.4  0.0000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.458725  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2875  CheC domain protein  29.27 
 
 
171 aa  56.2  0.0000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3372  inhibitor of MCP methylation-like protein  36.26 
 
 
166 aa  55.5  0.0000004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0132  hypothetical protein  33.33 
 
 
168 aa  55.1  0.0000005  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0650  inhibitor of MCP methylation, CheC-like protein  30.14 
 
 
158 aa  55.1  0.0000005  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.207901 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0888  inhibitor of MCP methylation-like protein  36.26 
 
 
166 aa  55.5  0.0000005  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0522691  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0567  hypothetical protein  31.86 
 
 
157 aa  54.7  0.0000008  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00522543  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3133  chemotaxis protein CheX, putative  36.67 
 
 
152 aa  53.9  0.000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2059  hypothetical protein  40.74 
 
 
159 aa  53.1  0.000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1904  inhibitor of MCP methylation-like protein  36.67 
 
 
163 aa  53.1  0.000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00098373  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0248  CheC-like protein  29.7 
 
 
154 aa  53.1  0.000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0557914  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2135  putative chemotaxis protein CheX  30.17 
 
 
164 aa  52.8  0.000003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.234891  normal  0.802402 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1282  CheC domain-containing protein  29.7 
 
 
155 aa  51.2  0.000007  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.233529  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0826  CheC domain-containing protein  25.9 
 
 
155 aa  51.2  0.000008  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1173  CheC domain-containing protein  31.82 
 
 
155 aa  50.4  0.00001  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.362697  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0184  putative chemotaxis protein CheX  33.33 
 
 
169 aa  50.4  0.00001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000013186  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2134  CheC domain protein  32.56 
 
 
158 aa  49.7  0.00002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1986  chemotaxis protein CheX, putative  27.59 
 
 
158 aa  49.7  0.00003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0717  chemotaxis protein CheX, putative  30.39 
 
 
152 aa  49.3  0.00003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.908176  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1768  inhibitor of MCP methylation-like protein  27.06 
 
 
159 aa  48.1  0.00006  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0985649  hitchhiker  0.00193959 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3056  putative chemotaxis protein CheX  24.78 
 
 
154 aa  47.4  0.0001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.23032  normal  0.617715 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0353  putative CheA signal transduction histidine kinases  31.62 
 
 
1023 aa  46.6  0.0002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0281  chemotaxis protein CheX, putative  27.37 
 
 
155 aa  45.1  0.0006  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.180055  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2679  chemotaxis protein CheX, putative  27.37 
 
 
155 aa  44.7  0.0007  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.513529 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1176  CheC-like protein  36.25 
 
 
148 aa  44.3  0.001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1092  putative chemotaxis protein CheX  28.16 
 
 
159 aa  43.9  0.001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.391751 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2318  hypothetical protein  34.62 
 
 
161 aa  43.9  0.001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0765  putative chemotaxis protein CheX  26.32 
 
 
154 aa  44.3  0.001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  unclonable  0.0000000000539649 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1769  inhibitor of MCP methylation-like protein  28.09 
 
 
217 aa  43.9  0.001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0802325  hitchhiker  0.000530497 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1493  chemotaxis protein CheX  32.32 
 
 
154 aa  43.5  0.002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1530  type IV pilus assembly PilZ  30.59 
 
 
300 aa  43.5  0.002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.174773  normal  0.910266 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0634  CheC domain protein  25.26 
 
 
160 aa  42.7  0.003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1786  hypothetical protein  43.75 
 
 
153 aa  42.7  0.003  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.12078  normal  0.851363 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1817  chemotaxis protein CheX, putative  26.32 
 
 
154 aa  42.4  0.004  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3275  CheC domain-containing protein  23.68 
 
 
154 aa  42  0.005  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000378704 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0324  hypothetical protein  29.7 
 
 
167 aa  42  0.005  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.460798  normal  0.496823 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3344  CheC domain-containing protein  25.66 
 
 
155 aa  41.6  0.006  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3584  hypothetical protein  26.59 
 
 
152 aa  41.6  0.006  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3596  hypothetical protein  36.11 
 
 
150 aa  41.2  0.007  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0387  CheC-like family protein  31.33 
 
 
149 aa  41.6  0.007  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.535958 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2279  CheC domain protein  29.41 
 
 
154 aa  41.2  0.008  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0352491  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00638  CheC-like protein  29.07 
 
 
154 aa  40.8  0.01  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.00187096  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>