38 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pcryo_0387 on replicon NC_007969
Organism: Psychrobacter cryohalolentis K5



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007969  Pcryo_0387  CheC-like family protein  100 
 
 		 149 aa  304  3e-82  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.535958 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0388  hypothetical protein  43.28 
 
 		 149 aa  120  4e-27  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.368051  normal  0.837689 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3272  hypothetical protein  31.62 
 
 		 159 aa  70.5  0.000000000008  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.265581  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1692  hypothetical protein  29.25 
 
 		 152 aa  64.7  0.0000000004  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.797242 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0409  cheC-like family protein  32.37 
 
 		 154 aa  56.6  0.0000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3275  CheC domain-containing protein  30.14 
 
 		 154 aa  56.6  0.0000001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000378704 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0765  putative chemotaxis protein CheX  28.19 
 
 		 154 aa  54.3  0.0000006  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000000000539649 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4204  CheC domain-containing protein  28.57 
 
 		 204 aa  53.1  0.000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.994344  hitchhiker  0.00000174212 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3636  putative chemotaxis protein CheX  27.21 
 
 		 154 aa  50.4  0.000007  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0000517443  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0739  CheC domain protein  27.21 
 
 		 154 aa  50.4  0.000007  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000054191  hitchhiker  0.000000000759122 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0719  putative chemotaxis protein CheX  27.21 
 
 		 154 aa  50.4  0.000007  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.00000000137536  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3915  hypothetical protein  28.57 
 
 		 154 aa  50.4  0.000007  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0248  CheC-like protein  26.24 
 
 		 154 aa  50.4  0.000008  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0557914  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0748  CheC domain-containing protein  27.21 
 
 		 154 aa  50.4  0.000009  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.000188683  hitchhiker  0.000145879 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0696  putative chemotaxis protein CheX  27.89 
 
 		 154 aa  50.1  0.00001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.0000403522  hitchhiker  0.000308121 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3344  CheC domain-containing protein  30.4 
 
 		 155 aa  49.7  0.00001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0715  putative chemotaxis protein CheX  27.89 
 
 		 154 aa  50.1  0.00001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00000857864  hitchhiker  0.000181388 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0281  chemotaxis protein CheX, putative  27.89 
 
 		 155 aa  49.7  0.00001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.180055  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1986  chemotaxis protein CheX, putative  29.66 
 
 		 158 aa  49.3  0.00002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0386  putative chemotaxis protein  25.16 
 
 		 164 aa  49.3  0.00002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.352728  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3283  inhibitor of MCP methylation CheC-like protein  27.73 
 
 		 166 aa  49.3  0.00002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0760  putative chemotaxis protein CheX  27.4 
 
 		 154 aa  49.3  0.00002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00000652399  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0523  CheC-like protein  26.53 
 
 		 155 aa  48.9  0.00002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000195961  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3246  putative chemotaxis protein CheX  27.89 
 
 		 154 aa  48.9  0.00003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00000130186  hitchhiker  0.00000986039 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1196  chemotaxis protein CheX, putative  26.06 
 
 		 160 aa  48.1  0.00004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.5213  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002342  chemotaxis protein CheX  27.56 
 
 		 153 aa  47.4  0.00007  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00638  CheC-like protein  27.08 
 
 		 154 aa  47.4  0.00007  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.00187096  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00011  chemotaxis protein CheX  27.56 
 
 		 153 aa  47.4  0.00007  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3056  putative chemotaxis protein CheX  26.53 
 
 		 154 aa  47.4  0.00007  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.23032  normal  0.617715 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3133  chemotaxis protein CheX, putative  25.85 
 
 		 152 aa  45.1  0.0003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1817  chemotaxis protein CheX, putative  28.81 
 
 		 154 aa  44.7  0.0004  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2787  hypothetical protein  25 
 
 		 153 aa  42.4  0.002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.834766  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2679  chemotaxis protein CheX, putative  27.46 
 
 		 155 aa  42.4  0.002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.513529 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1829  hypothetical protein  27.27 
 
 		 168 aa  42.4  0.002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.666718  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0966  inhibitor of MCP methylation CheC-like protein  25.66 
 
 		 166 aa  42  0.003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2921  hypothetical protein  31.33 
 
 		 184 aa  41.6  0.004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0404  hypothetical protein  26.32 
 
 		 168 aa  40.4  0.008  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.639025  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3060  hypothetical protein  27.17 
 
 		 166 aa  40  0.01  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00029683  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>