83 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shew_3275 on replicon NC_009092
Organism: Shewanella loihica PV-4



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009092  Shew_3275  CheC domain-containing protein  100 
 
 		 154 aa  309  1e-83  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000378704 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0715  putative chemotaxis protein CheX  79.08 
 
 		 154 aa  252  1.0000000000000001e-66  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00000857864  hitchhiker  0.000181388 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0760  putative chemotaxis protein CheX  78.43 
 
 		 154 aa  252  2.0000000000000002e-66  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00000652399  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3056  putative chemotaxis protein CheX  77.12 
 
 		 154 aa  252  2.0000000000000002e-66  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.23032  normal  0.617715 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0696  putative chemotaxis protein CheX  78.43 
 
 		 154 aa  251  3e-66  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.0000403522  hitchhiker  0.000308121 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3915  hypothetical protein  77.12 
 
 		 154 aa  251  3e-66  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3344  CheC domain-containing protein  79.08 
 
 		 155 aa  251  4.0000000000000004e-66  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0765  putative chemotaxis protein CheX  77.78 
 
 		 154 aa  250  6e-66  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000000000539649 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0719  putative chemotaxis protein CheX  77.78 
 
 		 154 aa  249  8.000000000000001e-66  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.00000000137536  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0748  CheC domain-containing protein  77.78 
 
 		 154 aa  249  8.000000000000001e-66  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.000188683  hitchhiker  0.000145879 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3636  putative chemotaxis protein CheX  77.78 
 
 		 154 aa  249  8.000000000000001e-66  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0000517443  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0739  CheC domain protein  77.78 
 
 		 154 aa  249  8.000000000000001e-66  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000054191  hitchhiker  0.000000000759122 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3246  putative chemotaxis protein CheX  77.78 
 
 		 154 aa  248  2e-65  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00000130186  hitchhiker  0.00000986039 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4204  CheC domain-containing protein  77.78 
 
 		 204 aa  246  6e-65  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.994344  hitchhiker  0.00000174212 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0523  CheC-like protein  75.16 
 
 		 155 aa  243  9e-64  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000195961  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00011  chemotaxis protein CheX  69.28 
 
 		 153 aa  236  1e-61  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002342  chemotaxis protein CheX  69.28 
 
 		 153 aa  236  1e-61  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0386  putative chemotaxis protein  69.28 
 
 		 164 aa  234  3e-61  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.352728  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2787  hypothetical protein  67.32 
 
 		 153 aa  231  3e-60  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.834766  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00638  CheC-like protein  62.75 
 
 		 154 aa  209  9e-54  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.00187096  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0409  cheC-like family protein  65.36 
 
 		 154 aa  205  2e-52  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0248  CheC-like protein  60.78 
 
 		 154 aa  202  2e-51  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0557914  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1196  chemotaxis protein CheX, putative  43.05 
 
 		 160 aa  132  9.999999999999999e-31  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.5213  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3133  chemotaxis protein CheX, putative  41.83 
 
 		 152 aa  129  2.0000000000000002e-29  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0281  chemotaxis protein CheX, putative  39.74 
 
 		 155 aa  125  2.0000000000000002e-28  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.180055  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2679  chemotaxis protein CheX, putative  39.74 
 
 		 155 aa  124  4.0000000000000003e-28  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.513529 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1817  chemotaxis protein CheX, putative  39.07 
 
 		 154 aa  121  4e-27  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0717  chemotaxis protein CheX, putative  36.6 
 
 		 152 aa  115  1.9999999999999998e-25  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.908176  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1986  chemotaxis protein CheX, putative  39.33 
 
 		 158 aa  113  8.999999999999998e-25  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1206  inhibitor of MCP methylation, CheC-like  30 
 
 		 152 aa  79.7  0.00000000000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.333742  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2875  CheC domain protein  30.57 
 
 		 171 aa  79  0.00000000000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3844  inhibitor of MCP methylation CheC-like protein  31.16 
 
 		 169 aa  75.5  0.0000000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3928  inhibitor of MCP methylation CheC-like protein  31.16 
 
 		 169 aa  76.3  0.0000000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.045223 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4219  inhibitor of MCP methylation CheC-like protein  32.54 
 
 		 168 aa  75.1  0.0000000000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3420  hypothetical protein  30 
 
 		 168 aa  73.2  0.000000000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3118  hypothetical protein  32.31 
 
 		 168 aa  71.6  0.000000000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2134  CheC domain protein  33.59 
 
 		 158 aa  69.7  0.00000000001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0151  CheC domain-containing protein  32.23 
 
 		 156 aa  67.8  0.00000000005  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.176363  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0634  CheC domain protein  27.08 
 
 		 160 aa  66.2  0.0000000001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1493  chemotaxis protein CheX  28.39 
 
 		 154 aa  66.6  0.0000000001  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0404  hypothetical protein  32.26 
 
 		 168 aa  65.5  0.0000000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.639025  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0650  inhibitor of MCP methylation, CheC-like protein  30.77 
 
 		 158 aa  63.2  0.000000001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.207901 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0826  CheC domain-containing protein  30.43 
 
 		 155 aa  63.2  0.000000001  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3283  inhibitor of MCP methylation CheC-like protein  28.23 
 
 		 166 aa  62  0.000000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0966  inhibitor of MCP methylation CheC-like protein  30.61 
 
 		 166 aa  61.2  0.000000004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1446  CheX protein (uncharacterized ORF in chemotaxis operon)  29.22 
 
 		 152 aa  61.2  0.000000005  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.238883  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0691  CheC-like family protein  31.51 
 
 		 161 aa  60.5  0.000000008  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  0.0452521  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0035  CheC domain protein  30.19 
 
 		 158 aa  60.1  0.00000001  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0126  CheC-like protein  29.29 
 
 		 154 aa  60.1  0.00000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.000893437  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0567  hypothetical protein  32.11 
 
 		 157 aa  60.1  0.00000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00522543  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2279  CheC domain protein  27.86 
 
 		 154 aa  58.2  0.00000004  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0352491  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1829  hypothetical protein  28.47 
 
 		 168 aa  57  0.00000008  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.666718  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4092  hypothetical protein  36.46 
 
 		 171 aa  56.6  0.0000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0178506  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0387  CheC-like family protein  30.14 
 
 		 149 aa  56.6  0.0000001  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.535958 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0811  chemotaxis protein CheX, putative  26 
 
 		 167 aa  55.5  0.0000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2135  putative chemotaxis protein CheX  24.05 
 
 		 164 aa  55.1  0.0000003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.234891  normal  0.802402 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3310  hypothetical protein  27.07 
 
 		 172 aa  55.1  0.0000003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0184  putative chemotaxis protein CheX  36 
 
 		 169 aa  53.1  0.000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000013186  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3060  hypothetical protein  33.71 
 
 		 166 aa  52.8  0.000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00029683  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2308  CheC-like protein  27.05 
 
 		 154 aa  51.6  0.000003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1769  inhibitor of MCP methylation-like protein  26.19 
 
 		 217 aa  51.6  0.000004  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0802325  hitchhiker  0.000530497 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0484  CheC domain-containing protein  30.25 
 
 		 155 aa  51.6  0.000004  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0436  hypothetical protein  33.33 
 
 		 176 aa  50.4  0.000009  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1282  CheC domain-containing protein  28.37 
 
 		 155 aa  50.4  0.000009  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.233529  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1173  CheC domain-containing protein  28.37 
 
 		 155 aa  49.3  0.00002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.362697  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1530  type IV pilus assembly PilZ  26.09 
 
 		 300 aa  49.3  0.00002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.174773  normal  0.910266 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1768  inhibitor of MCP methylation-like protein  23.57 
 
 		 159 aa  48.5  0.00003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0985649  hitchhiker  0.00193959 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0388  hypothetical protein  26.95 
 
 		 149 aa  47  0.00009  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.368051  normal  0.837689 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1768  CheC-like protein  22.88 
 
 		 165 aa  46.6  0.0001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1063  CheC domain protein  28 
 
 		 155 aa  44.3  0.0006  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6983  hypothetical protein  24.79 
 
 		 323 aa  44.3  0.0006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.546563  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0132  hypothetical protein  25.9 
 
 		 168 aa  44.3  0.0006  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1904  inhibitor of MCP methylation-like protein  23.61 
 
 		 163 aa  43.9  0.0008  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00098373  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3584  hypothetical protein  25 
 
 		 152 aa  43.5  0.001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1932  CheC domain protein  21.33 
 
 		 157 aa  42.4  0.002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.0227289  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2009  inhibitor of MCP methylation-like protein  27.19 
 
 		 165 aa  42.7  0.002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.458725  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1832  CheC domain-containing protein  31.37 
 
 		 137 aa  42.7  0.002  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  hitchhiker  0.00000797818  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2454  Tagatose-bisphosphate aldolase  32.94 
 
 		 329 aa  42.4  0.002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.214558  normal  0.936143 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4507  hypothetical protein  23.33 
 
 		 318 aa  41.6  0.003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.192995  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2921  hypothetical protein  23.68 
 
 		 184 aa  42  0.003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B3008  hypothetical protein  21.37 
 
 		 323 aa  42.4  0.003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1092  putative chemotaxis protein CheX  25.52 
 
 		 159 aa  40.4  0.008  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.391751 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2059  hypothetical protein  26.96 
 
 		 159 aa  40.4  0.009  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>