58 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plim_0811 on replicon NC_014148
Organism: Planctomyces limnophilus DSM 3776



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014148  Plim_0811  chemotaxis protein CheX, putative  100 
 
 
167 aa  337  5e-92  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2875  CheC domain protein  35.95 
 
 
171 aa  89.7  2e-17  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1196  chemotaxis protein CheX, putative  32.67 
 
 
160 aa  81.3  0.000000000000006  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.5213  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0409  cheC-like family protein  28.76 
 
 
154 aa  62  0.000000003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0281  chemotaxis protein CheX, putative  24.83 
 
 
155 aa  62  0.000000004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.180055  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0248  CheC-like protein  32.17 
 
 
154 aa  60.1  0.00000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0557914  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1986  chemotaxis protein CheX, putative  28.08 
 
 
158 aa  60.1  0.00000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1817  chemotaxis protein CheX, putative  25.5 
 
 
154 aa  58.9  0.00000003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2679  chemotaxis protein CheX, putative  26.17 
 
 
155 aa  58.9  0.00000003  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.513529 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3133  chemotaxis protein CheX, putative  26.49 
 
 
152 aa  57.4  0.00000009  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0715  putative chemotaxis protein CheX  26 
 
 
154 aa  57.4  0.00000009  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00000857864  hitchhiker  0.000181388 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3915  hypothetical protein  26 
 
 
154 aa  57.4  0.0000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0696  putative chemotaxis protein CheX  26 
 
 
154 aa  57  0.0000001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.0000403522  hitchhiker  0.000308121 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3246  putative chemotaxis protein CheX  26 
 
 
154 aa  56.6  0.0000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00000130186  hitchhiker  0.00000986039 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3636  putative chemotaxis protein CheX  26 
 
 
154 aa  55.8  0.0000003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0000517443  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3275  CheC domain-containing protein  26 
 
 
154 aa  55.5  0.0000003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000378704 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0719  putative chemotaxis protein CheX  26 
 
 
154 aa  55.8  0.0000003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.00000000137536  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3056  putative chemotaxis protein CheX  27.33 
 
 
154 aa  55.8  0.0000003  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.23032  normal  0.617715 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00638  CheC-like protein  28.57 
 
 
154 aa  55.8  0.0000003  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.00187096  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0739  CheC domain protein  26 
 
 
154 aa  55.8  0.0000003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000054191  hitchhiker  0.000000000759122 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0748  CheC domain-containing protein  26 
 
 
154 aa  55.5  0.0000003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.000188683  hitchhiker  0.000145879 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0760  putative chemotaxis protein CheX  26 
 
 
154 aa  54.7  0.0000006  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00000652399  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4204  CheC domain-containing protein  24.72 
 
 
204 aa  52.8  0.000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.994344  hitchhiker  0.00000174212 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3344  CheC domain-containing protein  27.78 
 
 
155 aa  51.6  0.000005  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0484  CheC domain-containing protein  27.01 
 
 
155 aa  51.6  0.000006  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0765  putative chemotaxis protein CheX  24.84 
 
 
154 aa  51.2  0.000007  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  unclonable  0.0000000000539649 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1092  putative chemotaxis protein CheX  30.19 
 
 
159 aa  50.1  0.00001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.391751 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3420  hypothetical protein  28.46 
 
 
168 aa  49.3  0.00003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0650  inhibitor of MCP methylation, CheC-like protein  23.24 
 
 
158 aa  48.5  0.00004  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.207901 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0717  chemotaxis protein CheX, putative  23.61 
 
 
152 aa  47.4  0.00009  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.908176  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3928  inhibitor of MCP methylation CheC-like protein  25.56 
 
 
169 aa  46.6  0.0001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.045223 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3844  inhibitor of MCP methylation CheC-like protein  25.56 
 
 
169 aa  47.4  0.0001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4219  inhibitor of MCP methylation CheC-like protein  26.32 
 
 
168 aa  47  0.0001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0523  CheC-like protein  24.6 
 
 
155 aa  45.4  0.0003  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000195961  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0184  putative chemotaxis protein CheX  27.78 
 
 
169 aa  45.8  0.0003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000013186  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1206  inhibitor of MCP methylation, CheC-like  28.97 
 
 
152 aa  45.8  0.0003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.333742  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1932  CheC domain protein  22.78 
 
 
157 aa  45.4  0.0004  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.0227289  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3060  hypothetical protein  30.14 
 
 
166 aa  45.1  0.0005  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00029683  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1768  inhibitor of MCP methylation-like protein  27.56 
 
 
159 aa  44.3  0.0007  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0985649  hitchhiker  0.00193959 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0035  CheC domain protein  25 
 
 
158 aa  44.3  0.0008  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2279  CheC domain protein  26.8 
 
 
154 aa  44.3  0.0008  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0352491  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0634  CheC domain protein  20.67 
 
 
160 aa  43.5  0.001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0404  hypothetical protein  30.86 
 
 
168 aa  43.9  0.001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.639025  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1786  hypothetical protein  39.02 
 
 
153 aa  43.1  0.002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.12078  normal  0.851363 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2135  putative chemotaxis protein CheX  25.17 
 
 
164 aa  43.1  0.002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.234891  normal  0.802402 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1768  CheC-like protein  25.17 
 
 
165 aa  43.5  0.002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1063  CheC domain protein  19.86 
 
 
155 aa  42.4  0.003  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3283  inhibitor of MCP methylation CheC-like protein  30 
 
 
166 aa  42  0.003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0567  hypothetical protein  25.58 
 
 
157 aa  42.4  0.003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00522543  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3118  hypothetical protein  28.18 
 
 
168 aa  42.4  0.003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0132  hypothetical protein  24.14 
 
 
168 aa  41.2  0.006  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1530  type IV pilus assembly PilZ  26.27 
 
 
300 aa  41.6  0.006  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.174773  normal  0.910266 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0966  inhibitor of MCP methylation CheC-like protein  28.75 
 
 
166 aa  41.2  0.007  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1769  inhibitor of MCP methylation-like protein  24.31 
 
 
217 aa  41.2  0.007  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0802325  hitchhiker  0.000530497 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3310  hypothetical protein  29.1 
 
 
172 aa  41.2  0.007  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3596  hypothetical protein  28.97 
 
 
150 aa  40.8  0.008  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0826  CheC domain-containing protein  23.36 
 
 
155 aa  41.2  0.008  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2921  hypothetical protein  34.18 
 
 
184 aa  40.8  0.01  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>