59 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmc1_1769 on replicon NC_008576
Organism: Magnetococcus sp. MC-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008576  Mmc1_1769  inhibitor of MCP methylation-like protein  100 
 
 		 217 aa  436  1e-121  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0802325  hitchhiker  0.000530497 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1768  inhibitor of MCP methylation-like protein  46.71 
 
 		 159 aa  136  2e-31  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0985649  hitchhiker  0.00193959 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2135  putative chemotaxis protein CheX  35.44 
 
 		 164 aa  95.9  4e-19  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.234891  normal  0.802402 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1530  type IV pilus assembly PilZ  35.67 
 
 		 300 aa  87.4  2e-16  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.174773  normal  0.910266 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1092  putative chemotaxis protein CheX  35.9 
 
 		 159 aa  84  0.000000000000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.391751 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0567  hypothetical protein  30 
 
 		 157 aa  75.1  0.0000000000007  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00522543  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1206  inhibitor of MCP methylation, CheC-like  27.21 
 
 		 152 aa  63.5  0.000000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.333742  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3420  hypothetical protein  25 
 
 		 168 aa  63.5  0.000000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1173  CheC domain-containing protein  30.95 
 
 		 155 aa  62.4  0.000000005  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.362697  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1282  CheC domain-containing protein  30.95 
 
 		 155 aa  62.4  0.000000005  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.233529  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1829  hypothetical protein  26.35 
 
 		 168 aa  59.3  0.00000005  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.666718  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0650  inhibitor of MCP methylation, CheC-like protein  30.83 
 
 		 158 aa  57.8  0.0000001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.207901 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0826  CheC domain-containing protein  30.77 
 
 		 155 aa  57.4  0.0000002  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0132  hypothetical protein  28 
 
 		 168 aa  57  0.0000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4219  inhibitor of MCP methylation CheC-like protein  28.47 
 
 		 168 aa  55.8  0.0000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0484  CheC domain-containing protein  25.6 
 
 		 155 aa  55.5  0.0000006  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0248  CheC-like protein  28.39 
 
 		 154 aa  54.7  0.000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0557914  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3928  inhibitor of MCP methylation CheC-like protein  26.81 
 
 		 169 aa  53.1  0.000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.045223 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3844  inhibitor of MCP methylation CheC-like protein  27.54 
 
 		 169 aa  52.8  0.000004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3060  hypothetical protein  24.5 
 
 		 166 aa  52.8  0.000004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00029683  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0966  inhibitor of MCP methylation CheC-like protein  23.65 
 
 		 166 aa  51.6  0.000009  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3275  CheC domain-containing protein  26.19 
 
 		 154 aa  51.6  0.000009  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000378704 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3133  chemotaxis protein CheX, putative  25.32 
 
 		 152 aa  51.2  0.00001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3283  inhibitor of MCP methylation CheC-like protein  23.49 
 
 		 166 aa  49.7  0.00003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3310  hypothetical protein  24.65 
 
 		 172 aa  50.1  0.00003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4092  hypothetical protein  27.71 
 
 		 171 aa  50.1  0.00003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0178506  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3118  hypothetical protein  25.36 
 
 		 168 aa  49.3  0.00004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3584  hypothetical protein  28.39 
 
 		 152 aa  48.1  0.0001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0386  putative chemotaxis protein  31.31 
 
 		 164 aa  47.4  0.0002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.352728  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1196  chemotaxis protein CheX, putative  23.58 
 
 		 160 aa  45.8  0.0005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.5213  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0324  hypothetical protein  31.3 
 
 		 167 aa  45.4  0.0007  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.460798  normal  0.496823 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4204  CheC domain-containing protein  24.18 
 
 		 204 aa  45.1  0.0008  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.994344  hitchhiker  0.00000174212 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0634  CheC domain protein  23.88 
 
 		 160 aa  44.3  0.001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0717  chemotaxis protein CheX, putative  22.78 
 
 		 152 aa  44.7  0.001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.908176  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1817  chemotaxis protein CheX, putative  26.53 
 
 		 154 aa  44.3  0.001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2875  CheC domain protein  23.75 
 
 		 171 aa  44.3  0.001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0281  chemotaxis protein CheX, putative  29.66 
 
 		 155 aa  44.7  0.001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.180055  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0523  CheC-like protein  24.18 
 
 		 155 aa  44.7  0.001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000195961  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0760  putative chemotaxis protein CheX  24.03 
 
 		 154 aa  43.5  0.002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00000652399  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2921  hypothetical protein  28.09 
 
 		 184 aa  43.9  0.002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00638  CheC-like protein  31.43 
 
 		 154 aa  43.9  0.002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.00187096  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3344  CheC domain-containing protein  23.53 
 
 		 155 aa  43.1  0.003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0404  hypothetical protein  24.53 
 
 		 168 aa  42.7  0.004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.639025  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0748  CheC domain-containing protein  24.03 
 
 		 154 aa  42.4  0.005  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.000188683  hitchhiker  0.000145879 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1986  chemotaxis protein CheX, putative  27.93 
 
 		 158 aa  42.4  0.005  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0184  putative chemotaxis protein CheX  27.56 
 
 		 169 aa  42.4  0.005  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000013186  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0696  putative chemotaxis protein CheX  24.03 
 
 		 154 aa  42  0.006  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.0000403522  hitchhiker  0.000308121 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0739  CheC domain protein  23.38 
 
 		 154 aa  42  0.006  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000054191  hitchhiker  0.000000000759122 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0719  putative chemotaxis protein CheX  23.38 
 
 		 154 aa  42  0.006  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.00000000137536  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0715  putative chemotaxis protein CheX  24.03 
 
 		 154 aa  42.4  0.006  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00000857864  hitchhiker  0.000181388 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3636  putative chemotaxis protein CheX  23.38 
 
 		 154 aa  42  0.006  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0000517443  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0409  cheC-like family protein  30.39 
 
 		 154 aa  42  0.007  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002342  chemotaxis protein CheX  28.28 
 
 		 153 aa  42  0.007  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00011  chemotaxis protein CheX  28.28 
 
 		 153 aa  42  0.007  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3246  putative chemotaxis protein CheX  24.03 
 
 		 154 aa  42  0.008  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00000130186  hitchhiker  0.00000986039 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3056  putative chemotaxis protein CheX  24.68 
 
 		 154 aa  41.6  0.008  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.23032  normal  0.617715 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3915  hypothetical protein  24.03 
 
 		 154 aa  42  0.008  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2308  CheC-like protein  25.78 
 
 		 154 aa  41.6  0.009  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1446  CheX protein (uncharacterized ORF in chemotaxis operon)  29.21 
 
 		 152 aa  41.6  0.01  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.238883  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>