59 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Oter_4092 on replicon NC_010571
Organism: Opitutus terrae PB90-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010571  Oter_4092  hypothetical protein  100 
 
 		 171 aa  353  5.999999999999999e-97  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0178506  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0436  hypothetical protein  50.57 
 
 		 176 aa  176  1e-43  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3420  hypothetical protein  31.52 
 
 		 168 aa  74.3  0.0000000000007  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3310  hypothetical protein  30.25 
 
 		 172 aa  73.9  0.000000000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4219  inhibitor of MCP methylation CheC-like protein  30.49 
 
 		 168 aa  67.4  0.00000000008  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1829  hypothetical protein  26.99 
 
 		 168 aa  67.4  0.00000000009  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.666718  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0132  hypothetical protein  29.8 
 
 		 168 aa  66.6  0.0000000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3928  inhibitor of MCP methylation CheC-like protein  29.7 
 
 		 169 aa  66.6  0.0000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.045223 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3844  inhibitor of MCP methylation CheC-like protein  29.7 
 
 		 169 aa  66.2  0.0000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3118  hypothetical protein  29.17 
 
 		 168 aa  65.9  0.0000000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3283  inhibitor of MCP methylation CheC-like protein  25.75 
 
 		 166 aa  65.9  0.0000000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0184  putative chemotaxis protein CheX  27.27 
 
 		 169 aa  62.4  0.000000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000013186  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0567  hypothetical protein  25.97 
 
 		 157 aa  61.2  0.000000006  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00522543  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0404  hypothetical protein  29.17 
 
 		 168 aa  60.8  0.000000008  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.639025  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1206  inhibitor of MCP methylation, CheC-like  25.68 
 
 		 152 aa  59.3  0.00000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.333742  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0966  inhibitor of MCP methylation CheC-like protein  24.7 
 
 		 166 aa  59.3  0.00000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2921  hypothetical protein  34.55 
 
 		 184 aa  57.8  0.00000007  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2279  CheC domain protein  28.48 
 
 		 154 aa  57.8  0.00000007  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0352491  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3275  CheC domain-containing protein  36.46 
 
 		 154 aa  56.6  0.0000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000378704 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3060  hypothetical protein  26.09 
 
 		 166 aa  55.1  0.0000004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00029683  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2134  CheC domain protein  26.56 
 
 		 158 aa  55.5  0.0000004  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2875  CheC domain protein  28.66 
 
 		 171 aa  54.3  0.0000008  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3344  CheC domain-containing protein  33.33 
 
 		 155 aa  53.9  0.000001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0248  CheC-like protein  34.34 
 
 		 154 aa  53.9  0.000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0557914  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3133  chemotaxis protein CheX, putative  29.63 
 
 		 152 aa  51.6  0.000005  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0826  CheC domain-containing protein  25.58 
 
 		 155 aa  51.6  0.000006  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0760  putative chemotaxis protein CheX  34.38 
 
 		 154 aa  50.1  0.00001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00000652399  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0484  CheC domain-containing protein  25.78 
 
 		 155 aa  49.7  0.00002  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0523  CheC-like protein  35.71 
 
 		 155 aa  50.1  0.00002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000195961  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1769  inhibitor of MCP methylation-like protein  27.71 
 
 		 217 aa  50.1  0.00002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0802325  hitchhiker  0.000530497 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0748  CheC domain-containing protein  33.64 
 
 		 154 aa  48.9  0.00003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.000188683  hitchhiker  0.000145879 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3246  putative chemotaxis protein CheX  32.38 
 
 		 154 aa  48.9  0.00003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00000130186  hitchhiker  0.00000986039 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0719  putative chemotaxis protein CheX  33.64 
 
 		 154 aa  48.9  0.00004  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.00000000137536  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0739  CheC domain protein  33.64 
 
 		 154 aa  48.9  0.00004  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000054191  hitchhiker  0.000000000759122 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3636  putative chemotaxis protein CheX  33.64 
 
 		 154 aa  48.9  0.00004  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0000517443  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0696  putative chemotaxis protein CheX  32.65 
 
 		 154 aa  48.5  0.00004  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.0000403522  hitchhiker  0.000308121 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0126  CheC-like protein  27.97 
 
 		 154 aa  48.5  0.00005  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.000893437  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3915  hypothetical protein  33.33 
 
 		 154 aa  48.5  0.00005  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0650  inhibitor of MCP methylation, CheC-like protein  24.5 
 
 		 158 aa  48.1  0.00005  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.207901 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0715  putative chemotaxis protein CheX  32.65 
 
 		 154 aa  48.1  0.00006  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00000857864  hitchhiker  0.000181388 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3056  putative chemotaxis protein CheX  31.25 
 
 		 154 aa  47.8  0.00007  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.23032  normal  0.617715 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0765  putative chemotaxis protein CheX  31 
 
 		 154 aa  46.2  0.0002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000000000539649 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0386  putative chemotaxis protein  28.99 
 
 		 164 aa  46.2  0.0002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.352728  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2318  hypothetical protein  39.51 
 
 		 161 aa  45.8  0.0003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0888  inhibitor of MCP methylation-like protein  28.46 
 
 		 166 aa  45.4  0.0004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0522691  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0717  chemotaxis protein CheX, putative  26.77 
 
 		 152 aa  45.1  0.0004  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.908176  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1447  chemotaxis operon protein  28.57 
 
 		 158 aa  45.1  0.0005  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.34666  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3372  inhibitor of MCP methylation-like protein  28.46 
 
 		 166 aa  45.1  0.0005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2787  hypothetical protein  28.1 
 
 		 153 aa  44.7  0.0006  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.834766  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4204  CheC domain-containing protein  32.29 
 
 		 204 aa  44.7  0.0007  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.994344  hitchhiker  0.00000174212 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00011  chemotaxis protein CheX  28.93 
 
 		 153 aa  44.7  0.0007  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002342  chemotaxis protein CheX  28.93 
 
 		 153 aa  44.7  0.0007  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00638  CheC-like protein  26.5 
 
 		 154 aa  43.9  0.001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.00187096  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1768  inhibitor of MCP methylation-like protein  24.63 
 
 		 159 aa  43.5  0.002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0985649  hitchhiker  0.00193959 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1493  chemotaxis protein CheX  30 
 
 		 154 aa  42.7  0.002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1196  chemotaxis protein CheX, putative  26.36 
 
 		 160 aa  42.4  0.003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.5213  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1604  CheC, inhibitor of MCP methylation  30.49 
 
 		 464 aa  41.6  0.005  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1173  CheC domain-containing protein  31.25 
 
 		 155 aa  41.2  0.007  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.362697  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1282  CheC domain-containing protein  31.25 
 
 		 155 aa  41.2  0.007  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.233529  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>