78 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TRQ2_1282 on replicon NC_010483
Organism: Thermotoga sp. RQ2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010483  TRQ2_1282  CheC domain-containing protein  100 
 
 
155 aa  306  5.9999999999999995e-83  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.233529  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1173  CheC domain-containing protein  97.42 
 
 
155 aa  301  2.0000000000000002e-81  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.362697  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0484  CheC domain-containing protein  56.13 
 
 
155 aa  178  2e-44  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0826  CheC domain-containing protein  53.9 
 
 
155 aa  169  9e-42  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1832  CheC domain-containing protein  40.16 
 
 
137 aa  106  1e-22  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  hitchhiker  0.00000797818  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1446  CheX protein (uncharacterized ORF in chemotaxis operon)  34.42 
 
 
152 aa  84.7  4e-16  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.238883  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2279  CheC domain protein  32.03 
 
 
154 aa  82.8  0.000000000000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0352491  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0151  CheC domain-containing protein  31.33 
 
 
156 aa  83.2  0.000000000000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.176363  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2134  CheC domain protein  34.35 
 
 
158 aa  81.3  0.000000000000004  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0634  CheC domain protein  32.05 
 
 
160 aa  81.6  0.000000000000004  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0126  CheC-like protein  30.92 
 
 
154 aa  80.9  0.000000000000006  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.000893437  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1493  chemotaxis protein CheX  31.25 
 
 
154 aa  70.9  0.000000000007  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2263  CheC domain protein  34.65 
 
 
152 aa  64.7  0.0000000005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000000104148  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2308  CheC-like protein  26.62 
 
 
154 aa  63.2  0.000000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1769  inhibitor of MCP methylation-like protein  30.95 
 
 
217 aa  62.4  0.000000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0802325  hitchhiker  0.000530497 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1176  CheC-like protein  40.24 
 
 
148 aa  62  0.000000003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0308  hypothetical protein  34.87 
 
 
162 aa  60.5  0.000000008  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  unclonable  0.0000000030204  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1063  CheC domain protein  35.29 
 
 
155 aa  58.5  0.00000003  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0691  CheC-like family protein  28.87 
 
 
161 aa  55.1  0.0000003  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  0.0452521  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2787  hypothetical protein  30.99 
 
 
153 aa  54.3  0.0000006  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.834766  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1829  hypothetical protein  28.12 
 
 
168 aa  53.9  0.0000008  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.666718  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1768  CheC-like protein  27.12 
 
 
165 aa  53.5  0.000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00011  chemotaxis protein CheX  30.28 
 
 
153 aa  53.1  0.000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002342  chemotaxis protein CheX  30.28 
 
 
153 aa  53.1  0.000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1196  chemotaxis protein CheX, putative  27.87 
 
 
160 aa  52.8  0.000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.5213  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2232  CheC domain protein  44.05 
 
 
158 aa  52.8  0.000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1531  CheC, inhibitor of MCP methylation  36.14 
 
 
357 aa  51.6  0.000004  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.226498  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2921  hypothetical protein  29.7 
 
 
184 aa  51.2  0.000005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0386  putative chemotaxis protein  29.58 
 
 
164 aa  50.4  0.000008  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.352728  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3275  CheC domain-containing protein  28.37 
 
 
154 aa  50.4  0.00001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000378704 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1768  inhibitor of MCP methylation-like protein  29.1 
 
 
159 aa  50.1  0.00001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0985649  hitchhiker  0.00193959 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0404  hypothetical protein  27.34 
 
 
168 aa  50.4  0.00001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.639025  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1447  chemotaxis operon protein  27.68 
 
 
158 aa  50.1  0.00001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.34666  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0248  CheC-like protein  27.27 
 
 
154 aa  50.1  0.00001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0557914  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1476  CheX protein (uncharacterized ORF in chemotaxis operon)  35.82 
 
 
94 aa  49.7  0.00002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2875  CheC domain protein  30.71 
 
 
171 aa  49.3  0.00002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0567  hypothetical protein  26.27 
 
 
157 aa  49.3  0.00002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00522543  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0035  CheC domain protein  25.95 
 
 
158 aa  48.9  0.00003  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3283  inhibitor of MCP methylation CheC-like protein  29.01 
 
 
166 aa  48.9  0.00003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0281  chemotaxis protein CheX, putative  25.42 
 
 
155 aa  48.1  0.00005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.180055  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3420  hypothetical protein  32.58 
 
 
168 aa  48.1  0.00005  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3133  chemotaxis protein CheX, putative  24.65 
 
 
152 aa  47.8  0.00006  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2679  chemotaxis protein CheX, putative  25.42 
 
 
155 aa  47.8  0.00006  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.513529 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3310  hypothetical protein  25.32 
 
 
172 aa  47  0.00009  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1932  CheC domain protein  32.91 
 
 
157 aa  46.6  0.0001  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.0227289  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3118  hypothetical protein  25.58 
 
 
168 aa  46.6  0.0001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3844  inhibitor of MCP methylation CheC-like protein  32.61 
 
 
169 aa  46.6  0.0001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1299  CheC, inhibitor of MCP methylation  38.75 
 
 
370 aa  47  0.0001  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3344  CheC domain-containing protein  27.66 
 
 
155 aa  47  0.0001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1403  CheC, inhibitor of MCP methylation / FliN fusion protein  29.06 
 
 
381 aa  46.6  0.0001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3060  hypothetical protein  31.03 
 
 
166 aa  45.8  0.0002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00029683  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2135  putative chemotaxis protein CheX  25.93 
 
 
164 aa  44.7  0.0005  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.234891  normal  0.802402 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1206  inhibitor of MCP methylation, CheC-like  24.35 
 
 
152 aa  44.3  0.0006  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.333742  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3928  inhibitor of MCP methylation CheC-like protein  31.52 
 
 
169 aa  44.3  0.0006  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.045223 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4219  inhibitor of MCP methylation CheC-like protein  31.87 
 
 
168 aa  43.9  0.0007  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1817  chemotaxis protein CheX, putative  24.63 
 
 
154 aa  43.9  0.0008  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1986  chemotaxis protein CheX, putative  25.36 
 
 
158 aa  43.9  0.0009  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0184  putative chemotaxis protein CheX  26.67 
 
 
169 aa  43.1  0.001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000013186  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0966  inhibitor of MCP methylation CheC-like protein  26.92 
 
 
166 aa  43.1  0.001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0523  CheC-like protein  25.53 
 
 
155 aa  43.5  0.001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000195961  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00638  CheC-like protein  27.14 
 
 
154 aa  42.7  0.002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.00187096  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1666  CheC, inhibitor of MCP methylation  27.78 
 
 
205 aa  42.7  0.002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0231538  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0249  CheC, inhibitor of MCP methylation / FliN fusion protein  34.94 
 
 
346 aa  42.7  0.002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4092  hypothetical protein  31.25 
 
 
171 aa  41.2  0.005  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0178506  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1123  flagellar motor switch protein  34.48 
 
 
401 aa  41.2  0.005  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0251  CheC, inhibitor of MCP methylation  37.5 
 
 
346 aa  41.6  0.005  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3636  putative chemotaxis protein CheX  24.82 
 
 
154 aa  41.2  0.006  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0000517443  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4142  CheC, inhibitor of MCP methylation / FliN fusion protein  32.28 
 
 
417 aa  41.2  0.006  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3915  hypothetical protein  24.82 
 
 
154 aa  40.8  0.006  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0719  putative chemotaxis protein CheX  24.82 
 
 
154 aa  41.2  0.006  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.00000000137536  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3246  putative chemotaxis protein CheX  24.82 
 
 
154 aa  41.2  0.006  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00000130186  hitchhiker  0.00000986039 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0739  CheC domain protein  24.82 
 
 
154 aa  41.2  0.006  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000054191  hitchhiker  0.000000000759122 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0715  putative chemotaxis protein CheX  24.82 
 
 
154 aa  40.8  0.007  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00000857864  hitchhiker  0.000181388 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0696  putative chemotaxis protein CheX  24.82 
 
 
154 aa  40.4  0.008  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.0000403522  hitchhiker  0.000308121 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0436  hypothetical protein  26.81 
 
 
176 aa  40.8  0.008  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0717  chemotaxis protein CheX, putative  26.8 
 
 
152 aa  40.4  0.009  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.908176  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0748  CheC domain-containing protein  24.11 
 
 
154 aa  40.4  0.009  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.000188683  hitchhiker  0.000145879 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4130  CheC, inhibitor of MCP methylation  31.17 
 
 
198 aa  40.4  0.009  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000839362  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>