79 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tmel_0484 on replicon NC_009616
Organism: Thermosipho melanesiensis BI429



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009616  Tmel_0484  CheC domain-containing protein  100 
 
 		 155 aa  308  2e-83  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0826  CheC domain-containing protein  60.78 
 
 		 155 aa  200  6e-51  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1173  CheC domain-containing protein  56.77 
 
 		 155 aa  180  8.000000000000001e-45  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.362697  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1282  CheC domain-containing protein  56.13 
 
 		 155 aa  178  2e-44  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.233529  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1832  CheC domain-containing protein  41.73 
 
 		 137 aa  114  3.9999999999999997e-25  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  hitchhiker  0.00000797818  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0634  CheC domain protein  32.03 
 
 		 160 aa  82.4  0.000000000000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2308  CheC-like protein  28.29 
 
 		 154 aa  74.7  0.0000000000004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2279  CheC domain protein  33.07 
 
 		 154 aa  73.6  0.0000000000009  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0352491  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2134  CheC domain protein  33.57 
 
 		 158 aa  73.6  0.000000000001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1446  CheX protein (uncharacterized ORF in chemotaxis operon)  31.37 
 
 		 152 aa  73.2  0.000000000001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.238883  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0151  CheC domain-containing protein  34.82 
 
 		 156 aa  68.9  0.00000000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.176363  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0126  CheC-like protein  33.07 
 
 		 154 aa  69.3  0.00000000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.000893437  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2263  CheC domain protein  30.71 
 
 		 152 aa  67.8  0.00000000006  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000000104148  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1063  CheC domain protein  35.19 
 
 		 155 aa  65.5  0.0000000002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1493  chemotaxis protein CheX  24.34 
 
 		 154 aa  62.8  0.000000002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2232  CheC domain protein  42.39 
 
 		 158 aa  61.6  0.000000004  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0248  CheC-like protein  30.22 
 
 		 154 aa  60.8  0.000000006  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0557914  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0404  hypothetical protein  29.37 
 
 		 168 aa  58.2  0.00000004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.639025  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2135  putative chemotaxis protein CheX  31.93 
 
 		 164 aa  58.2  0.00000005  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.234891  normal  0.802402 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1829  hypothetical protein  28.35 
 
 		 168 aa  57.8  0.00000005  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.666718  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1768  CheC-like protein  25.64 
 
 		 165 aa  57.4  0.00000006  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3133  chemotaxis protein CheX, putative  26.43 
 
 		 152 aa  57  0.0000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3118  hypothetical protein  27.78 
 
 		 168 aa  56.6  0.0000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1196  chemotaxis protein CheX, putative  29.17 
 
 		 160 aa  55.8  0.0000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.5213  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1769  inhibitor of MCP methylation-like protein  25.6 
 
 		 217 aa  55.5  0.0000003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0802325  hitchhiker  0.000530497 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1176  CheC-like protein  36.26 
 
 		 148 aa  53.5  0.000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0567  hypothetical protein  30.59 
 
 		 157 aa  52.4  0.000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00522543  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1206  inhibitor of MCP methylation, CheC-like  28.47 
 
 		 152 aa  52.8  0.000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.333742  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0281  chemotaxis protein CheX, putative  24 
 
 		 155 aa  52.8  0.000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.180055  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2787  hypothetical protein  24.84 
 
 		 153 aa  52.4  0.000002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.834766  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00011  chemotaxis protein CheX  24.84 
 
 		 153 aa  52.4  0.000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002342  chemotaxis protein CheX  24.84 
 
 		 153 aa  52.4  0.000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3275  CheC domain-containing protein  30.25 
 
 		 154 aa  51.6  0.000004  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000378704 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0811  chemotaxis protein CheX, putative  27.01 
 
 		 167 aa  51.6  0.000004  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2875  CheC domain protein  25.58 
 
 		 171 aa  51.6  0.000004  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4219  inhibitor of MCP methylation CheC-like protein  26.89 
 
 		 168 aa  51.2  0.000005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2679  chemotaxis protein CheX, putative  25.52 
 
 		 155 aa  51.2  0.000005  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.513529 
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0691  CheC-like family protein  29.87 
 
 		 161 aa  50.8  0.000006  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  0.0452521  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00638  CheC-like protein  25.18 
 
 		 154 aa  50.8  0.000006  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.00187096  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3844  inhibitor of MCP methylation CheC-like protein  26.8 
 
 		 169 aa  50.4  0.000008  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1666  CheC, inhibitor of MCP methylation  32.22 
 
 		 205 aa  50.1  0.00001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0231538  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3310  hypothetical protein  27.03 
 
 		 172 aa  50.1  0.00001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1817  chemotaxis protein CheX, putative  24.67 
 
 		 154 aa  48.9  0.00002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4092  hypothetical protein  25.78 
 
 		 171 aa  49.7  0.00002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0178506  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0717  chemotaxis protein CheX, putative  25 
 
 		 152 aa  49.7  0.00002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.908176  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0035  CheC domain protein  26.32 
 
 		 158 aa  49.7  0.00002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1932  CheC domain protein  25 
 
 		 157 aa  49.3  0.00002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.0227289  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3928  inhibitor of MCP methylation CheC-like protein  26.14 
 
 		 169 aa  49.3  0.00002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.045223 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3420  hypothetical protein  26.05 
 
 		 168 aa  49.3  0.00002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1530  type IV pilus assembly PilZ  24.56 
 
 		 300 aa  48.9  0.00003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.174773  normal  0.910266 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0386  putative chemotaxis protein  23.53 
 
 		 164 aa  48.5  0.00003  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.352728  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0132  hypothetical protein  27.48 
 
 		 168 aa  48.1  0.00005  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1604  CheC, inhibitor of MCP methylation  37.97 
 
 		 464 aa  47  0.00009  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1447  chemotaxis operon protein  35 
 
 		 158 aa  47  0.0001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.34666  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1092  putative chemotaxis protein CheX  26.04 
 
 		 159 aa  46.6  0.0001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.391751 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0184  putative chemotaxis protein CheX  25.37 
 
 		 169 aa  46.6  0.0001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000013186  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1531  CheC, inhibitor of MCP methylation  35.8 
 
 		 357 aa  45.1  0.0004  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.226498  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1723  CheC, inhibitor of MCP methylation  33.03 
 
 		 229 aa  44.7  0.0005  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.348388  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3283  inhibitor of MCP methylation CheC-like protein  27.84 
 
 		 166 aa  44.3  0.0006  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1986  chemotaxis protein CheX, putative  24.82 
 
 		 158 aa  43.1  0.001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0436  hypothetical protein  25 
 
 		 176 aa  43.5  0.001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3060  hypothetical protein  28.92 
 
 		 166 aa  42.7  0.002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00029683  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0739  CheC, inhibitor of MCP methylation  31.82 
 
 		 229 aa  42.7  0.002  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.91151  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2009  inhibitor of MCP methylation-like protein  26.27 
 
 		 165 aa  42  0.003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.458725  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0492  CheC, inhibitor of MCP methylation  31.46 
 
 		 206 aa  42  0.003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0966  inhibitor of MCP methylation CheC-like protein  26.26 
 
 		 166 aa  41.6  0.004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0409  cheC-like family protein  24.46 
 
 		 154 aa  41.6  0.005  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3344  CheC domain-containing protein  26.75 
 
 		 155 aa  41.6  0.005  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3246  putative chemotaxis protein CheX  23.53 
 
 		 154 aa  41.2  0.006  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00000130186  hitchhiker  0.00000986039 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0650  inhibitor of MCP methylation, CheC-like protein  23.68 
 
 		 158 aa  40.8  0.006  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.207901 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0719  putative chemotaxis protein CheX  22.3 
 
 		 154 aa  40.8  0.008  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.00000000137536  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3636  putative chemotaxis protein CheX  22.3 
 
 		 154 aa  40.8  0.008  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0000517443  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0739  CheC domain protein  22.3 
 
 		 154 aa  40.8  0.008  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000054191  hitchhiker  0.000000000759122 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0523  CheC-like protein  22.14 
 
 		 155 aa  40.4  0.009  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000195961  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0308  hypothetical protein  28.24 
 
 		 162 aa  40.4  0.009  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  unclonable  0.0000000030204  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1476  CheX protein (uncharacterized ORF in chemotaxis operon)  37.31 
 
 		 94 aa  40.4  0.009  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0748  CheC domain-containing protein  22.3 
 
 		 154 aa  40.4  0.009  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.000188683  hitchhiker  0.000145879 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0714  CheC, inhibitor of MCP methylation  35.09 
 
 		 207 aa  40.4  0.01  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3915  hypothetical protein  22.3 
 
 		 154 aa  40.4  0.01  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>