44 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dhaf_2263 on replicon NC_011830
Organism: Desulfitobacterium hafniense DCB-2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011830  Dhaf_2263  CheC domain protein  100 
 
 
152 aa  310  6.999999999999999e-84  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000000104148  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0634  CheC domain protein  44.83 
 
 
160 aa  113  7.999999999999999e-25  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2308  CheC-like protein  46.72 
 
 
154 aa  113  7.999999999999999e-25  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0826  CheC domain-containing protein  31.75 
 
 
155 aa  68.6  0.00000000003  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0484  CheC domain-containing protein  30.71 
 
 
155 aa  67.8  0.00000000006  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1282  CheC domain-containing protein  34.65 
 
 
155 aa  64.7  0.0000000005  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.233529  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0151  CheC domain-containing protein  31.4 
 
 
156 aa  63.9  0.0000000008  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.176363  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1173  CheC domain-containing protein  34.65 
 
 
155 aa  63.9  0.0000000008  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.362697  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2134  CheC domain protein  31.09 
 
 
158 aa  62  0.000000003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0126  CheC-like protein  31.09 
 
 
154 aa  61.6  0.000000004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.000893437  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1176  CheC-like protein  40.24 
 
 
148 aa  61.6  0.000000004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1768  CheC-like protein  26.03 
 
 
165 aa  60.5  0.000000008  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2279  CheC domain protein  27.74 
 
 
154 aa  58.9  0.00000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0352491  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1446  CheX protein (uncharacterized ORF in chemotaxis operon)  34.12 
 
 
152 aa  57  0.00000009  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.238883  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1832  CheC domain-containing protein  30.83 
 
 
137 aa  55.8  0.0000002  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  hitchhiker  0.00000797818  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1493  chemotaxis protein CheX  26.27 
 
 
154 aa  54.7  0.0000004  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1932  CheC domain protein  23.97 
 
 
157 aa  54.3  0.0000005  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.0227289  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0035  CheC domain protein  32.04 
 
 
158 aa  53.9  0.0000008  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3133  chemotaxis protein CheX, putative  30.77 
 
 
152 aa  51.6  0.000004  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0717  chemotaxis protein CheX, putative  32.04 
 
 
152 aa  50.8  0.000007  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.908176  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1817  chemotaxis protein CheX, putative  30.63 
 
 
154 aa  48.9  0.00003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1063  CheC domain protein  25.53 
 
 
155 aa  48.5  0.00003  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2679  chemotaxis protein CheX, putative  35.37 
 
 
155 aa  48.9  0.00003  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.513529 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0281  chemotaxis protein CheX, putative  28.83 
 
 
155 aa  47  0.0001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.180055  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2875  CheC domain protein  24.19 
 
 
171 aa  45.8  0.0002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3060  hypothetical protein  28.43 
 
 
166 aa  46.2  0.0002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00029683  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0714  CheC, inhibitor of MCP methylation  32.81 
 
 
207 aa  46.2  0.0002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1447  chemotaxis operon protein  24.8 
 
 
158 aa  45.4  0.0003  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.34666  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4219  inhibitor of MCP methylation CheC-like protein  27.78 
 
 
168 aa  45.4  0.0003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0567  hypothetical protein  35.19 
 
 
157 aa  44.3  0.0005  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00522543  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1530  type IV pilus assembly PilZ  29.03 
 
 
300 aa  43.9  0.0008  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.174773  normal  0.910266 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0388  hypothetical protein  40.79 
 
 
149 aa  43.9  0.0008  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.368051  normal  0.837689 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1829  hypothetical protein  31.65 
 
 
168 aa  43.1  0.001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.666718  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0492  CheC, inhibitor of MCP methylation  31.82 
 
 
206 aa  42  0.003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0404  hypothetical protein  30.26 
 
 
168 aa  41.6  0.003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.639025  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0381  CheC, inhibitor of MCP methylation  30 
 
 
204 aa  42  0.003  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1439  CheC, inhibitor of MCP methylation  30.95 
 
 
207 aa  42  0.003  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0815447  normal  0.0545978 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2147  CheC, inhibitor of MCP methylation  36.36 
 
 
205 aa  41.6  0.004  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000207835  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3283  inhibitor of MCP methylation CheC-like protein  28.3 
 
 
166 aa  41.6  0.004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0691  CheC-like family protein  24.19 
 
 
161 aa  40.8  0.006  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  0.0452521  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2232  CheC domain protein  25.87 
 
 
158 aa  40.8  0.006  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1092  putative chemotaxis protein CheX  25 
 
 
159 aa  40.8  0.006  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.391751 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1666  CheC, inhibitor of MCP methylation  30.77 
 
 
205 aa  40.8  0.007  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0231538  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1206  inhibitor of MCP methylation, CheC-like  24.58 
 
 
152 aa  40.4  0.009  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.333742  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>